src/gromacs/utility/stringutil.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2011,2012,2013,2014,2015,2016,2017,2018, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * Implements functions and classes in stringutil.h.
  38  *
  39  * \author Teemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
  40  * \ingroup module_utility
  41  */
  42 #include "gmxpre.h"
  43
  44 #include "stringutil.h"
  45
  46 #include <cctype>
  47 #include <cstdarg>
  48 #include <cstdio>
  49 #include <cstring>
  50
  51 #include <algorithm>
  52 #include <sstream>
  53 #include <string>
  54 #include <vector>
  55
  56 #include "gromacs/utility/exceptions.h"
  57 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
  58
  59 namespace gmx
  60 {
  61
  62 std::size_t
  63 countWords(const char *s)
  64 {
  65     std::size_t nWords = 0;
  66     // Use length variable to avoid N^2 complexity when executing strlen(s) every iteration
  67     std::size_t length = std::strlen(s);
  68
  69     for (std::size_t i = 0; i < length; i++)
  70     {
  71         // If we found a new word, increase counter and step through the word
  72         if (std::isalnum(s[i]))
  73         {
  74             ++nWords;
  75             // If we hit string end, '\0' is not alphanumerical
  76             while (std::isalnum(s[i]))
  77             {
  78                 // This might increment i to the string end, and then the outer
  79                 // loop will increment i one unit beyond that, but since
  80                 // we compare to the string length in the outer loop this is fine.
  81                 i++;
  82             }
  83         }
  84     }
  85     return nWords;
  86 }
  87
  88
  89 std::size_t
  90 countWords(const std::string &str)
  91 {
  92     // Under out beautiful C++ interface hides an ugly c-string implementation :-)
  93     return countWords(str.c_str());
  94 }
  95
  96 bool endsWith(const char *str, const char *suffix)
  97 {
  98     if (isNullOrEmpty(suffix))
  99     {
 100         return true;
 101     }
 102     const size_t strLength    = std::strlen(str);
 103     const size_t suffixLength = std::strlen(suffix);
 104     return (strLength >= suffixLength
 105             && std::strcmp(&str[strLength - suffixLength], suffix) == 0);
 106 }
 107
 108 std::string stripSuffixIfPresent(const std::string &str, const char *suffix)
 109 {
 110     if (suffix != nullptr)
 111     {
 112         size_t suffixLength = std::strlen(suffix);
 113         if (suffixLength > 0 && endsWith(str, suffix))
 114         {
 115             return str.substr(0, str.length() - suffixLength);
 116         }
 117     }
 118     return str;
 119 }
 120
 121 std::string stripString(const std::string &str)
 122 {
 123     std::string::const_iterator start = str.begin();
 124     std::string::const_iterator end   = str.end();
 125     while (start != end && std::isspace(*start))
 126     {
 127         ++start;
 128     }
 129     while (start != end && std::isspace(*(end - 1)))
 130     {
 131         --end;
 132     }
 133     return std::string(start, end);
 134 }
 135
 136 std::string formatString(const char *fmt, ...)
 137 {
 138     va_list     ap;
 139     va_start(ap, fmt);
 140     std::string result = formatStringV(fmt, ap);
 141     va_end(ap);
 142     return result;
 143 }
 144
 145 std::string formatStringV(const char *fmt, va_list ap)
 146 {
 147     va_list           ap_copy;
 148     char              staticBuf[1024];
 149     int               length = 1024;
 150     std::vector<char> dynamicBuf;
 151     char             *buf = staticBuf;
 152
 153     // TODO: There may be a better way of doing this on Windows, Microsoft
 154     // provides their own way of doing things...
 155     while (true)
 156     {
 157         va_copy(ap_copy, ap);
 158         int n = vsnprintf(buf, length, fmt, ap_copy);
 159         va_end(ap_copy);
 160         if (n > -1 && n < length)
 161         {
 162             std::string result(buf);
 163             return result;
 164         }
 165         if (n > -1)
 166         {
 167             length = n + 1;
 168         }
 169         else
 170         {
 171             length *= 2;
 172         }
 173         dynamicBuf.resize(length);
 174         buf = dynamicBuf.data();
 175     }
 176 }
 177
 178 std::vector<std::string> splitString(const std::string &str)
 179 {
 180     std::vector<std::string>          result;
 181     std::string::const_iterator       currPos = str.begin();
 182     const std::string::const_iterator end     = str.end();
 183     while (currPos != end)
 184     {
 185         while (currPos != end && std::isspace(*currPos))
 186         {
 187             ++currPos;
 188         }
 189         const std::string::const_iterator startPos = currPos;
 190         while (currPos != end && !std::isspace(*currPos))
 191         {
 192             ++currPos;
 193         }
 194         if (startPos != end)
 195         {
 196             result.emplace_back(startPos, currPos);
 197         }
 198     }
 199     return result;
 200 }
 201
 202 std::vector<std::string> splitDelimitedString(const std::string &str, char delim)
 203 {
 204     std::vector<std::string> result;
 205     size_t                   currPos = 0;
 206     const size_t             len     = str.length();
 207     if (len > 0)
 208     {
 209         size_t nextDelim;
 210         do
 211         {
 212             nextDelim = str.find(delim, currPos);
 213             result.push_back(str.substr(currPos, nextDelim - currPos));
 214             currPos = nextDelim < len ? nextDelim + 1 : len;
 215         }
 216         while (currPos < len || nextDelim < len);
 217     }
 218     return result;
 219 }
 220
 221 std::vector<std::string> splitAndTrimDelimitedString(const std::string &str, char delim)
 222 {
 223     std::vector<std::string> result;
 224
 225     result = splitDelimitedString(str, delim);
 226     std::transform(result.begin(), result.end(), result.begin(), stripString);
 227     return result;
 228 }
 229
 230 namespace
 231 {
 232
 233 /*! \brief
 234  * Helper function to identify word boundaries for replaceAllWords().
 235  *
 236  * \returns  `true` if the character is considered part of a word.
 237  *
 238  * \ingroup module_utility
 239  */
 240 bool isWordChar(char c)
 241 {
 242     return (std::isalnum(c) != 0) || c == '-' || c == '_';
 243 }
 244
 245 /*! \brief
 246  * Common implementation for string replacement functions.
 247  *
 248  * \param[in] input  Input string.
 249  * \param[in] from   String to find.
 250  * \param[in] to     String to use to replace \p from.
 251  * \param[in] bWholeWords  Whether to only consider matches to whole words.
 252  * \returns   \p input with all occurrences of \p from replaced with \p to.
 253  * \throws    std::bad_alloc if out of memory.
 254  *
 255  * \ingroup module_utility
 256  */
 257 std::string
 258 replaceInternal(const std::string &input, const char *from, const char *to,
 259                 bool bWholeWords)
 260 {
 261     GMX_RELEASE_ASSERT(from != nullptr && to != nullptr,
 262                        "Replacement strings must not be NULL");
 263     size_t      matchLength = std::strlen(from);
 264     std::string result;
 265     size_t      inputPos = 0;
 266     size_t      matchPos = input.find(from);
 267     while (matchPos < input.length())
 268     {
 269         size_t matchEnd = matchPos + matchLength;
 270         if (bWholeWords)
 271         {
 272             if (!((matchPos == 0 || !isWordChar(input[matchPos-1]))
 273                   && (matchEnd == input.length() || !isWordChar(input[matchEnd]))))
 274             {
 275                 matchPos = input.find(from, matchPos + 1);
 276                 continue;
 277             }
 278
 279         }
 280         result.append(input, inputPos, matchPos - inputPos);
 281         result.append(to);
 282         inputPos = matchEnd;
 283         matchPos = input.find(from, inputPos);
 284     }
 285     result.append(input, inputPos, matchPos - inputPos);
 286     return result;
 287 }
 288
 289 }   // namespace
 290
 291 std::string
 292 replaceAll(const std::string &input, const char *from, const char *to)
 293 {
 294     return replaceInternal(input, from, to, false);
 295 }
 296
 297 std::string
 298 replaceAll(const std::string &input, const std::string &from,
 299            const std::string &to)
 300 {
 301     return replaceInternal(input, from.c_str(), to.c_str(), false);
 302 }
 303
 304 std::string
 305 replaceAllWords(const std::string &input, const char *from, const char *to)
 306 {
 307     return replaceInternal(input, from, to, true);
 308 }
 309
 310 std::string
 311 replaceAllWords(const std::string &input, const std::string &from,
 312                 const std::string &to)
 313 {
 314     return replaceInternal(input, from.c_str(), to.c_str(), true);
 315 }
 316
 317
 318 /********************************************************************
 319  * TextLineWrapperSettings
 320  */
 321
 322 TextLineWrapperSettings::TextLineWrapperSettings()
 323     : maxLength_(0), indent_(0), firstLineIndent_(-1),
 324       bKeepFinalSpaces_(false), continuationChar_('\0')
 325 {
 326 }
 327
 328
 329 /********************************************************************
 330  * TextLineWrapper
 331  */
 332
 333 bool TextLineWrapper::isTrivial() const
 334 {
 335     return settings_.lineLength() == 0 && settings_.indent() == 0
 336            && settings_.firstLineIndent_ <= 0;
 337 }
 338
 339 size_t
 340 TextLineWrapper::findNextLine(const char *input, size_t lineStart) const
 341 {
 342     size_t inputLength = std::strlen(input);
 343     bool   bFirstLine  = (lineStart == 0 || input[lineStart - 1] == '\n');
 344     // Ignore leading whitespace if necessary.
 345     if (!bFirstLine)
 346     {
 347         lineStart += std::strspn(input + lineStart, " ");
 348         if (lineStart >= inputLength)
 349         {
 350             return inputLength;
 351         }
 352     }
 353
 354     int    indent = (bFirstLine ? settings_.firstLineIndent() : settings_.indent());
 355     size_t lastAllowedBreakPoint
 356         = (settings_.lineLength() > 0
 357            ? std::min(lineStart + settings_.lineLength() - indent, inputLength)
 358            : inputLength);
 359     // Ignore trailing whitespace.
 360     lastAllowedBreakPoint += std::strspn(input + lastAllowedBreakPoint, " ");
 361     size_t lineEnd = lineStart;
 362     do
 363     {
 364         const char *nextBreakPtr = std::strpbrk(input + lineEnd, " \n");
 365         size_t      nextBreak
 366             = (nextBreakPtr != nullptr ? nextBreakPtr - input : inputLength);
 367         if (nextBreak > lastAllowedBreakPoint && lineEnd > lineStart)
 368         {
 369             break;
 370         }
 371         lineEnd = nextBreak + 1;
 372     }
 373     while (lineEnd < lastAllowedBreakPoint && input[lineEnd - 1] != '\n');
 374     return (lineEnd < inputLength ? lineEnd : inputLength);
 375 }
 376
 377 size_t
 378 TextLineWrapper::findNextLine(const std::string &input, size_t lineStart) const
 379 {
 380     return findNextLine(input.c_str(), lineStart);
 381 }
 382
 383 std::string
 384 TextLineWrapper::formatLine(const std::string &input,
 385                             size_t lineStart, size_t lineEnd) const
 386 {
 387     size_t inputLength = input.length();
 388     bool   bFirstLine  = (lineStart == 0 || input[lineStart - 1] == '\n');
 389     // Strip leading whitespace if necessary.
 390     if (!bFirstLine)
 391     {
 392         lineStart = input.find_first_not_of(' ', lineStart);
 393         if (lineStart >= inputLength)
 394         {
 395             return std::string();
 396         }
 397     }
 398     int  indent        = (bFirstLine ? settings_.firstLineIndent() : settings_.indent());
 399     bool bContinuation = (lineEnd < inputLength && input[lineEnd - 1] != '\n');
 400     // Remove explicit line breaks in input
 401     // (the returned line should not contain line breaks).
 402     while (lineEnd > lineStart && input[lineEnd - 1] == '\n')
 403     {
 404         --lineEnd;
 405     }
 406     // Strip trailing whitespace, unless they are explicit in the input and it
 407     // has been requested to keep them.
 408     if (bContinuation || !settings_.bKeepFinalSpaces_)
 409     {
 410         while (lineEnd > lineStart && std::isspace(input[lineEnd - 1]))
 411         {
 412             --lineEnd;
 413         }
 414     }
 415
 416     const size_t lineLength = lineEnd - lineStart;
 417     if (lineLength == 0)
 418     {
 419         return std::string();
 420     }
 421     std::string result(indent, ' ');
 422     result.append(input, lineStart, lineLength);
 423     if (bContinuation && settings_.continuationChar_ != '\0')
 424     {
 425         result.append(1, ' ');
 426         result.append(1, settings_.continuationChar_);
 427     }
 428     return result;
 429 }
 430
 431 std::string
 432 TextLineWrapper::wrapToString(const std::string &input) const
 433 {
 434     std::string result;
 435     size_t      lineStart = 0;
 436     size_t      length    = input.length();
 437     while (lineStart < length)
 438     {
 439         size_t nextLineStart = findNextLine(input, lineStart);
 440         result.append(formatLine(input, lineStart, nextLineStart));
 441         if (nextLineStart < length
 442             || (nextLineStart == length && input[length - 1] == '\n'))
 443         {
 444             result.append("\n");
 445         }
 446         lineStart = nextLineStart;
 447     }
 448     return result;
 449 }
 450
 451 std::vector<std::string>
 452 TextLineWrapper::wrapToVector(const std::string &input) const
 453 {
 454     std::vector<std::string> result;
 455     size_t                   lineStart = 0;
 456     size_t                   length    = input.length();
 457     while (lineStart < length)
 458     {
 459         size_t nextLineStart = findNextLine(input, lineStart);
 460         result.push_back(formatLine(input, lineStart, nextLineStart));
 461         lineStart = nextLineStart;
 462     }
 463     return result;
 464 }
 465
 466 } // namespace gmx