src/gromacs/utility/binaryinformation.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2016,2017,2018,2019, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37 /*! \internal \file
  38  * \brief Implements functionality for printing information about the
  39  * currently running binary
  40  *
  41  * \ingroup module_utility
  42  */
  43 #include "gmxpre.h"
  44
  45 #include "binaryinformation.h"
  46
  47 #include "config.h"
  48
  49 #if GMX_FFT_FFTW3 || GMX_FFT_ARMPL_FFTW3
  50 // Needed for construction of the FFT library description string
  51 #    include <fftw3.h>
  52 #endif
  53
  54 #ifdef HAVE_LIBMKL
  55 #    include <mkl.h>
  56 #endif
  57
  58 #if HAVE_EXTRAE
  59 #    include <extrae_user_events.h>
  60 #endif
  61
  62 #if GMX_USE_HWLOC
  63 #    include <hwloc.h>
  64 #endif
  65
  66 #include <cstdio>
  67 #include <cstdlib>
  68 #include <cstring>
  69
  70 #include <algorithm>
  71 #include <array>
  72 #include <string>
  73
  74 /* This file is completely threadsafe - keep it that way! */
  75
  76 #include "buildinfo.h"
  77 #include "gromacs/utility/arraysize.h"
  78 #include "gromacs/utility/baseversion.h"
  79 #include "gromacs/utility/exceptions.h"
  80 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
  81 #include "gromacs/utility/path.h"
  82 #include "gromacs/utility/programcontext.h"
  83 #include "gromacs/utility/stringutil.h"
  84 #include "gromacs/utility/sysinfo.h"
  85 #include "gromacs/utility/textwriter.h"
  86
  87 #include "cuda_version_information.h"
  88
  89 namespace
  90 {
  91
  92 using gmx::formatString;
  93
  94 //! \cond Doxygen does not need to care about most of this stuff, and the macro usage is painful to document
  95
  96 int centeringOffset(int width, int length)
  97 {
  98     return std::max(width - length, 0) / 2;
  99 }
 100
 101 std::string formatCentered(int width, const char* text)
 102 {
 103     const int offset = centeringOffset(width, std::strlen(text));
 104     return formatString("%*s%s", offset, "", text);
 105 }
 106
 107 void printCopyright(gmx::TextWriter* writer)
 108 {
 109     static const char* const Contributors[] = {
 110         "Emile Apol",         "Rossen Apostolov",   "Paul Bauer",         "Herman J.C. Berendsen",
 111         "Par Bjelkmar",       "Christian Blau",     "Viacheslav Bolnykh", "Kevin Boyd",
 112         "Aldert van Buuren",  "Rudi van Drunen",    "Anton Feenstra",     "Alan Gray",
 113         "Gerrit Groenhof",    "Anca Hamuraru",      "Vincent Hindriksen", "M. Eric Irrgang",
 114         "Aleksei Iupinov",    "Christoph Junghans", "Joe Jordan",         "Dimitrios Karkoulis",
 115         "Peter Kasson",       "Jiri Kraus",         "Carsten Kutzner",    "Per Larsson",
 116         "Justin A. Lemkul",   "Viveca Lindahl",     "Magnus Lundborg",    "Erik Marklund",
 117         "Pascal Merz",        "Pieter Meulenhoff",  "Teemu Murtola",      "Szilard Pall",
 118         "Sander Pronk",       "Roland Schulz",      "Michael Shirts",     "Alexey Shvetsov",
 119         "Alfons Sijbers",     "Peter Tieleman",     "Jon Vincent",        "Teemu Virolainen",
 120         "Christian Wennberg", "Maarten Wolf",       "Artem Zhmurov"
 121     };
 122     static const char* const CopyrightText[] = {
 123         "Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.",
 124         "Copyright (c) 2001-2019, The GROMACS development team at",
 125         "Uppsala University, Stockholm University and", "the Royal Institute of Technology, Sweden.",
 126         "check out http://www.gromacs.org for more information."
 127     };
 128
 129 #define NCONTRIBUTORS static_cast<int>(asize(Contributors))
 130 #define NCR static_cast<int>(asize(CopyrightText))
 131
 132     // TODO a centering behaviour of TextWriter could be useful here
 133     writer->writeLine(formatCentered(78, "GROMACS is written by:"));
 134     for (int i = 0; i < NCONTRIBUTORS;)
 135     {
 136         for (int j = 0; j < 4 && i < NCONTRIBUTORS; ++j, ++i)
 137         {
 138             const int            width = 18;
 139             std::array<char, 30> buf;
 140             const int            offset = centeringOffset(width, strlen(Contributors[i]));
 141             GMX_RELEASE_ASSERT(static_cast<int>(strlen(Contributors[i])) + offset < gmx::ssize(buf),
 142                                "Formatting buffer is not long enough");
 143             std::fill(buf.begin(), buf.begin() + offset, ' ');
 144             std::strncpy(buf.data() + offset, Contributors[i], gmx::ssize(buf) - offset);
 145             writer->writeString(formatString(" %-*s", width, buf.data()));
 146         }
 147         writer->ensureLineBreak();
 148     }
 149     writer->writeLine(formatCentered(78, "and the project leaders:"));
 150     writer->writeLine(
 151             formatCentered(78, "Mark Abraham, Berk Hess, Erik Lindahl, and David van der Spoel"));
 152     writer->ensureEmptyLine();
 153     for (int i = 0; i < NCR; ++i)
 154     {
 155         writer->writeLine(CopyrightText[i]);
 156     }
 157     writer->ensureEmptyLine();
 158
 159     // Folding At Home has different licence to allow digital
 160     // signatures in GROMACS, so does not need to show the normal
 161     // license statement.
 162     if (!GMX_FAHCORE)
 163     {
 164         writer->writeLine("GROMACS is free software; you can redistribute it and/or modify it");
 165         writer->writeLine("under the terms of the GNU Lesser General Public License");
 166         writer->writeLine("as published by the Free Software Foundation; either version 2.1");
 167         writer->writeLine("of the License, or (at your option) any later version.");
 168     }
 169 }
 170
 171 // Construct a string that describes the library that provides FFT support to this build
 172 const char* getFftDescriptionString()
 173 {
 174 // Define the FFT description string
 175 #if GMX_FFT_FFTW3 || GMX_FFT_ARMPL_FFTW3
 176 #    if GMX_NATIVE_WINDOWS
 177     // Don't buy trouble
 178     return "fftw3";
 179 #    else
 180     // Use the version string provided by libfftw3
 181 #        if GMX_DOUBLE
 182     return fftw_version;
 183 #        else
 184     return fftwf_version;
 185 #        endif
 186 #    endif
 187 #endif
 188 #if GMX_FFT_MKL
 189     return "Intel MKL";
 190 #endif
 191 #if GMX_FFT_FFTPACK
 192     return "fftpack (built-in)";
 193 #endif
 194 };
 195
 196 void gmx_print_version_info(gmx::TextWriter* writer)
 197 {
 198     writer->writeLine(formatString("GROMACS version:    %s", gmx_version()));
 199     const char* const git_hash = gmx_version_git_full_hash();
 200     if (git_hash[0] != '\0')
 201     {
 202         writer->writeLine(formatString("GIT SHA1 hash:      %s", git_hash));
 203     }
 204     const char* const base_hash = gmx_version_git_central_base_hash();
 205     if (base_hash[0] != '\0')
 206     {
 207         writer->writeLine(formatString("Branched from:      %s", base_hash));
 208     }
 209     const char* const releaseSourceChecksum = gmxReleaseSourceChecksum();
 210     const char* const currentSourceChecksum = gmxCurrentSourceChecksum();
 211     if (releaseSourceChecksum[0] != '\0')
 212     {
 213         if (std::strcmp(releaseSourceChecksum, "NoChecksumFile") == 0)
 214         {
 215             writer->writeLine(formatString(
 216                     "The source code this program was compiled from has not been verified because "
 217                     "the reference checksum was missing during compilation. This means you have an "
 218                     "incomplete GROMACS distribution, please make sure to download an intact "
 219                     "source distribution and compile that before proceeding."));
 220             writer->writeLine(formatString("Computed checksum: %s", currentSourceChecksum));
 221         }
 222         else if (std::strcmp(releaseSourceChecksum, "NoPythonAvailable") == 0)
 223         {
 224             writer->writeLine(
 225                     formatString("Build source could not be verified, because the checksum could "
 226                                  "not be computed."));
 227         }
 228         else if (std::strcmp(releaseSourceChecksum, currentSourceChecksum) != 0)
 229         {
 230             writer->writeLine(formatString(
 231                     "This program has been built from source code that has been altered and does "
 232                     "not match the code released as part of the official GROMACS version %s. If "
 233                     "you did not intend to use an altered GROMACS version, make sure to download "
 234                     "an intact source distribution and compile that before proceeding.",
 235                     gmx_version()));
 236             writer->writeLine(formatString(
 237                     "If you have modified the source code, you are strongly encouraged to set your "
 238                     "custom version suffix (using -DGMX_VERSION_STRING_OF_FORK) which will can "
 239                     "help later with scientific reproducibility but also when reporting bugs."));
 240             writer->writeLine(formatString("Release checksum: %s", releaseSourceChecksum));
 241             writer->writeLine(formatString("Computed checksum: %s", currentSourceChecksum));
 242         }
 243         else
 244         {
 245             writer->writeLine(formatString("Verified release checksum is %s", releaseSourceChecksum));
 246         }
 247     }
 248
 249
 250 #if GMX_DOUBLE
 251     writer->writeLine("Precision:          double");
 252 #else
 253     writer->writeLine("Precision:          single");
 254 #endif
 255     writer->writeLine(formatString("Memory model:       %u bit", static_cast<unsigned>(8 * sizeof(void*))));
 256
 257 #if GMX_THREAD_MPI
 258     writer->writeLine("MPI library:        thread_mpi");
 259 #elif GMX_MPI
 260     writer->writeLine("MPI library:        MPI");
 261 #else
 262     writer->writeLine("MPI library:        none");
 263 #endif
 264 #if GMX_OPENMP
 265     writer->writeLine(formatString("OpenMP support:     enabled (GMX_OPENMP_MAX_THREADS = %d)",
 266                                    GMX_OPENMP_MAX_THREADS));
 267 #else
 268     writer->writeLine("OpenMP support:     disabled");
 269 #endif
 270     writer->writeLine(formatString("GPU support:        %s", getGpuImplementationString()));
 271     writer->writeLine(formatString("SIMD instructions:  %s", GMX_SIMD_STRING));
 272     writer->writeLine(formatString("FFT library:        %s", getFftDescriptionString()));
 273     writer->writeLine(formatString("RDTSCP usage:       %s", HAVE_RDTSCP ? "enabled" : "disabled"));
 274 #if GMX_USE_TNG
 275     writer->writeLine("TNG support:        enabled");
 276 #else
 277     writer->writeLine("TNG support:        disabled");
 278 #endif
 279 #if GMX_USE_HWLOC
 280     writer->writeLine(formatString("Hwloc support:      hwloc-%s", HWLOC_VERSION));
 281 #else
 282     writer->writeLine("Hwloc support:      disabled");
 283 #endif
 284 #if HAVE_EXTRAE
 285     unsigned major, minor, revision;
 286     Extrae_get_version(&major, &minor, &revision);
 287     writer->writeLine(formatString("Tracing support:    enabled. Using Extrae-%d.%d.%d", major,
 288                                    minor, revision));
 289 #else
 290     writer->writeLine("Tracing support:    disabled");
 291 #endif
 292
 293
 294     /* TODO: The below strings can be quite long, so it would be nice to wrap
 295      * them. Can wait for later, as the master branch has ready code to do all
 296      * that. */
 297     writer->writeLine(formatString("C compiler:         %s", BUILD_C_COMPILER));
 298     writer->writeLine(formatString("C compiler flags:   %s", BUILD_CFLAGS));
 299     writer->writeLine(formatString("C++ compiler:       %s", BUILD_CXX_COMPILER));
 300     writer->writeLine(formatString("C++ compiler flags: %s", BUILD_CXXFLAGS));
 301 #ifdef HAVE_LIBMKL
 302     /* MKL might be used for LAPACK/BLAS even if FFTs use FFTW, so keep it separate */
 303     writer->writeLine(formatString("Linked with Intel MKL version %d.%d.%d.", __INTEL_MKL__,
 304                                    __INTEL_MKL_MINOR__, __INTEL_MKL_UPDATE__));
 305 #endif
 306 #if GMX_GPU == GMX_GPU_OPENCL
 307     writer->writeLine(formatString("OpenCL include dir: %s", OPENCL_INCLUDE_DIR));
 308     writer->writeLine(formatString("OpenCL library:     %s", OPENCL_LIBRARY));
 309     writer->writeLine(formatString("OpenCL version:     %s", OPENCL_VERSION_STRING));
 310 #endif
 311 #if GMX_GPU == GMX_GPU_CUDA
 312     writer->writeLine(formatString("CUDA compiler:      %s", CUDA_COMPILER_INFO));
 313     writer->writeLine(formatString("CUDA compiler flags:%s", CUDA_COMPILER_FLAGS));
 314     writer->writeLine("CUDA driver:        " + gmx::getCudaDriverVersionString());
 315     writer->writeLine("CUDA runtime:       " + gmx::getCudaRuntimeVersionString());
 316 #endif
 317 }
 318
 319 //! \endcond
 320
 321 } // namespace
 322
 323 namespace gmx
 324 {
 325
 326 BinaryInformationSettings::BinaryInformationSettings() :
 327     bExtendedInfo_(false),
 328     bCopyright_(false),
 329     bProcessId_(false),
 330     bGeneratedByHeader_(false),
 331     prefix_(""),
 332     suffix_("")
 333 {
 334 }
 335
 336 void printBinaryInformation(FILE* fp, const IProgramContext& programContext)
 337 {
 338     TextWriter writer(fp);
 339     printBinaryInformation(&writer, programContext, BinaryInformationSettings());
 340 }
 341
 342 void printBinaryInformation(FILE*                            fp,
 343                             const IProgramContext&           programContext,
 344                             const BinaryInformationSettings& settings)
 345 {
 346     try
 347     {
 348         TextWriter writer(fp);
 349         printBinaryInformation(&writer, programContext, settings);
 350     }
 351     GMX_CATCH_ALL_AND_EXIT_WITH_FATAL_ERROR
 352 }
 353
 354 void printBinaryInformation(TextWriter*                      writer,
 355                             const IProgramContext&           programContext,
 356                             const BinaryInformationSettings& settings)
 357 {
 358     // TODO Perhaps the writer could be configured with the prefix and
 359     // suffix strings from the settings?
 360     const char* prefix          = settings.prefix_;
 361     const char* suffix          = settings.suffix_;
 362     const char* precisionString = "";
 363 #if GMX_DOUBLE
 364     precisionString = " (double precision)";
 365 #endif
 366     const char* const name = programContext.displayName();
 367     if (settings.bGeneratedByHeader_)
 368     {
 369         writer->writeLine(formatString("%sCreated by:%s", prefix, suffix));
 370     }
 371     // TODO: It would be nice to know here whether we are really running a
 372     // Gromacs binary or some other binary that is calling Gromacs; we
 373     // could then print "%s is part of GROMACS" or some alternative text.
 374     std::string title = formatString(":-) GROMACS - %s, %s%s (-:", name, gmx_version(), precisionString);
 375     const int indent =
 376             centeringOffset(78 - std::strlen(prefix) - std::strlen(suffix), title.length()) + 1;
 377     writer->writeLine(formatString("%s%*c%s%s", prefix, indent, ' ', title.c_str(), suffix));
 378     writer->writeLine(formatString("%s%s", prefix, suffix));
 379     if (settings.bCopyright_)
 380     {
 381         GMX_RELEASE_ASSERT(prefix[0] == '\0' && suffix[0] == '\0',
 382                            "Prefix/suffix not supported with copyright");
 383         printCopyright(writer);
 384         writer->ensureEmptyLine();
 385         // This line is printed again after the copyright notice to make it
 386         // appear together with all the other information, so that it is not
 387         // necessary to read stuff above the copyright notice.
 388         // The line above the copyright notice puts the copyright notice is
 389         // context, though.
 390         writer->writeLine(formatString("%sGROMACS:      %s, version %s%s%s", prefix, name,
 391                                        gmx_version(), precisionString, suffix));
 392     }
 393     const char* const binaryPath = programContext.fullBinaryPath();
 394     if (!gmx::isNullOrEmpty(binaryPath))
 395     {
 396         writer->writeLine(formatString("%sExecutable:   %s%s", prefix, binaryPath, suffix));
 397     }
 398     const gmx::InstallationPrefixInfo installPrefix = programContext.installationPrefix();
 399     if (!gmx::isNullOrEmpty(installPrefix.path))
 400     {
 401         writer->writeLine(formatString("%sData prefix:  %s%s%s", prefix, installPrefix.path,
 402                                        installPrefix.bSourceLayout ? " (source tree)" : "", suffix));
 403     }
 404     const std::string workingDir = Path::getWorkingDirectory();
 405     if (!workingDir.empty())
 406     {
 407         writer->writeLine(formatString("%sWorking dir:  %s%s", prefix, workingDir.c_str(), suffix));
 408     }
 409     if (settings.bProcessId_)
 410     {
 411         writer->writeLine(formatString("%sProcess ID:   %d%s", prefix, gmx_getpid(), suffix));
 412     }
 413     const char* const commandLine = programContext.commandLine();
 414     if (!gmx::isNullOrEmpty(commandLine))
 415     {
 416         writer->writeLine(formatString("%sCommand line:%s\n%s  %s%s", prefix, suffix, prefix,
 417                                        commandLine, suffix));
 418     }
 419     if (settings.bExtendedInfo_)
 420     {
 421         GMX_RELEASE_ASSERT(prefix[0] == '\0' && suffix[0] == '\0',
 422                            "Prefix/suffix not supported with extended info");
 423         writer->ensureEmptyLine();
 424         gmx_print_version_info(writer);
 425     }
 426 }
 427
 428 } // namespace gmx