src/kernel/md_openmm.h

   1 /* -*- mode: c; tab-width: 4; indent-tabs-mode: nil; c-basic-offset: 4; c-file-style: "stroustrup"; -*-
   2  *
   3  *
   4  *                This source code is part of
   5  *
   6  *                 G   R   O   M   A   C   S
   7  *
   8  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   9  *
  10  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
  11  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
  12  * Copyright (c) 2001-2010, The GROMACS development team,
  13  * check out http://www.gromacs.org for more information.
  14
  15  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  16  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  17  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  18  * of the License, or (at your option) any later version.
  19  *
  20  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  21  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  22  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  23  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  24  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  25  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  26  *
  27  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  28  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  29  *
  30  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
  31  *
  32  * And Hey:
  33  * Gallium Rubidium Oxygen Manganese Argon Carbon Silicon
  34  */
  35 #ifndef _MD_OPENMM_H
  36 #define _MD_OPENMM_H
  37
  38 double do_md_openmm(FILE *fplog,t_commrec *cr,int nfile,const t_filenm fnm[],
  39              const output_env_t oenv, gmx_bool bVerbose,gmx_bool bCompact,
  40              int nstglobalcomm,
  41              gmx_vsite_t *vsite,gmx_constr_t constr,
  42              int stepout,t_inputrec *ir,
  43              gmx_mtop_t *top_global,
  44              t_fcdata *fcd,
  45              t_state *state_global,
  46              t_mdatoms *mdatoms,
  47              t_nrnb *nrnb,gmx_wallcycle_t wcycle,
  48              gmx_edsam_t ed,t_forcerec *fr,
  49              int repl_ex_nst, int repl_ex_nex, int repl_ex_seed,
  50              gmx_membed_t membed,
  51              real cpt_period,real max_hours,
  52              const char *deviceOptions,
  53              unsigned long Flags,
  54              gmx_runtime_t *runtime);
  55
  56 #endif /* _MD_OPENMM_H */