src/gromacs/topology/forcefieldparameters.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2016,2018 by the GROMACS development team.
   7  * Copyright (c) 2019,2020, by the GROMACS development team, led by
   8  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   9  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
  10  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38 #include "gmxpre.h"
  39
  40 #include "forcefieldparameters.h"
  41
  42 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  43 #include "gromacs/utility/txtdump.h"
  44
  45 static void pr_cmap(FILE* fp, int indent, const char* title, const gmx_cmap_t* cmap_grid, gmx_bool bShowNumbers)
  46 {
  47     int  j, nelem;
  48     real dx, idx;
  49
  50     if (cmap_grid->grid_spacing != 0)
  51     {
  52         dx = 360.0 / cmap_grid->grid_spacing;
  53     }
  54     else
  55     {
  56         dx = 0;
  57     }
  58     nelem = cmap_grid->grid_spacing * cmap_grid->grid_spacing;
  59
  60     if (available(fp, cmap_grid, indent, title))
  61     {
  62         fprintf(fp, "%s\n", title);
  63
  64         for (gmx::index i = 0; i < gmx::ssize(cmap_grid->cmapdata); i++)
  65         {
  66             idx = -180.0;
  67             fprintf(fp, "%8s %8s %8s %8s\n", "V", "dVdx", "dVdy", "d2dV");
  68
  69             fprintf(fp, "grid[%3zd]={\n", bShowNumbers ? i : -1);
  70
  71             for (j = 0; j < nelem; j++)
  72             {
  73                 if ((j % cmap_grid->grid_spacing) == 0)
  74                 {
  75                     fprintf(fp, "%8.1f\n", idx);
  76                     idx += dx;
  77                 }
  78
  79                 fprintf(fp, "%8.3f ", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j * 4]);
  80                 fprintf(fp, "%8.3f ", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j * 4 + 1]);
  81                 fprintf(fp, "%8.3f ", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j * 4 + 2]);
  82                 fprintf(fp, "%8.3f\n", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j * 4 + 3]);
  83             }
  84             fprintf(fp, "\n");
  85         }
  86     }
  87 }
  88
  89 void pr_ffparams(FILE* fp, int indent, const char* title, const gmx_ffparams_t* ffparams, gmx_bool bShowNumbers)
  90 {
  91     int i;
  92
  93     indent = pr_title(fp, indent, title);
  94     pr_indent(fp, indent);
  95     fprintf(fp, "atnr=%d\n", ffparams->atnr);
  96     pr_indent(fp, indent);
  97     fprintf(fp, "ntypes=%d\n", ffparams->numTypes());
  98     for (i = 0; i < ffparams->numTypes(); i++)
  99     {
 100         pr_indent(fp, indent + INDENT);
 101         fprintf(fp,
 102                 "functype[%d]=%s, ",
 103                 bShowNumbers ? i : -1,
 104                 interaction_function[ffparams->functype[i]].name);
 105         pr_iparams(fp, ffparams->functype[i], ffparams->iparams[i]);
 106     }
 107     pr_double(fp, indent, "reppow", ffparams->reppow);
 108     pr_real(fp, indent, "fudgeQQ", ffparams->fudgeQQ);
 109     pr_cmap(fp, indent, "cmap", &ffparams->cmap_grid, bShowNumbers);
 110 }