src/gromacs/topology/forcefieldparameters.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2016,2018,2019, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37 #include "gmxpre.h"
  38
  39 #include "forcefieldparameters.h"
  40
  41 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  42 #include "gromacs/utility/txtdump.h"
  43
  44 static void pr_cmap(FILE* fp, int indent, const char* title, const gmx_cmap_t* cmap_grid, gmx_bool bShowNumbers)
  45 {
  46     int  j, nelem;
  47     real dx, idx;
  48
  49     if (cmap_grid->grid_spacing != 0)
  50     {
  51         dx = 360.0 / cmap_grid->grid_spacing;
  52     }
  53     else
  54     {
  55         dx = 0;
  56     }
  57     nelem = cmap_grid->grid_spacing * cmap_grid->grid_spacing;
  58
  59     if (available(fp, cmap_grid, indent, title))
  60     {
  61         fprintf(fp, "%s\n", title);
  62
  63         for (gmx::index i = 0; i < gmx::ssize(cmap_grid->cmapdata); i++)
  64         {
  65             idx = -180.0;
  66             fprintf(fp, "%8s %8s %8s %8s\n", "V", "dVdx", "dVdy", "d2dV");
  67
  68             fprintf(fp, "grid[%3zd]={\n", bShowNumbers ? i : -1);
  69
  70             for (j = 0; j < nelem; j++)
  71             {
  72                 if ((j % cmap_grid->grid_spacing) == 0)
  73                 {
  74                     fprintf(fp, "%8.1f\n", idx);
  75                     idx += dx;
  76                 }
  77
  78                 fprintf(fp, "%8.3f ", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j * 4]);
  79                 fprintf(fp, "%8.3f ", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j * 4 + 1]);
  80                 fprintf(fp, "%8.3f ", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j * 4 + 2]);
  81                 fprintf(fp, "%8.3f\n", cmap_grid->cmapdata[i].cmap[j * 4 + 3]);
  82             }
  83             fprintf(fp, "\n");
  84         }
  85     }
  86 }
  87
  88 void pr_ffparams(FILE* fp, int indent, const char* title, const gmx_ffparams_t* ffparams, gmx_bool bShowNumbers)
  89 {
  90     int i;
  91
  92     indent = pr_title(fp, indent, title);
  93     pr_indent(fp, indent);
  94     fprintf(fp, "atnr=%d\n", ffparams->atnr);
  95     pr_indent(fp, indent);
  96     fprintf(fp, "ntypes=%d\n", ffparams->numTypes());
  97     for (i = 0; i < ffparams->numTypes(); i++)
  98     {
  99         pr_indent(fp, indent + INDENT);
 100         fprintf(fp, "functype[%d]=%s, ", bShowNumbers ? i : -1,
 101                 interaction_function[ffparams->functype[i]].name);
 102         pr_iparams(fp, ffparams->functype[i], &ffparams->iparams[i]);
 103     }
 104     pr_double(fp, indent, "reppow", ffparams->reppow);
 105     pr_real(fp, indent, "fudgeQQ", ffparams->fudgeQQ);
 106     pr_cmap(fp, indent, "cmap", &ffparams->cmap_grid, bShowNumbers);
 107 }