src/python/include/numpy_conv.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2014, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35
  36 #ifndef NUMPY_CONV_H
  37 #define NUMPY_CONV_H
  38
  39 #include <Python.h>
  40 #include <numpy/ndarrayobject.h>
  41
  42 PyObject* array2dToNumpy(int dim1, int dim2, const void *data) {
  43     npy_intp dims[] = {dim1, dim2};
  44     #ifdef GMX_DOUBLE
  45         return PyArray_SimpleNewFromData(2, dims, NPY_DOUBLE, (double*) data);
  46     #else
  47         return PyArray_SimpleNewFromData(2, dims, NPY_FLOAT, (float*) data);
  48     #endif
  49 }
  50
  51 PyObject* array1dToNumpy(int dim, const void *data) {
  52     npy_intp n_dim = dim;
  53     #ifdef GMX_DOUBLE
  54         return PyArray_SimpleNewFromData(1, &n_dim, NPY_DOUBLE, (double*) data);
  55     #else
  56         return PyArray_SimpleNewFromData(1, &n_dim, NPY_FLOAT, (float*) data);
  57     #endif
  58 }
  59
  60 PyObject* iarray1dToNumpy(int dim, const int *data) {
  61     npy_intp n_dim = dim;
  62     return PyArray_SimpleNewFromData(1, &n_dim, NPY_INT, (int*) data);
  63 }
  64 #endif