src/gromacs/topology/forcefieldparameters.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2016,2018,2019, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37 #include "gmxpre.h"
  38
  39 #include "forcefieldparameters.h"
  40
  41 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  42 #include "gromacs/utility/txtdump.h"
  43
  44 static void pr_cmap(FILE *fp, int indent, const char *title,
  45                     const gmx_cmap_t *cmap_grid, gmx_bool bShowNumbers)
  46 {
  47     int  i, j, nelem;
  48     real dx, idx;
  49
  50     if (cmap_grid->grid_spacing != 0)
  51     {
  52         dx    = 360.0 / cmap_grid->grid_spacing;
  53     }
  54     else
  55     {
  56         dx = 0;
  57     }
  58     nelem = cmap_grid->grid_spacing*cmap_grid->grid_spacing;
  59
  60     if (available(fp, cmap_grid, indent, title))
  61     {
  62         fprintf(fp, "%s\n", title);
  63
  64         for (i = 0; i < gmx::ssize(cmap_grid->cmapdata); i++)
  65         {
  66             idx = -180.0;
  67             fprintf(fp, "%8s %8s %8s %8s\n", "V", "dVdx", "dVdy", "d2dV");
  68
  69             fprintf(fp, "grid[%3d]={\n", bShowNumbers ? i : -1);
  70
  71             for (j = 0; j < nelem; j++)
  72             {
  73                 if ( (j%cmap_grid->grid_spacing) == 0)
  74                 {
  75                     fprintf(fp, "%8.1f\n", idx);
  76                     idx += dx;
  77                 }
  78
  79                 fprintf(fp, "%8.3f ", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j*4]);
  80                 fprintf(fp, "%8.3f ", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j*4+1]);
  81                 fprintf(fp, "%8.3f ", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j*4+2]);
  82                 fprintf(fp, "%8.3f\n", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j*4+3]);
  83             }
  84             fprintf(fp, "\n");
  85         }
  86     }
  87
  88 }
  89
  90 void pr_ffparams(FILE *fp, int indent, const char *title,
  91                  const gmx_ffparams_t *ffparams,
  92                  gmx_bool bShowNumbers)
  93 {
  94     int i;
  95
  96     indent = pr_title(fp, indent, title);
  97     pr_indent(fp, indent);
  98     fprintf(fp, "atnr=%d\n", ffparams->atnr);
  99     pr_indent(fp, indent);
 100     fprintf(fp, "ntypes=%d\n", ffparams->numTypes());
 101     for (i = 0; i < ffparams->numTypes(); i++)
 102     {
 103         pr_indent(fp, indent+INDENT);
 104         fprintf(fp, "functype[%d]=%s, ",
 105                 bShowNumbers ? i : -1,
 106                 interaction_function[ffparams->functype[i]].name);
 107         pr_iparams(fp, ffparams->functype[i], &ffparams->iparams[i]);
 108     }
 109     pr_double(fp, indent, "reppow", ffparams->reppow);
 110     pr_real(fp, indent, "fudgeQQ", ffparams->fudgeQQ);
 111     pr_cmap(fp, indent, "cmap", &ffparams->cmap_grid, bShowNumbers);
 112 }