src/testutils/tests/xvgtest_tests.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2015,2016,2019,2020, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * Tests utilities for testing xvg files
  38  *
  39  * \author David van der Spoel <david.vanderspoel@icm.uu.se>
  40  * \ingroup module_testutils
  41  */
  42 #include "gmxpre.h"
  43
  44 #include "testutils/xvgtest.h"
  45
  46 #include <vector>
  47
  48 #include <gtest/gtest.h>
  49 #include <gtest/gtest-spi.h>
  50
  51 #include "gromacs/utility/arrayref.h"
  52 #include "gromacs/utility/stringstream.h"
  53
  54 #include "testutils/refdata.h"
  55 #include "testutils/testasserts.h"
  56
  57 namespace gmx
  58 {
  59 namespace test
  60 {
  61 namespace
  62 {
  63
  64 //! Input testing data - an inline xvg file.
  65 const char* const input[] = { "0     2905.86    -410.199",   "0.2     6656.67    -430.437",
  66                               "0.4     5262.44    -409.399", "0.6     5994.69    -405.763",
  67                               "0.8     5941.37    -408.337", "1     5869.87    -411.124" };
  68
  69 TEST(XvgTests, CreateFile)
  70 {
  71     {
  72         // Create new data
  73         TestReferenceData    data(ReferenceDataMode::UpdateAll);
  74         TestReferenceChecker checker(data.rootChecker());
  75         // Convert char array to a stream and add it to the checker
  76         gmx::StringInputStream sis(input);
  77         checkXvgFile(&sis, &checker, XvgMatchSettings());
  78     }
  79     {
  80         // Now read it back
  81         TestReferenceData    data(ReferenceDataMode::Compare);
  82         TestReferenceChecker checker(data.rootChecker());
  83         // Convert char array to a stream and add it to the checker
  84         gmx::StringInputStream sis(input);
  85         checkXvgFile(&sis, &checker, XvgMatchSettings());
  86     }
  87 }
  88
  89 TEST(XvgTests, CheckMissing)
  90 {
  91     {
  92         // Create new data
  93         TestReferenceData    data(ReferenceDataMode::UpdateAll);
  94         TestReferenceChecker checker(data.rootChecker());
  95         // Convert char array to a stream and add it to the checker
  96         gmx::StringInputStream sis(input);
  97         checkXvgFile(&sis, &checker, XvgMatchSettings());
  98     }
  99     {
 100         const char* const input[] = { "0     2905.86    -410.199",
 101                                       "0.2     6656.67    -430.437",
 102                                       "0.4     5262.44    -409.399" };
 103         // Now check with missing data
 104         TestReferenceData      data(ReferenceDataMode::Compare);
 105         TestReferenceChecker   checker(data.rootChecker());
 106         gmx::StringInputStream sis(input);
 107         EXPECT_NONFATAL_FAILURE(checkXvgFile(&sis, &checker, XvgMatchSettings()),
 108                                 "not used in test");
 109     }
 110 }
 111
 112 TEST(XvgTests, CheckExtra)
 113 {
 114     {
 115         // Create new data
 116         TestReferenceData    data(ReferenceDataMode::UpdateAll);
 117         TestReferenceChecker checker(data.rootChecker());
 118         // Convert char array to a stream and add it to the checker
 119         gmx::StringInputStream sis(input);
 120         checkXvgFile(&sis, &checker, XvgMatchSettings());
 121     }
 122     {
 123         const char* const input[] = { "0     2905.86    -410.199",   "0.2     6656.67    -430.437",
 124                                       "0.4     5262.44    -409.399", "0.6     5994.69    -405.763",
 125                                       "0.8     5941.37    -408.337", "1     5869.87    -411.124",
 126                                       "1.2     5889.87    -413.124" };
 127         // Now check with missing data
 128         TestReferenceData      data(ReferenceDataMode::Compare);
 129         TestReferenceChecker   checker(data.rootChecker());
 130         gmx::StringInputStream sis(input);
 131         EXPECT_NONFATAL_FAILURE(checkXvgFile(&sis, &checker, XvgMatchSettings()), "Row6");
 132     }
 133 }
 134
 135 TEST(XvgTests, ReadIncorrect)
 136 {
 137     {
 138         // Create new data
 139         TestReferenceData    data(ReferenceDataMode::UpdateAll);
 140         TestReferenceChecker checker(data.rootChecker());
 141         // Convert char array to a stream and add it to the checker
 142         gmx::StringInputStream sis(input);
 143         checkXvgFile(&sis, &checker, XvgMatchSettings());
 144     }
 145     {
 146         const char* const input[] = { "0     2905.86    -410.199",   "0.2     6656.67    -430.437",
 147                                       "0.4     5262.44    -409.399", "0.6     5994.69    -405.763",
 148                                       "0.8     5941.37    -408.337", "1     5869.87    -421.124" };
 149         // Now check with incorrect data
 150         TestReferenceData      data(ReferenceDataMode::Compare);
 151         TestReferenceChecker   checker(data.rootChecker());
 152         gmx::StringInputStream sis(input);
 153         EXPECT_NONFATAL_FAILURE(checkXvgFile(&sis, &checker, XvgMatchSettings()), "-411");
 154     }
 155 }
 156
 157 } // namespace
 158 } // namespace test
 159 } // namespace gmx