src/kernel/vsite_parm.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
   6  * check out http://www.gromacs.org for more information.
   7  * Copyright (c) 2012,2013, by the GROMACS development team, led by
   8  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
   9  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
  10  * directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38
  39 #ifndef _vsite_parm_h
  40 #define _vsite_parm_h
  41 #include "visibility.h"
  42 #include "typedefs.h"
  43 #include "grompp.h"
  44 #include "gpp_atomtype.h"
  45
  46 GMX_LIBGMXPREPROCESS_EXPORT
  47 extern int set_vsites(gmx_bool bVerbose, t_atoms *atoms,  gpp_atomtype_t atype,
  48                       t_params plist[]);
  49 /* set parameters for vritual sites, return number of virtual sites */
  50
  51 GMX_LIBGMXPREPROCESS_EXPORT
  52 extern void set_vsites_ptype(gmx_bool bVerbose,  gmx_moltype_t *molt);
  53 /* set ptype to VSite for virtual sites */
  54
  55 GMX_LIBGMXPREPROCESS_EXPORT
  56 extern void clean_vsite_bondeds(t_params *ps, int natoms, gmx_bool bRmVSiteBds);
  57 /* remove all bonded interaction (bonds, angles and diherals) that
  58    have become obsolete due to virtual site constructions */
  59
  60 #endif  /* _vsite_parm_h */