Fixing copyright issues and code contributors
[alexxy/gromacs.git] / src / ngmx / nmol.h
1 /*
2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3  *
4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
6  * check out http://www.gromacs.org for more information.
7  * Copyright (c) 2012,2013, by the GROMACS development team, led by
8  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
9  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
10  * directory and at http://www.gromacs.org.
11  *
12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
15  * of the License, or (at your option) any later version.
16  *
17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
20  * Lesser General Public License for more details.
21  *
22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
23  * License along with GROMACS; if not, see
24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
26  *
27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
28  * consider that scientific software is very special. Version
29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
33  * official version at http://www.gromacs.org.
34  *
35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
37  */
38
39 #ifndef _nmol_h
40 #define _nmol_h
41
42 #include "x11.h"
43 #include "xutil.h"
44
45 extern t_molwin *init_mw(t_x11 *x11,Window Parent,
46                          int x,int y,int width,int height,
47                          unsigned long fg,unsigned long bg,
48                          int ePBC,matrix box);
49 /* Create the molecule window using the x,y etc. */
50
51 extern void map_mw(t_x11 *x11,t_molwin *mw);
52
53 extern void z_fill(t_manager *man, real *zz);
54 extern void create_visibility(t_manager *man);
55 extern int  compare_obj(const void *a,const void *b);
56 extern int  filter_vis(t_manager *man);
57 extern void set_sizes(t_manager *man,real sx,real sy);
58
59 extern gmx_bool toggle_hydrogen(t_x11 *x11,t_molwin *mw);
60 /* Toggle the state of the hydrogen drawing,
61  * return the current state
62  */
63
64 extern void set_bond_type(t_x11 *x11,t_molwin *mw,int bt);
65 /* Set the state of the atoms drawing. */
66
67 extern void set_box_type (t_x11 *x11,t_molwin *mw,int bt);
68 /* Set the type of box or none (bt = 0)
69  */
70
71 extern void done_mw(t_x11 *x11,t_molwin *mw);
72
73 #endif  /* _nmol_h */