src/gromacs/utility/inmemoryserializer.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2016,2017,2018,2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 #include "gmxpre.h"
  36
  37 #include "inmemoryserializer.h"
  38
  39 #include <algorithm>
  40 #include <vector>
  41
  42 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
  43
  44 namespace gmx
  45 {
  46
  47 namespace
  48 {
  49
  50 template <typename T>
  51 class CharBuffer
  52 {
  53     public:
  54         static const size_t ValueSize = sizeof(T);
  55
  56         explicit CharBuffer(T value)
  57         {
  58             u.v = value;
  59         }
  60         explicit CharBuffer(const char buffer[])
  61         {
  62             std::copy(buffer, buffer + ValueSize, u.c);
  63         }
  64
  65         T value() const { return u.v; }
  66
  67         void appendTo(std::vector<char> *buffer)
  68         {
  69             buffer->insert(buffer->end(), u.c, u.c + ValueSize);
  70         }
  71
  72     private:
  73         union {
  74             char c[ValueSize];
  75             T    v;
  76         } u;
  77 };
  78
  79 }   // namespace
  80
  81 /********************************************************************
  82  * InMemorySerializer
  83  */
  84
  85 class InMemorySerializer::Impl
  86 {
  87     public:
  88         template <typename T>
  89         void doValue(T value)
  90         {
  91             CharBuffer<T>(value).appendTo(&buffer_);
  92         }
  93         void doString(const std::string &value)
  94         {
  95             doValue<size_t>(value.size());
  96             buffer_.insert(buffer_.end(), value.begin(), value.end());
  97         }
  98
  99         std::vector<char> buffer_;
 100 };
 101
 102 InMemorySerializer::InMemorySerializer()
 103     : impl_(new Impl)
 104 {
 105 }
 106
 107 InMemorySerializer::~InMemorySerializer()
 108 {
 109 }
 110
 111 std::vector<char> InMemorySerializer::finishAndGetBuffer()
 112 {
 113     return std::move(impl_->buffer_);
 114 }
 115
 116 void InMemorySerializer::doBool(bool *value)
 117 {
 118     impl_->doValue(*value);
 119 }
 120
 121 void InMemorySerializer::doUChar(unsigned char *value)
 122 {
 123     impl_->doValue(*value);
 124 }
 125
 126 void InMemorySerializer::doChar(char *value)
 127 {
 128     impl_->doValue(*value);
 129 }
 130
 131 void InMemorySerializer::doUShort(unsigned short *value)
 132 {
 133     impl_->doValue(*value);
 134 }
 135
 136 void InMemorySerializer::doInt(int *value)
 137 {
 138     impl_->doValue(*value);
 139 }
 140
 141 void InMemorySerializer::doInt32(int32_t *value)
 142 {
 143     impl_->doValue(*value);
 144 }
 145
 146 void InMemorySerializer::doInt64(int64_t *value)
 147 {
 148     impl_->doValue(*value);
 149 }
 150
 151 void InMemorySerializer::doFloat(float *value)
 152 {
 153     impl_->doValue(*value);
 154 }
 155
 156 void InMemorySerializer::doDouble(double *value)
 157 {
 158     impl_->doValue(*value);
 159 }
 160
 161 void InMemorySerializer::doReal(real *value)
 162 {
 163     impl_->doValue(*value);
 164 }
 165
 166 void InMemorySerializer::doRvec(rvec *value)
 167 {
 168     for (int d = 0; d < DIM; d++)
 169     {
 170         doReal(&(*value)[d]);
 171     }
 172 }
 173
 174 void InMemorySerializer::doIvec(ivec *value)
 175 {
 176     for (int d = 0; d < DIM; d++)
 177     {
 178         doInt(&(*value)[d]);
 179     }
 180 }
 181
 182 void InMemorySerializer::doString(std::string *value)
 183 {
 184     impl_->doString(*value);
 185 }
 186
 187 /********************************************************************
 188  * InMemoryDeserializer
 189  */
 190
 191 class InMemoryDeserializer::Impl
 192 {
 193     public:
 194         explicit Impl(ArrayRef<const char> buffer, bool sourceIsDouble)
 195             : buffer_(buffer), sourceIsDouble_(sourceIsDouble), pos_(0)
 196         {
 197         }
 198
 199         template <typename T>
 200         void doValue(T *value)
 201         {
 202             *value = CharBuffer<T>(&buffer_[pos_]).value();
 203             pos_  += CharBuffer<T>::ValueSize;
 204         }
 205         void doString(std::string *value)
 206         {
 207             size_t size;
 208             doValue<size_t>(&size);
 209             *value = std::string(&buffer_[pos_], size);
 210             pos_  += size;
 211         }
 212
 213         ArrayRef<const char>     buffer_;
 214         bool                     sourceIsDouble_;
 215         size_t                   pos_;
 216 };
 217
 218 InMemoryDeserializer::InMemoryDeserializer(ArrayRef<const char> buffer, bool sourceIsDouble)
 219     : impl_(new Impl(buffer, sourceIsDouble))
 220 {
 221 }
 222
 223 InMemoryDeserializer::~InMemoryDeserializer()
 224 {
 225 }
 226
 227 bool InMemoryDeserializer::sourceIsDouble() const
 228 {
 229     return impl_->sourceIsDouble_;
 230 }
 231
 232 void InMemoryDeserializer::doBool(bool *value)
 233 {
 234     impl_->doValue(value);
 235 }
 236
 237 void InMemoryDeserializer::doUChar(unsigned char *value)
 238 {
 239     impl_->doValue(value);
 240 }
 241
 242 void InMemoryDeserializer::doChar(char *value)
 243 {
 244     impl_->doValue(value);
 245 }
 246
 247 void InMemoryDeserializer::doUShort(unsigned short *value)
 248 {
 249     impl_->doValue(value);
 250 }
 251
 252 void InMemoryDeserializer::doInt(int *value)
 253 {
 254     impl_->doValue(value);
 255 }
 256
 257 void InMemoryDeserializer::doInt32(int32_t *value)
 258 {
 259     impl_->doValue(value);
 260 }
 261
 262 void InMemoryDeserializer::doInt64(int64_t *value)
 263 {
 264     impl_->doValue(value);
 265 }
 266
 267 void InMemoryDeserializer::doFloat(float *value)
 268 {
 269     impl_->doValue(value);
 270 }
 271
 272 void InMemoryDeserializer::doDouble(double *value)
 273 {
 274     impl_->doValue(value);
 275 }
 276
 277 void InMemoryDeserializer::doReal(real *value)
 278 {
 279     if (sourceIsDouble())
 280     {
 281         double temp = 0.0;
 282         doDouble(&temp);
 283         *value = temp;
 284     }
 285     else
 286     {
 287         float temp = 0.0;
 288         doFloat(&temp);
 289         *value = temp;
 290     }
 291 }
 292
 293 void InMemoryDeserializer::doRvec(rvec *value)
 294 {
 295     for (int d = 0; d < DIM; d++)
 296     {
 297         doReal(&(*value)[d]);
 298     }
 299 }
 300
 301 void InMemoryDeserializer::doIvec(ivec *value)
 302 {
 303     for (int d = 0; d < DIM; d++)
 304     {
 305         doInt(&(*value)[d]);
 306     }
 307 }
 308
 309 void InMemoryDeserializer::doString(std::string *value)
 310 {
 311     impl_->doString(value);
 312 }
 313
 314 } // namespace gmx