src/gromacs/utility/directoryenumerator.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2010,2011,2014,2015,2016,2017,2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * Implements gmx::DirectoryEnumerator.
  38  *
  39  * \author Erik Lindahl (original C implementation)
  40  * \author Teemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com> (C++ wrapper + errno handling)
  41  * \ingroup module_utility
  42  */
  43 #include "gmxpre.h"
  44
  45 #include "directoryenumerator.h"
  46
  47 #include "config.h"
  48
  49 #include <cerrno>
  50 #include <cstdio>
  51
  52 #include <algorithm>
  53 #include <string>
  54 #include <vector>
  55
  56 #if HAVE_DIRENT_H
  57 #    include <dirent.h>
  58 #endif
  59 #if GMX_NATIVE_WINDOWS
  60 #    include <io.h>
  61 #endif
  62
  63 #include "gromacs/utility/exceptions.h"
  64 #include "gromacs/utility/fatalerror.h"
  65 #include "gromacs/utility/futil.h"
  66 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
  67 #include "gromacs/utility/smalloc.h"
  68 #include "gromacs/utility/stringutil.h"
  69
  70 namespace gmx
  71 {
  72
  73 /********************************************************************
  74  * DirectoryEnumerator::Impl
  75  */
  76
  77 // TODO: Consider whether checking the return value of closing would be useful,
  78 // and what could we do if it fails?
  79 #if GMX_NATIVE_WINDOWS
  80 // TODO: Consider if Windows provides more error details through other APIs.
  81 class DirectoryEnumerator::Impl
  82 {
  83 public:
  84     static Impl* init(const char* dirname, bool bThrow)
  85     {
  86         std::string tmpname(dirname);
  87         // Remove possible trailing directory separator.
  88         // TODO: Use a method in gmx::Path instead.
  89         if (tmpname.back() == '/' || tmpname.back() == '\\')
  90         {
  91             tmpname.pop_back();
  92         }
  93
  94         // Add wildcard.
  95         tmpname.append("/*");
  96
  97         errno = 0;
  98         _finddata_t finddata;
  99         intptr_t    handle = _findfirst(tmpname.c_str(), &finddata);
 100         if (handle < 0L)
 101         {
 102             if (errno != ENOENT && bThrow)
 103             {
 104                 const int         code = errno;
 105                 const std::string message =
 106                         formatString("Failed to list files in directory '%s'", dirname);
 107                 GMX_THROW_WITH_ERRNO(FileIOError(message), "_findfirst", code);
 108             }
 109             return NULL;
 110         }
 111         return new Impl(handle, finddata);
 112     }
 113     Impl(intptr_t handle, _finddata_t finddata) :
 114         windows_handle(handle),
 115         finddata(finddata),
 116         bFirst_(true)
 117     {
 118     }
 119     ~Impl() { _findclose(windows_handle); }
 120
 121     bool nextFile(std::string* filename)
 122     {
 123         if (bFirst_)
 124         {
 125             *filename = finddata.name;
 126             bFirst_   = false;
 127             return true;
 128         }
 129         else
 130         {
 131             errno = 0;
 132             if (_findnext(windows_handle, &finddata) != 0)
 133             {
 134                 if (errno == 0 || errno == ENOENT)
 135                 {
 136                     filename->clear();
 137                     return false;
 138                 }
 139                 else
 140                 {
 141                     GMX_THROW_WITH_ERRNO(FileIOError("Failed to list files in a directory"),
 142                                          "_findnext", errno);
 143                 }
 144             }
 145             *filename = finddata.name;
 146             return true;
 147         }
 148     }
 149
 150 private:
 151     intptr_t    windows_handle;
 152     _finddata_t finddata;
 153     bool        bFirst_;
 154 };
 155 #elif HAVE_DIRENT_H
 156 class DirectoryEnumerator::Impl
 157 {
 158 public:
 159     static Impl* init(const char* dirname, bool bThrow)
 160     {
 161         errno       = 0;
 162         DIR* handle = opendir(dirname);
 163         if (handle == nullptr)
 164         {
 165             if (bThrow)
 166             {
 167                 const int         code = errno;
 168                 const std::string message =
 169                         formatString("Failed to list files in directory '%s'", dirname);
 170                 GMX_THROW_WITH_ERRNO(FileIOError(message), "opendir", code);
 171             }
 172             return nullptr;
 173         }
 174         return new Impl(handle);
 175     }
 176     explicit Impl(DIR* handle) : dirent_handle(handle) {}
 177     ~Impl() { closedir(dirent_handle); }
 178
 179     bool nextFile(std::string* filename)
 180     {
 181         errno     = 0;
 182         dirent* p = readdir(dirent_handle);
 183         if (p == nullptr)
 184         {
 185             if (errno == 0)
 186             {
 187                 // All the files have been found.
 188                 filename->clear();
 189                 return false;
 190             }
 191             else
 192             {
 193                 GMX_THROW_WITH_ERRNO(FileIOError("Failed to list files in a directory"), "readdir", errno);
 194             }
 195         }
 196         *filename = p->d_name;
 197         return true;
 198     }
 199
 200 private:
 201     DIR* dirent_handle;
 202 };
 203 #else
 204 class DirectoryEnumerator::Impl
 205 {
 206 public:
 207     static Impl* init(const char* /*dirname*/, bool /*bThrow*/)
 208     {
 209         std::string message(
 210                 "Source compiled without POSIX dirent or Windows support "
 211                 "- cannot scan directories. In the very unlikely event "
 212                 "this is not a compile-time mistake you could consider "
 213                 "implementing support for your platform in "
 214                 "directoryenumerator.cpp, but contact the developers "
 215                 "to make sure it's really necessary!");
 216         GMX_THROW(NotImplementedError(message));
 217     }
 218
 219     bool nextFile(std::string* /*filename*/) { return false; }
 220 };
 221 #endif
 222
 223 /********************************************************************
 224  * DirectoryEnumerator
 225  */
 226
 227 // static
 228 std::vector<std::string> DirectoryEnumerator::enumerateFilesWithExtension(const char* dirname,
 229                                                                           const char* extension,
 230                                                                           bool        bThrow)
 231 {
 232     std::vector<std::string> result;
 233     DirectoryEnumerator      dir(dirname, bThrow);
 234     std::string              nextName;
 235     while (dir.nextFile(&nextName))
 236     {
 237         if (debug)
 238         {
 239             std::fprintf(debug, "dir '%s' file '%s'\n", dirname, nextName.c_str());
 240         }
 241         // TODO: What about case sensitivity?
 242         if (endsWith(nextName, extension))
 243         {
 244             result.push_back(nextName);
 245         }
 246     }
 247
 248     std::sort(result.begin(), result.end());
 249     return result;
 250 }
 251
 252
 253 DirectoryEnumerator::DirectoryEnumerator(const char* dirname, bool bThrow) : impl_(nullptr)
 254 {
 255     GMX_RELEASE_ASSERT(dirname != nullptr && dirname[0] != '\0',
 256                        "Attempted to open empty/null directory path");
 257     impl_.reset(Impl::init(dirname, bThrow));
 258 }
 259
 260 DirectoryEnumerator::DirectoryEnumerator(const std::string& dirname, bool bThrow) : impl_(nullptr)
 261 {
 262     GMX_RELEASE_ASSERT(!dirname.empty(), "Attempted to open empty/null directory path");
 263     impl_.reset(Impl::init(dirname.c_str(), bThrow));
 264 }
 265
 266 DirectoryEnumerator::~DirectoryEnumerator() {}
 267
 268 bool DirectoryEnumerator::nextFile(std::string* filename)
 269 {
 270     if (impl_ == nullptr)
 271     {
 272         filename->clear();
 273         return false;
 274     }
 275     return impl_->nextFile(filename);
 276 }
 277
 278 } // namespace gmx