NZ C 1 180.000 33.472 2
NE C 1 180.000 33.472 2
NE CH2 1 180.000 0.418 6
-; two dihedral potentials are needed over a P-OA or P-OS bond,
-; put the parameters in your topology manually
-; P OA 1 0.000 1.046 3
-; P OA 1 0.000 3.138 2
+ P OA 1 0.000 1.046 3
+ P OA 1 0.000 3.138 2
OS CH2 1 0.000 3.766 3
-; OS P 1 0.000 1.046 3
-; OS P 1 0.000 3.138 2
+ OS P 1 0.000 1.046 3
+ OS P 1 0.000 3.138 2
CS1 OA 1 0.000 1.255 3
CS1 NR5* 1 0.000 0.000 2
CS1 CH2 1 0.000 5.858 3
CS1 OS 1 0.000 3.766 3
-; CS1 CS1 1 0.000 5.858 3
-; CS1 CS1 1 0.000 0.418 2
-; CS1 CS1 1 0.000 2.092 2
+ CS1 CS1 1 0.000 5.858 3
+ CS1 CS1 1 0.000 0.418 2
+ CS1 CS1 1 0.000 2.092 2
NR6 CB 1 180.000 33.472 2
NR6 CHE 1 180.000 33.472 2
NR6* CH2 1 0.000 0.418 6
NR6* CS1 1 0.000 0.000 2
CS2 OA 1 0.000 1.255 3
CS2 OS 1 0.000 3.766 3
-; CS2 CS1 1 0.000 5.858 3
-; CS2 CS1 1 0.000 0.418 2
-; CS2 CS1 1 0.000 2.092 2
+ CS2 CS1 1 0.000 5.858 3
+ CS2 CS1 1 0.000 0.418 2
+ CS2 CS1 1 0.000 2.092 2
SI CH1 1 0.000 5.858 3
SI OS 1 0.000 3.766 3
C CP2 1 0.000 0.418 6