New analysis tool to compute the free volume and total volume.
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / trajectoryanalysis / tests / freevolume.cpp
1 /*
2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3  *
4  * Copyright (c) 2013, by the GROMACS development team, led by
5  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
6  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
7  * directory and at http://www.gromacs.org.
8  *
9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
12  * of the License, or (at your option) any later version.
13  *
14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
17  * Lesser General Public License for more details.
18  *
19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
20  * License along with GROMACS; if not, see
21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
23  *
24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
25  * consider that scientific software is very special. Version
26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
30  * official version at http://www.gromacs.org.
31  *
32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
34  */
35 /*! \internal \file
36  * \brief
37  * Tests for functionality of the "angle" trajectory analysis module.
38  *
39  * \author David van der Spoel <david.vanderspoel@icm.uu.se>
40  * \ingroup module_trajectoryanalysis
41  */
42 #include <gtest/gtest.h>
43
44 #include "gromacs/trajectoryanalysis/modules/freevolume.h"
45
46 #include "testutils/cmdlinetest.h"
47
48 #include "moduletest.h"
49
50 namespace
51 {
52
53 using gmx::test::CommandLine;
54
55 /********************************************************************
56  * Tests for gmx::analysismodules::Angle.
57  */
58
59 //! Test fixture for the angle analysis module.
60 typedef gmx::test::TrajectoryAnalysisModuleTestFixture<gmx::analysismodules::FreeVolume>
61     FreeVolumeModuleTest;
62
63 TEST_F(FreeVolumeModuleTest, ComputesFreeVolume)
64 {
65     const char *const cmdline[] = {
66         "freevolume",
67         "-select", "all", "-seed", "13"
68     };
69     setTopology("freevolume.tpr");
70     setTrajectory("freevolume.xtc");
71     runTest(CommandLine::create(cmdline));
72 }
73
74 TEST_F(FreeVolumeModuleTest, ComputesFreeVolumeSelection)
75 {
76     const char *const cmdline[] = {
77         "freevolume",
78         "-select", "not resname = CO2", "-seed", "17"
79     };
80     setTopology("freevolume.tpr");
81     setTrajectory("freevolume.xtc");
82     runTest(CommandLine::create(cmdline));
83 }
84
85 } // namespace