src/kernel/gpp_bond_atomtype.c

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
   6  * check out http://www.gromacs.org for more information.
   7  * Copyright (c) 2012, by the GROMACS development team, led by
   8  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
   9  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
  10  * directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  39 #include <config.h>
  40 #endif
  41
  42 #include "smalloc.h"
  43 #include "sysstuff.h"
  44 #include "macros.h"
  45 #include "symtab.h"
  46 #include "string2.h"
  47 #include "gpp_bond_atomtype.h"
  48
  49 typedef struct {
  50   int           nr;             /* The number of atomtypes              */
  51   char          ***atomname;    /* Names of the atomtypes               */
  52 } gpp_bond_atomtype;
  53
  54 int get_bond_atomtype_type(char *str,t_bond_atomtype at)
  55 {
  56   gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) at;
  57
  58   int i;
  59
  60   for (i=0; (i<ga->nr); i++)
  61     if (gmx_strcasecmp(str,*(ga->atomname[i])) == 0)
  62       return i;
  63
  64   return NOTSET;
  65 }
  66
  67 char *get_bond_atomtype_name(int nt, t_bond_atomtype at)
  68 {
  69   gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) at;
  70
  71   if ((nt < 0) || (nt >= ga->nr))
  72     return NULL;
  73
  74   return *(ga->atomname[nt]);
  75 }
  76
  77 t_bond_atomtype init_bond_atomtype(void)
  78 {
  79   gpp_bond_atomtype *ga;
  80
  81   snew(ga,1);
  82
  83   return (t_bond_atomtype ) ga;
  84 }
  85
  86 void add_bond_atomtype(t_bond_atomtype at,t_symtab *tab,
  87                        char *name)
  88 {
  89   gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) at;
  90
  91   ga->nr++;
  92   srenew(ga->atomname,ga->nr);
  93   ga->atomname[ga->nr-1] = put_symtab(tab,name);
  94 }
  95
  96 void done_bond_atomtype(t_bond_atomtype *at)
  97 {
  98   gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) *at;
  99
 100   sfree(ga->atomname);
 101   ga->nr = 0;
 102   sfree(ga);
 103
 104   *at = NULL;
 105 }