src/gromacs/topology/forcefieldparameters.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2016,2018 by the GROMACS development team.
   7  * Copyright (c) 2019,2020,2021, by the GROMACS development team, led by
   8  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   9  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
  10  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38 #include "gmxpre.h"
  39
  40 #include "forcefieldparameters.h"
  41
  42 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  43 #include "gromacs/utility/txtdump.h"
  44
  45 static void pr_cmap(FILE* fp, int indent, const char* title, const gmx_cmap_t* cmap_grid, gmx_bool bShowNumbers)
  46 {
  47     const real dx = cmap_grid->grid_spacing != 0 ? 360.0 / cmap_grid->grid_spacing : 0;
  48
  49     const int nelem = cmap_grid->grid_spacing * cmap_grid->grid_spacing;
  50
  51     if (available(fp, cmap_grid, indent, title))
  52     {
  53         fprintf(fp, "%s\n", title);
  54
  55         for (gmx::index i = 0; i < gmx::ssize(cmap_grid->cmapdata); i++)
  56         {
  57             real idx = -180.0;
  58             fprintf(fp, "%8s %8s %8s %8s\n", "V", "dVdx", "dVdy", "d2dV");
  59
  60             fprintf(fp, "grid[%3zd]={\n", bShowNumbers ? i : -1);
  61
  62             for (int j = 0; j < nelem; j++)
  63             {
  64                 if ((j % cmap_grid->grid_spacing) == 0)
  65                 {
  66                     fprintf(fp, "%8.1f\n", idx);
  67                     idx += dx;
  68                 }
  69
  70                 fprintf(fp, "%8.3f ", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j * 4]);
  71                 fprintf(fp, "%8.3f ", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j * 4 + 1]);
  72                 fprintf(fp, "%8.3f ", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j * 4 + 2]);
  73                 fprintf(fp, "%8.3f\n", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j * 4 + 3]);
  74             }
  75             fprintf(fp, "\n");
  76         }
  77     }
  78 }
  79
  80 void pr_ffparams(FILE* fp, int indent, const char* title, const gmx_ffparams_t* ffparams, gmx_bool bShowNumbers)
  81 {
  82     indent = pr_title(fp, indent, title);
  83     pr_indent(fp, indent);
  84     fprintf(fp, "atnr=%d\n", ffparams->atnr);
  85     pr_indent(fp, indent);
  86     fprintf(fp, "ntypes=%d\n", ffparams->numTypes());
  87     for (int i = 0; i < ffparams->numTypes(); i++)
  88     {
  89         pr_indent(fp, indent + INDENT);
  90         fprintf(fp,
  91                 "functype[%d]=%s, ",
  92                 bShowNumbers ? i : -1,
  93                 interaction_function[ffparams->functype[i]].name);
  94         pr_iparams(fp, ffparams->functype[i], ffparams->iparams[i]);
  95     }
  96     pr_double(fp, indent, "reppow", ffparams->reppow);
  97     pr_real(fp, indent, "fudgeQQ", ffparams->fudgeQQ);
  98     pr_cmap(fp, indent, "cmap", &ffparams->cmap_grid, bShowNumbers);
  99 }