src/testutils/xvgtest.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2015, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * Implements routine to check the content of xvg files.
  38  *
  39  * \author David van der Spoel <david.vanderspoel@icm.uu.se>
  40  * \ingroup module_testutils
  41  */
  42 #include "gmxpre.h"
  43
  44 #include "xvgtest.h"
  45
  46 #include <cerrno>
  47 #include <cstdlib>
  48
  49 #include <vector>
  50
  51 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
  52 #include "gromacs/utility/stringutil.h"
  53 #include "gromacs/utility/textstream.h"
  54
  55 #include "testutils/refdata.h"
  56 #include "testutils/testasserts.h"
  57
  58 namespace gmx
  59 {
  60
  61 namespace test
  62 {
  63
  64 void checkXvgFile(TextInputStream      *input,
  65                   TestReferenceChecker *checker)
  66 {
  67     std::string line;
  68     int         nrow = 0;
  69
  70     while (input->readLine(&line))
  71     {
  72         if (!((line.find("#") != line.npos) ||
  73               (line.find("@") != line.npos)))
  74         {
  75             std::vector<std::string> split = splitString(line);
  76             std::vector<real>        row;
  77
  78             for (std::vector<std::string>::iterator si = split.begin();
  79                  (si < split.end()); ++si)
  80             {
  81                 const char *ptr = si->c_str();
  82                 char       *endptr;
  83                 errno = 0;
  84                 double      dval = std::strtod(ptr, &endptr);
  85                 if (errno == ERANGE)
  86                 {
  87                     GMX_THROW(InvalidInputError("Invalid value: '" + *si
  88                                                 + "'; it causes an overflow/underflow"));
  89                 }
  90                 if (*ptr == '\0' || *endptr != '\0')
  91                 {
  92                     GMX_THROW(InvalidInputError("Invalid value: '" + *si
  93                                                 + "'; expected a number"));
  94                 }
  95                 row.push_back(dval);
  96             }
  97             std::string buf = formatString("Row%d", nrow++);
  98             checker->checkSequence(row.begin(), row.end(), buf.c_str());
  99         }
 100     }
 101     std::string buf = formatString("Row%d", nrow++);
 102     checker->checkPresent(false, buf.c_str());
 103 }
 104
 105 } // namespace test
 106
 107 } // namespace gmx