Merge release-4-6 into master
[alexxy/gromacs.git] / src / programs / mdrun / membed.h
1 /*
2  *
3  *                This source code is part of
4  *
5  *                 G   R   O   M   A   C   S
6  *
7  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
8  *
9  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
10  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
11  * Copyright (c) 2001-2012, The GROMACS development team,
12  * check out http://www.gromacs.org for more information.
13
14  * This program is free software; you can redistribute it and/or
15  * modify it under the terms of the GNU General Public License
16  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
17  * of the License, or (at your option) any later version.
18  *
19  * If you want to redistribute modifications, please consider that
20  * scientific software is very special. Version control is crucial -
21  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
22  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
23  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
24  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
25  *
26  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
27  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
28  *
29  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
30  *
31  * And Hey:
32  * Gromacs Runs On Most of All Computer Systems
33  */
34
35 #ifndef _gmx_membed_h
36 #define _gmx_membed_h
37
38 #include "typedefs.h"
39 #include "types/membedt.h"
40
41 #ifdef __cplusplus
42 extern "C" {
43 #endif
44
45 /* initialisation of membed code */
46 gmx_membed_t init_membed(FILE *fplog, int nfile, const t_filenm fnm[], gmx_mtop_t *mtop,
47                          t_inputrec *inputrec, t_state *state, t_commrec *cr, real *cpt);
48
49 /* rescaling the coordinates voor de membed code */
50 void rescale_membed(int step_rel, gmx_membed_t membed, rvec *x);
51
52 #ifdef __cplusplus
53 }
54 #endif
55
56 #endif