src/kernel/add_par.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
   6  * check out http://www.gromacs.org for more information.
   7  * Copyright (c) 2012, by the GROMACS development team, led by
   8  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
   9  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
  10  * directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38
  39 #ifndef _add_par_h
  40 #define _add_par_h
  41
  42 #include "typedefs.h"
  43 #include "pdb2top.h"
  44
  45 extern void add_param(t_params *ps, int ai, int aj, real *c, char *s);
  46
  47 extern void add_imp_param(t_params *ps, int ai, int aj, int ak, int al,
  48                           real c0, real c1, char *s);
  49
  50 extern void add_dih_param(t_params *ps,int ai,int aj,int ak,int al,
  51                           real c0, real c1, real c2, char *s);
  52
  53 extern void add_cmap_param(t_params *ps,int ai,int aj,int ak,int al,int am,
  54                                                    char *s);
  55
  56 extern void add_vsite2_atoms(t_params *ps, int ai, int aj, int ak);
  57
  58 extern void add_vsite3_atoms(t_params *ps, int ai, int aj, int ak, int al,
  59                            gmx_bool bSwapParity);
  60
  61 extern void add_vsite2_param(t_params *ps, int ai, int aj, int ak, real c0);
  62
  63 extern void add_vsite3_param(t_params *ps, int ai, int aj, int ak, int al,
  64                            real c0, real c1);
  65
  66 extern void add_vsite4_atoms(t_params *ps, int ai, int aj, int ak, int al,
  67                            int am);
  68
  69 extern int search_jtype(t_restp *rp,char *name,gmx_bool bFirstRes);
  70
  71 #endif  /* _add_par_h */