src/gromacs/topology/residuetypes.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2010,2014, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 #ifndef GMX_TOPOLOGY_RESIDUETYPES_H
  36 #define GMX_TOPOLOGY_RESIDUETYPES_H
  37
  38 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  39
  40 #ifdef __cplusplus
  41 extern "C"
  42 {
  43 #endif
  44
  45 typedef struct gmx_residuetype_t gmx_residuetype_t;
  46
  47 int
  48 gmx_residuetype_init(gmx_residuetype_t **rt);
  49
  50 int
  51 gmx_residuetype_destroy(gmx_residuetype_t *rt);
  52
  53 int
  54 gmx_residuetype_get_type(gmx_residuetype_t *rt, const char *resname, const char **p_restype);
  55
  56 int
  57 gmx_residuetype_add(gmx_residuetype_t *rt, const char *newresname, const char *newrestype);
  58
  59 int
  60 gmx_residuetype_get_alltypes(gmx_residuetype_t   *rt,
  61                              const char        ***p_typenames,
  62                              int                 *ntypes);
  63
  64 gmx_bool
  65 gmx_residuetype_is_protein(gmx_residuetype_t *rt, const char *resnm);
  66
  67 gmx_bool
  68 gmx_residuetype_is_dna(gmx_residuetype_t *rt, const char *resnm);
  69
  70 gmx_bool
  71 gmx_residuetype_is_rna(gmx_residuetype_t *rt, const char *resnm);
  72
  73 int
  74 gmx_residuetype_get_size(gmx_residuetype_t *rt);
  75
  76 int
  77 gmx_residuetype_get_index(gmx_residuetype_t *rt, const char *resnm);
  78
  79 const char *
  80 gmx_residuetype_get_name(gmx_residuetype_t *rt, int index);
  81
  82 #ifdef __cplusplus
  83 }
  84 #endif
  85
  86 #endif