src/programs/mdrun/tests/compressed_x_output.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2014, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35
  36 /*! \internal \file
  37  * \brief
  38  * Tests for the mdrun -x functionality
  39  *
  40  * \author Mark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
  41  * \ingroup module_mdrun
  42  */
  43 #include "moduletest.h"
  44 #include <gtest/gtest.h>
  45 #include <string>
  46 #include "gromacs/options/filenameoption.h"
  47 #include "gromacs/tools/check.h"
  48 #include "testutils/cmdlinetest.h"
  49
  50 namespace
  51 {
  52
  53 //! Test fixture for mdrun -x
  54 class CompressedXOutputTest : public gmx::test::MdrunTestFixture,
  55                               public testing::WithParamInterface<const char*>
  56 {
  57 };
  58
  59 /* Among other things, this test ensures mdrun can write a compressed trajectory. */
  60 TEST_P(CompressedXOutputTest, ExitsNormally)
  61 {
  62     std::string mdpFile("cutoff-scheme = Group\n"
  63                         "nsteps = 1\n"
  64                         "nstxout-compressed = 1\n");
  65     mdpFile += GetParam();
  66     useStringAsMdpFile(mdpFile.c_str());
  67     useTopGroAndNdxFromDatabase("spc2");
  68     ASSERT_EQ(0, callGrompp());
  69
  70     reducedPrecisionTrajectoryFileName = fileManager_.getTemporaryFilePath(".xtc");
  71     ASSERT_EQ(0, callMdrun());
  72
  73     ::gmx::test::CommandLine checkCaller;
  74     checkCaller.append("check");
  75     checkCaller.addOption("-f", reducedPrecisionTrajectoryFileName);
  76     ASSERT_EQ(0, gmx_check(checkCaller.argc(), checkCaller.argv()));
  77 }
  78
  79 #ifdef __INTEL_COMPILER
  80 /* If we learn why this invocation triggers the "declared but not
  81    referenced" warning with ICC 12 on Windows and the case in
  82    gromacs/fft/tests/fft.cpp does not, then we can consider a more
  83    general solution. The pragma works also on MSVC, but so far is not
  84    required. */
  85 #pragma warning( disable : 177 )
  86 #endif
  87
  88 INSTANTIATE_TEST_CASE_P(WithDifferentMdpOptions, CompressedXOutputTest,
  89                             ::testing::Values
  90                             ( // Test writing the whole system via
  91                               // the default behaviour
  92                             "",
  93
  94                             // Test writing the whole system
  95                             // explicitly
  96                             "compressed-x-grps = System\n",
  97
  98                             // Test writing only part of the system.
  99                             // It would be nice to check that this test
 100                             // writes 3 atoms and the others write 6, but
 101                             // that's not yet easy.
 102                             "compressed-x-grps = SecondWaterMolecule\n"
 103                             ));
 104
 105 } // namespace