- probably working V
[alexxy/gromacs-colorvec.git] / src / colorvec.cpp
index c138debb42e846da12ff787dcff18a31dbe34825..9efce99c5c67506f82ac9008c1d38e52bbf23e86 100644 (file)
@@ -482,19 +482,12 @@ colorVec::analyzeFrame(int frnr, const t_trxframe &fr, t_pbc *pbc, gmx::Trajecto
     std::vector< std::vector< double > > colorsToBetaAngles;
     colorsToBetaAngles.resize(0);
     std::vector< gmx::RVec > betaListsRVecs;
-    std::cout << "\n\ntest001\n";
     betaListsRVecsEvaluation(trajectoryFrame, betaLists[frnr], betaListsRVecs, indexCA);
-    std::cout << "\n\ntest002\n";
-
-    std::cout << aminoacidsIndex.size();
-
-
     for (size_t i = 0; i < colorsToPeptide.size(); ++i) {
         if (colorsToPeptide[i]) {
             searchNearBetaLists(trajectoryFrame, betaLists[frnr], colorsNames[i], colorsToBeta[i], aminoacidsIndex, effRad * 9000);
         }
     }
-    std::cout << "\n\ntest003\n";
     for (size_t i = 0; i < colorsToBeta.size(); ++i) {
         for (size_t j = 0; j < colorsToBeta[i].size(); ++j) {
             if (colorsToBeta[i][j]) {
@@ -502,9 +495,9 @@ colorVec::analyzeFrame(int frnr, const t_trxframe &fr, t_pbc *pbc, gmx::Trajecto
             }
         }
     }
-    std::cout << "\n\ntest004\n";
     // вывод в файл(ы) информацию для фрейма
     anglesFileDump(frnr, fnOut, colorsToPeptide, colorFormation);
+    std::cout << std::endl << "frame number " << frnr;
 }
 
 void