added Verlet scheme and NxN non-bonded functionality
[alexxy/gromacs.git] / src / mdlib / nbnxn_kernels / nbnxn_kernel_common.c
1 /* -*- mode: c; tab-width: 4; indent-tabs-mode: nil; c-basic-offset: 4; c-file-style: "stroustrup"; -*-
2  *
3  *
4  *                This source code is part of
5  *
6  *                 G   R   O   M   A   C   S
7  *
8  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
9  * Copyright (c) 2001-2009, The GROMACS Development Team
10  *
11  * Gromacs is a library for molecular simulation and trajectory analysis,
12  * written by Erik Lindahl, David van der Spoel, Berk Hess, and others - for
13  * a full list of developers and information, check out http://www.gromacs.org
14  *
15  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify it under
16  * the terms of the GNU Lesser General Public License as published by the Free
17  * Software Foundation; either version 2 of the License, or (at your option) any
18  * later version.
19  * As a special exception, you may use this file as part of a free software
20  * library without restriction.  Specifically, if other files instantiate
21  * templates or use macros or inline functions from this file, or you compile
22  * this file and link it with other files to produce an executable, this
23  * file does not by itself cause the resulting executable to be covered by
24  * the GNU Lesser General Public License.
25  *
26  * In plain-speak: do not worry about classes/macros/templates either - only
27  * changes to the library have to be LGPL, not an application linking with it.
28  *
29  * To help fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
30  * the papers people have written on it - you can find them on the website!
31  */
32 #ifdef HAVE_CONFIG_H
33 #include <config.h>
34 #endif
35
36 #include "nbnxn_kernel_common.h"
37
38 void
39 clear_f(const nbnxn_atomdata_t *nbat,real *f)
40 {
41     int i;
42
43     for(i=0; i<nbat->natoms*nbat->fstride; i++)
44     {
45         f[i] = 0;
46     }
47 }
48
49 void
50 clear_fshift(real *fshift)
51 {
52     int i;
53
54     for(i=0; i<SHIFTS*DIM; i++)
55     {
56         fshift[i] = 0;
57     }
58 }
59