src/gromacs/utility/init.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2013,2014,2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \file
  36  * \brief
  37  * Declares functions for initializing the \Gromacs library.
  38  *
  39  * Currently, only MPI initialization/finalization management is
  40  * required, and only if external MPI support is enabled.
  41  *
  42  * If MPI is already initialized, we should not call MPI_Init() or
  43  * MPI_Finalize(). This management object permits \Gromacs test code to
  44  * nest calls to functions that might normally implement a stand-alone
  45  * MPI-using tool. It also permits \Gromacs code to be called from code
  46  * that has already initialized MPI and needs that environment to work
  47  * and persist after \Gromacs code returns (e.g. \Gromacs tests,
  48  * external libraries that call \Gromacs code).
  49  *
  50  * It does so by maintaining a counter of the number of MPI
  51  * initializations, and only calling MPI_Init() or MPI_Finalize when
  52  * it is safe (ie. when the counter is at zero).
  53  *
  54  * Thread-MPI initialization and finalization for mdrun is all managed
  55  * in runner.c.
  56  *
  57  * \author Teemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
  58  * \inpublicapi
  59  * \ingroup module_utility
  60  */
  61 #ifndef GMX_UTILITY_INIT_H
  62 #define GMX_UTILITY_INIT_H
  63
  64 namespace gmx
  65 {
  66
  67 /*! \brief
  68  * Initializes the \Gromacs library.
  69  *
  70  * \param[in] argc  argc value passed to main().
  71  * \param[in] argv  argv array passed to main().
  72  *
  73  * \p argc and \p argv are the command line arguments passed to main().
  74  * They are allowed to be NULL if \Gromacs is not compiled with MPI, MPI_Init()
  75  * has already been called, or if the MPI library \Gromacs is compiled against
  76  * allows it.
  77  *
  78  * Does not throw.
  79  *
  80  * \ingroup module_utility
  81  */
  82 void init(int* argc, char*** argv);
  83 /*! \brief
  84  * Deinitializes the \Gromacs library.
  85  *
  86  * Decrements the initialization counter, and calls MPI_Finalize()
  87  * if \Gromacs is compiled with MPI support and the counter has
  88  * reached zero.  In that case, it is not possible to reinitialize
  89  * \Gromacs after calling this function.  Instead, call gmx::init() at
  90  * a higher level, and note that calls to init can be nested safely.
  91  *
  92  * \ingroup module_utility
  93  */
  94 void finalize();
  95
  96 } // namespace gmx
  97
  98 #endif