Move read_tps_conf() to confio.h
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / gmxana / gmx_make_edi.c
index 2564b156dc802ecb1cf70c18773c3ba3ea1f06ed..e33ddc7eead7e42dd8bd4a22a1b5e97462e1ddc5 100644 (file)
@@ -46,7 +46,6 @@
 #include "gromacs/commandline/pargs.h"
 #include "gromacs/fileio/confio.h"
 #include "gromacs/fileio/pdbio.h"
-#include "gromacs/fileio/tpxio.h"
 #include "gromacs/fileio/xvgr.h"
 #include "gromacs/gmxana/eigio.h"
 #include "gromacs/legacyheaders/macros.h"
@@ -628,10 +627,11 @@ int gmx_make_edi(int argc, char *argv[])
         "[BB]Note[bb] that you can impose multiple ED constraints and flooding potentials in",
         "a single simulation (on different molecules) if several [REF].edi[ref] files were concatenated",
         "first. The constraints are applied in the order they appear in the [REF].edi[ref] file. ",
-        "Depending on what was specified in the [REF].edi[ref] input file, the output file contains for each ED dataset[PAR]",
-        "[TT]*[tt] the RMSD of the fitted molecule to the reference structure (for atoms involved in fitting prior to calculating the ED constraints)[BR]",
-        "[TT]*[tt] projections of the positions onto selected eigenvectors[BR]",
-        "[PAR][PAR]",
+        "Depending on what was specified in the [REF].edi[ref] input file, the output file contains for each ED dataset",
+        "",
+        " * the RMSD of the fitted molecule to the reference structure (for atoms involved in fitting prior to calculating the ED constraints)",
+        " * projections of the positions onto selected eigenvectors",
+        "",
         "FLOODING:[PAR]",
         "with [TT]-flood[tt], you can specify which eigenvectors are used to compute a flooding potential,",
         "which will lead to extra forces expelling the structure out of the region described",