src/programs/mdrun/resource-division.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2015, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35
  36 #ifndef GMX_RESOURCE_DIVISION_H
  37 #define GMX_RESOURCE_DIVISION_H
  38
  39 #include "gromacs/legacyheaders/typedefs.h"
  40 #include "gromacs/legacyheaders/types/commrec_fwd.h"
  41
  42 /* Return the number of threads to use for thread-MPI based on how many
  43  * were requested, which algorithms we're using,
  44  * and how many particles there are.
  45  * At the point we have already called check_and_update_hw_opt.
  46  * Thus all options should be internally consistent and consistent
  47  * with the hardware, except that ntmpi could be larger than #GPU.
  48  * If necessary, this function will modify hw_opt->nthreads_omp.
  49  */
  50 int get_nthreads_mpi(const gmx_hw_info_t *hwinfo,
  51                      gmx_hw_opt_t        *hw_opt,
  52                      const t_inputrec    *inputrec,
  53                      const gmx_mtop_t    *mtop,
  54                      const t_commrec     *cr,
  55                      FILE                *fplog);
  56
  57 /* Check if the number of OpenMP threads is within reasonable range
  58  * considering the hardware used. This is a crude check, but mainly
  59  * intended to catch cases where the user starts 1 MPI rank per hardware
  60  * thread or 1 rank per physical node.
  61  * With a sub-optimal setup a note is printed to fplog and stderr when
  62  * bNtOmpSet==TRUE; with bNtOptOptionSet==FALSE a fatal error is issued.
  63  * This function should be called after thread-MPI and OpenMP are set up.
  64  */
  65 void check_resource_division_efficiency(const gmx_hw_info_t *hwinfo,
  66                                         const gmx_hw_opt_t  *hw_opt,
  67                                         gmx_bool             bNtOmpOptionSet,
  68                                         t_commrec           *cr,
  69                                         FILE                *fplog);
  70
  71 /* Checks we can do when we don't (yet) know the cut-off scheme */
  72 void check_and_update_hw_opt_1(gmx_hw_opt_t *hw_opt,
  73                                gmx_bool      bIsSimMaster);
  74
  75 /* Checks we can do when we know the cut-off scheme */
  76 void check_and_update_hw_opt_2(gmx_hw_opt_t *hw_opt,
  77                                int           cutoff_scheme);
  78
  79 #endif /* GMX_RESOURCE_DIVISION_H */