Removed the deprecated gmx.ff and gmx2.ff.
[alexxy/gromacs.git] / manual / special.tex
index 621b9a2d4de7b8b662a3fed959ccd7edb129710a..ce495bf6e5165a8cccb9a42592cefc4d18478a3b 100644 (file)
@@ -2005,7 +2005,7 @@ Adaptive water
 SOL    8507
 \end{verbatim}}
 The $\sigma$ and $\epsilon$ values correspond to $C_6=1$ and $C_{12}=1$ and thus the table file should contain the coarse-grained interaction in either the $C_6$ or $C_{12}$ column. In the example the OPLS force field is used where $\sigma$ and $\epsilon$ are specified.
-Note that for force fields which define atomtypes directly in terms of $C_6$ and $C_{12}$ ( like {\tt gmx.ff} ) one can simply set $C_6=0$ and $C_{12}=1$. See section \ssecref{userpot} for more details on tabulated interactions. Since now the water molecule has a virtual site the coordinate file also needs to include that.
+Note that for force fields which define atomtypes directly in terms of $C_6$ and $C_{12}$ ( like {\tt gromos43a1.ff} ) one can simply set $C_6=0$ and $C_{12}=1$. See section \ssecref{userpot} for more details on tabulated interactions. Since now the water molecule has a virtual site the coordinate file also needs to include that.
 {\small
 \begin{verbatim}
 adaptive water coordinates