src/mdlib/nbnxn_kernels/nbnxn_kernel_common.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
   6  * check out http://www.gromacs.org for more information.
   7  * Copyright (c) 2012,2013, by the GROMACS development team, led by
   8  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
   9  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
  10  * directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38
  39 #ifndef _nbnxn_kernel_common_h
  40 #define _nbnxn_kernel_common_h
  41
  42 #include "typedefs.h"
  43
  44 #ifdef __cplusplus
  45 extern "C" {
  46 #endif
  47 #if 0
  48 }
  49 #endif
  50
  51 /* Clear the force buffer f. Either the whole buffer or only the parts
  52  * used by the current thread when nbat->bUseBufferFlags is set.
  53  * In the latter case output_index is the task/thread list/buffer index.
  54  */
  55 void
  56 clear_f(const nbnxn_atomdata_t *nbat,int output_index,real *f);
  57
  58 /* Clear the shift forces */
  59 void
  60 clear_fshift(real *fshift);
  61
  62 /* Reduce the collected energy terms over the pair-lists/threads */
  63 void
  64 reduce_energies_over_lists(const nbnxn_atomdata_t     *nbat,
  65                            int                        nlist,
  66                            real                       *Vvdw,
  67                            real                       *Vc);
  68
  69 #if 0
  70 {
  71 #endif
  72 #ifdef __cplusplus
  73 }
  74 #endif
  75
  76 #endif