src/gromacs/utility/fatalerror.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2016,2017,2018, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37 #include "gmxpre.h"
  38
  39 #include "fatalerror.h"
  40
  41 #include "config.h"
  42
  43 #include <cerrno>
  44 #include <cstddef>
  45 #include <cstdlib>
  46 #include <cstring>
  47
  48 #include <exception>
  49
  50 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  51 #include "gromacs/utility/baseversion.h"
  52 #include "gromacs/utility/cstringutil.h"
  53 #include "gromacs/utility/errorcodes.h"
  54 #include "gromacs/utility/futil.h"
  55 #include "gromacs/utility/mutex.h"
  56 #include "gromacs/utility/programcontext.h"
  57 #include "gromacs/utility/stringutil.h"
  58
  59 #if GMX_MPI
  60 #include "gromacs/utility/basenetwork.h"
  61 #include "gromacs/utility/gmxmpi.h"
  62 #endif
  63
  64 #include "errorformat.h"
  65
  66 static bool       bDebug         = false;
  67 static gmx::Mutex where_mutex;
  68
  69 FILE             *debug          = nullptr;
  70 gmx_bool          gmx_debug_at   = FALSE;
  71
  72 static FILE      *log_file       = nullptr;
  73 static gmx::Mutex error_mutex;
  74
  75 using Lock = gmx::lock_guard<gmx::Mutex>;
  76
  77 void gmx_init_debug(const int dbglevel, const char *dbgfile)
  78 {
  79     if (!bDebug)
  80     {
  81         gmx_disable_file_buffering();
  82         debug  = gmx_ffopen(dbgfile, "w+");
  83         bDebug = true;
  84         if (dbglevel >= 2)
  85         {
  86             gmx_debug_at = TRUE;
  87         }
  88     }
  89 }
  90
  91 gmx_bool bDebugMode()
  92 {
  93     return bDebug;
  94 }
  95
  96 void gmx_fatal_set_log_file(FILE *fp)
  97 {
  98     log_file = fp;
  99 }
 100
 101 static void default_error_handler(const char *title, const std::string &msg,
 102                                   const char *file, int line)
 103 {
 104     if (log_file)
 105     {
 106         gmx::internal::printFatalErrorHeader(log_file, title, nullptr, file, line);
 107         gmx::internal::printFatalErrorMessageLine(log_file, msg.c_str(), 0);
 108         gmx::internal::printFatalErrorFooter(log_file);
 109     }
 110     gmx::internal::printFatalErrorHeader(stderr, title, nullptr, file, line);
 111     gmx::internal::printFatalErrorMessageLine(stderr, msg.c_str(), 0);
 112     gmx::internal::printFatalErrorFooter(stderr);
 113 }
 114
 115 static gmx_error_handler_t gmx_error_handler = default_error_handler;
 116
 117 void gmx_set_error_handler(gmx_error_handler_t func)
 118 {
 119     Lock lock(error_mutex);
 120     gmx_error_handler = func;
 121 }
 122
 123 static const char *gmx_strerror(const char *key)
 124 {
 125     struct ErrorKeyEntry {
 126         const char *key;
 127         const char *msg;
 128     };
 129     ErrorKeyEntry map[] = {
 130         { "call",   "Routine should not have been called" },
 131         { "comm",   "Communication (parallel processing) problem" },
 132         { "fatal",  "Fatal error" },
 133         { "file",   "File input/output error" },
 134         { "impl",   "Implementation restriction" },
 135         { "incons", "Software inconsistency error" },
 136         { "input",  "Input error or input inconsistency" },
 137         { "mem",    "Memory allocation/freeing error" },
 138         { "open",   "Cannot open file" },
 139         { "range",  "Range checking error" }
 140     };
 141
 142     if (key == nullptr)
 143     {
 144         return "NULL error type (should not occur)";
 145     }
 146     for (const ErrorKeyEntry &entry : map)
 147     {
 148         if (std::strcmp(key, entry.key) == 0)
 149         {
 150             return entry.msg;
 151         }
 152     }
 153     return gmx::getErrorCodeString(gmx::eeUnknownError);
 154 }
 155
 156 static void call_error_handler(const char *key, const char *file, int line, const std::string &msg)
 157 {
 158     Lock lock(error_mutex);
 159     gmx_error_handler(gmx_strerror(key),
 160                       msg.empty() ? "Empty gmx_fatal message (bug)." : msg,
 161                       file, line);
 162 }
 163
 164 void gmx_exit_on_fatal_error(ExitType exitType, int returnValue)
 165 {
 166     if (log_file)
 167     {
 168         std::fflush(log_file);
 169     }
 170     if (debug)
 171     {
 172         std::fflush(debug);
 173     }
 174     std::fflush(stdout);
 175     std::fflush(stderr);
 176
 177 #if GMX_MPI
 178     if (gmx_mpi_initialized())
 179     {
 180         switch (exitType)
 181         {
 182             case ExitType_CleanExit:
 183                 MPI_Finalize();
 184                 break;
 185             case ExitType_Abort:
 186 #if GMX_LIB_MPI
 187                 gmx_abort(returnValue);
 188 #else
 189                 break;
 190 #endif
 191             case ExitType_NonMasterAbort:
 192                 // Let all other processes wait till the master has printed
 193                 // the error message and issued MPI_Abort.
 194                 MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
 195                 break;
 196         }
 197     }
 198 #endif
 199
 200     if (exitType == ExitType_CleanExit)
 201     {
 202         std::exit(returnValue);
 203     }
 204     // We cannot use std::exit() if other threads may still be executing, since that would cause destructors to be
 205     // called for global objects that may still be in use elsewhere.
 206     std::_Exit(returnValue);
 207 }
 208
 209 void gmx_fatal_mpi_va(int /*f_errno*/, const char *file, int line,
 210                       gmx_bool bMaster, gmx_bool bFinalize,
 211                       const char *fmt, va_list ap)
 212 {
 213     if (bMaster)
 214     {
 215         std::string msg = gmx::formatStringV(fmt, ap);
 216         call_error_handler("fatal", file, line, msg);
 217     }
 218
 219     ExitType exitType = ExitType_CleanExit;
 220     if (!bFinalize)
 221     {
 222         exitType = bMaster ? ExitType_Abort : ExitType_NonMasterAbort;
 223     }
 224     gmx_exit_on_fatal_error(exitType, 1);
 225 }
 226
 227 void gmx_fatal(int f_errno, const char *file, int line, gmx_fmtstr const char *fmt, ...)
 228 {
 229     va_list ap;
 230     va_start(ap, fmt);
 231     gmx_fatal_mpi_va(f_errno, file, line, TRUE, FALSE, fmt, ap);
 232     va_end(ap);
 233 }
 234
 235 void _gmx_error(const char *key, const std::string &msg, const char *file, int line)
 236 {
 237     call_error_handler(key, file, line, msg);
 238     gmx_exit_on_fatal_error(ExitType_Abort, 1);
 239 }
 240
 241 void _range_check(int n, int n_min, int n_max, const char *warn_str,
 242                   const char *var, const char *file, int line)
 243 {
 244     char buf[1024];
 245
 246     if ((n < n_min) || (n >= n_max))
 247     {
 248         if (warn_str != nullptr)
 249         {
 250             strcpy(buf, warn_str);
 251             strcat(buf, "\n");
 252         }
 253         else
 254         {
 255             buf[0] = '\0';
 256         }
 257
 258         sprintf(buf+strlen(buf), "Variable %s has value %d. It should have been "
 259                 "within [ %d .. %d ]\n", var, n, n_min, n_max);
 260
 261         _gmx_error("range", buf, file, line);
 262     }
 263 }
 264
 265 void gmx_warning(gmx_fmtstr const char *fmt, ...)
 266 {
 267     va_list ap;
 268     char    msg[STRLEN];
 269
 270     va_start(ap, fmt);
 271     vsprintf(msg, fmt, ap);
 272     va_end(ap);
 273
 274     fprintf(stderr, "\nWARNING: %s\n\n", msg);
 275 }