Change MPI setup to communicate TPR as buffer
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / utility / inmemoryserializer.h
1 /*
2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3  *
4  * Copyright (c) 2016,2017,2018,2019, by the GROMACS development team, led by
5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
8  *
9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
12  * of the License, or (at your option) any later version.
13  *
14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
17  * Lesser General Public License for more details.
18  *
19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
20  * License along with GROMACS; if not, see
21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
23  *
24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
25  * consider that scientific software is very special. Version
26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
30  * official version at http://www.gromacs.org.
31  *
32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
34  */
35 /*! \libinternal \file
36  * \brief
37  * Declares gmx::ISerializer implementation for in-memory serialization.
38  *
39  * \author Teemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
40  * \inlibraryapi
41  * \ingroup module_utility
42  */
43 #ifndef GMX_UTILITY_INMEMORYSERIALIZER_H
44 #define GMX_UTILITY_INMEMORYSERIALIZER_H
45
46 #include <vector>
47
48 #include "gromacs/utility/arrayref.h"
49 #include "gromacs/utility/classhelpers.h"
50 #include "gromacs/utility/iserializer.h"
51
52 namespace gmx
53 {
54
55 class InMemorySerializer : public ISerializer
56 {
57     public:
58         InMemorySerializer();
59         ~InMemorySerializer() override;
60
61         std::vector<char> finishAndGetBuffer();
62
63         // From ISerializer
64         bool reading() const override { return false; }
65         void doBool(bool *value) override;
66         void doUChar(unsigned char *value) override;
67         void doChar(char *value) override;
68         void doUShort(unsigned short *value) override;
69         void doInt(int *value) override;
70         void doInt32(int32_t *value) override;
71         void doInt64(int64_t *value) override;
72         void doFloat(float *value) override;
73         void doDouble(double *value) override;
74         void doReal(real *value) override;
75         void doIvec(ivec *value) override;
76         void doRvec(rvec *value) override;
77         void doString(std::string *value) override;
78
79     private:
80         class Impl;
81
82         PrivateImplPointer<Impl> impl_;
83 };
84
85 class InMemoryDeserializer : public ISerializer
86 {
87     public:
88         explicit InMemoryDeserializer(ArrayRef<const char> buffer, bool sourceIsDouble);
89         ~InMemoryDeserializer() override;
90
91         //! Get if the source data was written in double precsion
92         bool sourceIsDouble() const;
93
94         // From ISerializer
95         bool reading() const override { return true; }
96         void doBool(bool *value) override;
97         void doUChar(unsigned char *value) override;
98         void doChar(char *value) override;
99         void doUShort(unsigned short *value) override;
100         void doInt(int *value) override;
101         void doInt32(int32_t *value) override;
102         void doInt64(int64_t *value) override;
103         void doFloat(float *value) override;
104         void doDouble(double *value) override;
105         void doReal(real *value) override;
106         void doIvec(ivec *value) override;
107         void doRvec(rvec *value) override;
108         void doString(std::string *value) override;
109
110     private:
111         class Impl;
112
113         PrivateImplPointer<Impl> impl_;
114 };
115
116 } // namespace gmx
117
118 #endif