Release 4.5.6
[alexxy/gromacs.git] / man / man1 / genbox.1
index c573dbf155bc1f118aab20c43ab8ccb12f37858e..4a979b078acf415eec90d9b2560bad1fe5e47f91 100644 (file)
@@ -1,8 +1,8 @@
-.TH genbox 1 "Mon 4 Apr 2011" "" "GROMACS suite, VERSION 4.5.4-dev-20110404-bc5695c"
+.TH genbox 1 "Fri 18 Jan 2013" "" "GROMACS suite, VERSION 4.5.6"
 .SH NAME
 genbox - solvates a system
 
-.B VERSION 4.5.4-dev-20110404-bc5695c
+.B VERSION 4.5.6
 .SH SYNOPSIS
 \f3genbox\fP
 .BI "\-cp" " protein.gro "
@@ -132,28 +132,28 @@ genbox - solvates a system
  Set the nicelevel
 
 .BI "\-box"  " vector" " 0 0 0" 
box size
Box size
 
 .BI "\-nmol"  " int" " 0" 
no of extra molecules to insert
Number of extra molecules to insert
 
 .BI "\-try"  " int" " 10" 
try inserting \fB \-nmol\fR times \fB \-try\fR times
Try inserting \fB \-nmol\fR times \fB \-try\fR times
 
 .BI "\-seed"  " int" " 1997" 
random generator seed
Random generator seed
 
 .BI "\-vdwd"  " real" " 0.105 " 
default vdwaals distance
Default van der Waals distance
 
 .BI "\-shell"  " real" " 0     " 
thickness of optional water layer around solute
Thickness of optional water layer around solute
 
 .BI "\-maxsol"  " int" " 0" 
maximum number of solvent molecules to add if they fit in the box. If zero (default) this is ignored
Maximum number of solvent molecules to add if they fit in the box. If zero (default) this is ignored
 
 .BI "\-[no]vel"  "no    "
keep velocities from input solute and solvent
Keep velocities from input solute and solvent
 
 .SH KNOWN PROBLEMS
 \- Molecules must be whole in the initial configurations.