src/gromacs/utility/fatalerror.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2016,2017 by the GROMACS development team.
   7  * Copyright (c) 2018,2019,2020, by the GROMACS development team, led by
   8  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   9  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
  10  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38 #include "gmxpre.h"
  39
  40 #include "fatalerror.h"
  41
  42 #include "config.h"
  43
  44 #include <cerrno>
  45 #include <cstddef>
  46 #include <cstdlib>
  47 #include <cstring>
  48
  49 #include <exception>
  50
  51 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  52 #include "gromacs/utility/baseversion.h"
  53 #include "gromacs/utility/cstringutil.h"
  54 #include "gromacs/utility/futil.h"
  55 #include "gromacs/utility/mutex.h"
  56 #include "gromacs/utility/programcontext.h"
  57 #include "gromacs/utility/stringutil.h"
  58
  59 #include "errorcodes.h"
  60
  61 #if GMX_MPI
  62 #    include "gromacs/utility/basenetwork.h"
  63 #    include "gromacs/utility/gmxmpi.h"
  64 #endif
  65
  66 #include "errorformat.h"
  67
  68 static bool       bDebug = false;
  69 static gmx::Mutex where_mutex;
  70
  71 FILE*    debug        = nullptr;
  72 gmx_bool gmx_debug_at = FALSE;
  73
  74 static FILE*      log_file = nullptr;
  75 static gmx::Mutex error_mutex;
  76
  77 using Lock = gmx::lock_guard<gmx::Mutex>;
  78
  79 void gmx_init_debug(const int dbglevel, const char* dbgfile)
  80 {
  81     if (!bDebug)
  82     {
  83         gmx_disable_file_buffering();
  84         debug  = gmx_ffopen(dbgfile, "w+");
  85         bDebug = true;
  86         if (dbglevel >= 2)
  87         {
  88             gmx_debug_at = TRUE;
  89         }
  90     }
  91 }
  92
  93 gmx_bool bDebugMode()
  94 {
  95     return bDebug;
  96 }
  97
  98 void gmx_fatal_set_log_file(FILE* fp)
  99 {
 100     log_file = fp;
 101 }
 102
 103 static void default_error_handler(const char* title, const std::string& msg, const char* file, int line)
 104 {
 105     if (log_file)
 106     {
 107         gmx::internal::printFatalErrorHeader(log_file, title, nullptr, file, line);
 108         gmx::internal::printFatalErrorMessageLine(log_file, msg.c_str(), 0);
 109         gmx::internal::printFatalErrorFooter(log_file);
 110     }
 111     gmx::internal::printFatalErrorHeader(stderr, title, nullptr, file, line);
 112     gmx::internal::printFatalErrorMessageLine(stderr, msg.c_str(), 0);
 113     gmx::internal::printFatalErrorFooter(stderr);
 114 }
 115
 116 static gmx_error_handler_t gmx_error_handler = default_error_handler;
 117
 118 void gmx_set_error_handler(gmx_error_handler_t func)
 119 {
 120     Lock lock(error_mutex);
 121     gmx_error_handler = func;
 122 }
 123
 124 static const char* gmx_strerror(const char* key)
 125 {
 126     struct ErrorKeyEntry
 127     {
 128         const char* key;
 129         const char* msg;
 130     };
 131     ErrorKeyEntry map[] = { { "call", "Routine should not have been called" },
 132                             { "comm", "Communication (parallel processing) problem" },
 133                             { "fatal", "Fatal error" },
 134                             { "file", "File input/output error" },
 135                             { "impl", "Implementation restriction" },
 136                             { "incons", "Software inconsistency error" },
 137                             { "input", "Input error or input inconsistency" },
 138                             { "mem", "Memory allocation/freeing error" },
 139                             { "open", "Cannot open file" },
 140                             { "range", "Range checking error" } };
 141
 142     if (key == nullptr)
 143     {
 144         return "NULL error type (should not occur)";
 145     }
 146     for (const ErrorKeyEntry& entry : map)
 147     {
 148         if (std::strcmp(key, entry.key) == 0)
 149         {
 150             return entry.msg;
 151         }
 152     }
 153     return gmx::getErrorCodeString(gmx::eeUnknownError);
 154 }
 155
 156 static void call_error_handler(const char* key, const char* file, int line, const std::string& msg)
 157 {
 158     Lock lock(error_mutex);
 159     gmx_error_handler(gmx_strerror(key), msg.empty() ? "Empty gmx_fatal message (bug)." : msg, file, line);
 160 }
 161
 162 void gmx_exit_on_fatal_error(ExitType exitType, int returnValue)
 163 {
 164     if (log_file)
 165     {
 166         std::fflush(log_file);
 167     }
 168     if (debug)
 169     {
 170         std::fflush(debug);
 171     }
 172     std::fflush(stdout);
 173     std::fflush(stderr);
 174
 175 #if GMX_MPI
 176     if (gmx_mpi_initialized())
 177     {
 178         switch (exitType)
 179         {
 180             case ExitType_CleanExit: MPI_Finalize(); break;
 181             case ExitType_Abort:
 182 #    if GMX_LIB_MPI
 183                 gmx_abort(returnValue);
 184 #    else
 185                 break;
 186 #    endif
 187             case ExitType_NonMasterAbort:
 188                 // Let all other processes wait till the master has printed
 189                 // the error message and issued MPI_Abort.
 190                 MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
 191                 break;
 192         }
 193     }
 194 #endif
 195
 196     if (exitType == ExitType_CleanExit)
 197     {
 198         std::exit(returnValue);
 199     }
 200     // We cannot use std::exit() if other threads may still be executing, since that would cause
 201     // destructors to be called for global objects that may still be in use elsewhere.
 202     std::_Exit(returnValue);
 203 }
 204
 205 void gmx_fatal_mpi_va(int /*f_errno*/,
 206                       const char* file,
 207                       int         line,
 208                       gmx_bool    bMaster,
 209                       gmx_bool    bFinalize,
 210                       const char* fmt,
 211                       va_list     ap)
 212 {
 213     if (bMaster)
 214     {
 215         std::string msg = gmx::formatStringV(fmt, ap);
 216         call_error_handler("fatal", file, line, msg);
 217     }
 218
 219     ExitType exitType = ExitType_CleanExit;
 220     if (!bFinalize)
 221     {
 222         exitType = bMaster ? ExitType_Abort : ExitType_NonMasterAbort;
 223     }
 224     gmx_exit_on_fatal_error(exitType, 1);
 225 }
 226
 227 void gmx_fatal(int f_errno, const char* file, int line, gmx_fmtstr const char* fmt, ...)
 228 {
 229     va_list ap;
 230     va_start(ap, fmt);
 231     gmx_fatal_mpi_va(f_errno, file, line, TRUE, FALSE, fmt, ap);
 232     va_end(ap);
 233 }
 234
 235 void _gmx_error(const char* key, const std::string& msg, const char* file, int line)
 236 {
 237     call_error_handler(key, file, line, msg);
 238     gmx_exit_on_fatal_error(ExitType_Abort, 1);
 239 }
 240
 241 void _range_check(int n, int n_min, int n_max, const char* warn_str, const char* var, const char* file, int line)
 242 {
 243     if ((n < n_min) || (n >= n_max))
 244     {
 245         std::string buf;
 246         if (warn_str != nullptr)
 247         {
 248             buf = warn_str;
 249             buf += "\n";
 250         }
 251
 252         buf += gmx::formatString(
 253                 "Variable %s has value %d. It should have been "
 254                 "within [ %d .. %d ]\n",
 255                 var, n, n_min, n_max);
 256
 257         _gmx_error("range", buf, file, line);
 258     }
 259 }
 260
 261 void gmx_warning(gmx_fmtstr const char* fmt, ...)
 262 {
 263     va_list ap;
 264     char    msg[STRLEN];
 265
 266     va_start(ap, fmt);
 267     vsprintf(msg, fmt, ap);
 268     va_end(ap);
 269
 270     fprintf(stderr, "\nWARNING: %s\n\n", msg);
 271 }