src/gromacs/tools/dump.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2013, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2016, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37 #include "gmxpre.h"
  38
  39 #include "config.h"
  40
  41 #include <cassert>
  42 #include <cmath>
  43 #include <cstdio>
  44 #include <cstring>
  45
  46 #include "gromacs/commandline/pargs.h"
  47 #include "gromacs/fileio/checkpoint.h"
  48 #include "gromacs/fileio/enxio.h"
  49 #include "gromacs/fileio/gmxfio.h"
  50 #include "gromacs/fileio/mtxio.h"
  51 #include "gromacs/fileio/tngio.h"
  52 #include "gromacs/fileio/tngio_for_tools.h"
  53 #include "gromacs/fileio/tpxio.h"
  54 #include "gromacs/fileio/trrio.h"
  55 #include "gromacs/fileio/xtcio.h"
  56 #include "gromacs/gmxpreprocess/gmxcpp.h"
  57 #include "gromacs/linearalgebra/sparsematrix.h"
  58 #include "gromacs/math/vecdump.h"
  59 #include "gromacs/mdtypes/forcerec.h"
  60 #include "gromacs/mdtypes/inputrec.h"
  61 #include "gromacs/mdtypes/md_enums.h"
  62 #include "gromacs/mdtypes/state.h"
  63 #include "gromacs/topology/mtop_util.h"
  64 #include "gromacs/topology/topology.h"
  65 #include "gromacs/trajectory/trajectoryframe.h"
  66 #include "gromacs/utility/arraysize.h"
  67 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  68 #include "gromacs/utility/fatalerror.h"
  69 #include "gromacs/utility/futil.h"
  70 #include "gromacs/utility/smalloc.h"
  71 #include "gromacs/utility/txtdump.h"
  72
  73 static void list_tpx(const char *fn, gmx_bool bShowNumbers, const char *mdpfn,
  74                      gmx_bool bSysTop)
  75 {
  76     FILE         *gp;
  77     int           indent, i, j, **gcount, atot;
  78     t_state       state;
  79     t_inputrec    ir;
  80     t_tpxheader   tpx;
  81     gmx_mtop_t    mtop;
  82     gmx_groups_t *groups;
  83     t_topology    top;
  84
  85     read_tpxheader(fn, &tpx, TRUE);
  86
  87     read_tpx_state(fn,
  88                    tpx.bIr  ? &ir : NULL,
  89                    &state,
  90                    tpx.bTop ? &mtop : NULL);
  91
  92     if (mdpfn && tpx.bIr)
  93     {
  94         gp = gmx_fio_fopen(mdpfn, "w");
  95         pr_inputrec(gp, 0, NULL, &(ir), TRUE);
  96         gmx_fio_fclose(gp);
  97     }
  98
  99     if (!mdpfn)
 100     {
 101         if (bSysTop)
 102         {
 103             top = gmx_mtop_t_to_t_topology(&mtop);
 104         }
 105
 106         if (available(stdout, &tpx, 0, fn))
 107         {
 108             indent = 0;
 109             pr_title(stdout, indent, fn);
 110             pr_inputrec(stdout, 0, "inputrec", tpx.bIr ? &(ir) : NULL, FALSE);
 111
 112             pr_tpxheader(stdout, indent, "header", &(tpx));
 113
 114             if (!bSysTop)
 115             {
 116                 pr_mtop(stdout, indent, "topology", &(mtop), bShowNumbers);
 117             }
 118             else
 119             {
 120                 pr_top(stdout, indent, "topology", &(top), bShowNumbers);
 121             }
 122
 123             pr_rvecs(stdout, indent, "box", tpx.bBox ? state.box : NULL, DIM);
 124             pr_rvecs(stdout, indent, "box_rel", tpx.bBox ? state.box_rel : NULL, DIM);
 125             pr_rvecs(stdout, indent, "boxv", tpx.bBox ? state.boxv : NULL, DIM);
 126             pr_rvecs(stdout, indent, "pres_prev", tpx.bBox ? state.pres_prev : NULL, DIM);
 127             pr_rvecs(stdout, indent, "svir_prev", tpx.bBox ? state.svir_prev : NULL, DIM);
 128             pr_rvecs(stdout, indent, "fvir_prev", tpx.bBox ? state.fvir_prev : NULL, DIM);
 129             /* leave nosehoover_xi in for now to match the tpr version */
 130             pr_doubles(stdout, indent, "nosehoover_xi", state.nosehoover_xi, state.ngtc);
 131             /*pr_doubles(stdout,indent,"nosehoover_vxi",state.nosehoover_vxi,state.ngtc);*/
 132             /*pr_doubles(stdout,indent,"therm_integral",state.therm_integral,state.ngtc);*/
 133             pr_rvecs(stdout, indent, "x", tpx.bX ? state.x : NULL, state.natoms);
 134             pr_rvecs(stdout, indent, "v", tpx.bV ? state.v : NULL, state.natoms);
 135         }
 136
 137         groups = &mtop.groups;
 138
 139         snew(gcount, egcNR);
 140         for (i = 0; (i < egcNR); i++)
 141         {
 142             snew(gcount[i], groups->grps[i].nr);
 143         }
 144
 145         for (i = 0; (i < mtop.natoms); i++)
 146         {
 147             for (j = 0; (j < egcNR); j++)
 148             {
 149                 gcount[j][ggrpnr(groups, j, i)]++;
 150             }
 151         }
 152         printf("Group statistics\n");
 153         for (i = 0; (i < egcNR); i++)
 154         {
 155             atot = 0;
 156             printf("%-12s: ", gtypes[i]);
 157             for (j = 0; (j < groups->grps[i].nr); j++)
 158             {
 159                 printf("  %5d", gcount[i][j]);
 160                 atot += gcount[i][j];
 161             }
 162             printf("  (total %d atoms)\n", atot);
 163             sfree(gcount[i]);
 164         }
 165         sfree(gcount);
 166     }
 167     done_state(&state);
 168 }
 169
 170 static void list_top(const char *fn)
 171 {
 172     int       status, done;
 173 #define BUFLEN 256
 174     char      buf[BUFLEN];
 175     gmx_cpp_t handle;
 176     char     *cppopts[] = { NULL };
 177
 178     status = cpp_open_file(fn, &handle, cppopts);
 179     if (status != 0)
 180     {
 181         gmx_fatal(FARGS, cpp_error(&handle, status));
 182     }
 183     do
 184     {
 185         status = cpp_read_line(&handle, BUFLEN, buf);
 186         done   = (status == eCPP_EOF);
 187         if (!done)
 188         {
 189             if (status != eCPP_OK)
 190             {
 191                 gmx_fatal(FARGS, cpp_error(&handle, status));
 192             }
 193             else
 194             {
 195                 printf("%s\n", buf);
 196             }
 197         }
 198     }
 199     while (!done);
 200     status = cpp_close_file(&handle);
 201     if (status != eCPP_OK)
 202     {
 203         gmx_fatal(FARGS, cpp_error(&handle, status));
 204     }
 205 }
 206
 207 static void list_trr(const char *fn)
 208 {
 209     t_fileio         *fpread;
 210     int               nframe, indent;
 211     char              buf[256];
 212     rvec             *x, *v, *f;
 213     matrix            box;
 214     gmx_trr_header_t  trrheader;
 215     gmx_bool          bOK;
 216
 217     fpread  = gmx_trr_open(fn, "r");
 218
 219     nframe = 0;
 220     while (gmx_trr_read_frame_header(fpread, &trrheader, &bOK))
 221     {
 222         snew(x, trrheader.natoms);
 223         snew(v, trrheader.natoms);
 224         snew(f, trrheader.natoms);
 225         if (gmx_trr_read_frame_data(fpread, &trrheader,
 226                                     trrheader.box_size ? box : NULL,
 227                                     trrheader.x_size   ? x : NULL,
 228                                     trrheader.v_size   ? v : NULL,
 229                                     trrheader.f_size   ? f : NULL))
 230         {
 231             sprintf(buf, "%s frame %d", fn, nframe);
 232             indent = 0;
 233             indent = pr_title(stdout, indent, buf);
 234             pr_indent(stdout, indent);
 235             fprintf(stdout, "natoms=%10d  step=%10" GMX_PRId64 "  time=%12.7e  lambda=%10g\n",
 236                     trrheader.natoms, trrheader.step, trrheader.t, trrheader.lambda);
 237             if (trrheader.box_size)
 238             {
 239                 pr_rvecs(stdout, indent, "box", box, DIM);
 240             }
 241             if (trrheader.x_size)
 242             {
 243                 pr_rvecs(stdout, indent, "x", x, trrheader.natoms);
 244             }
 245             if (trrheader.v_size)
 246             {
 247                 pr_rvecs(stdout, indent, "v", v, trrheader.natoms);
 248             }
 249             if (trrheader.f_size)
 250             {
 251                 pr_rvecs(stdout, indent, "f", f, trrheader.natoms);
 252             }
 253         }
 254         else
 255         {
 256             fprintf(stderr, "\nWARNING: Incomplete frame: nr %d, t=%g\n",
 257                     nframe, trrheader.t);
 258         }
 259
 260         sfree(x);
 261         sfree(v);
 262         sfree(f);
 263         nframe++;
 264     }
 265     if (!bOK)
 266     {
 267         fprintf(stderr, "\nWARNING: Incomplete frame header: nr %d, t=%g\n",
 268                 nframe, trrheader.t);
 269     }
 270     gmx_trr_close(fpread);
 271 }
 272
 273 void list_xtc(const char *fn)
 274 {
 275     t_fileio   *xd;
 276     int         indent;
 277     char        buf[256];
 278     rvec       *x;
 279     matrix      box;
 280     int         nframe, natoms;
 281     gmx_int64_t step;
 282     real        prec, time;
 283     gmx_bool    bOK;
 284
 285     xd = open_xtc(fn, "r");
 286     read_first_xtc(xd, &natoms, &step, &time, box, &x, &prec, &bOK);
 287
 288     nframe = 0;
 289     do
 290     {
 291         sprintf(buf, "%s frame %d", fn, nframe);
 292         indent = 0;
 293         indent = pr_title(stdout, indent, buf);
 294         pr_indent(stdout, indent);
 295         fprintf(stdout, "natoms=%10d  step=%10" GMX_PRId64 "  time=%12.7e  prec=%10g\n",
 296                 natoms, step, time, prec);
 297         pr_rvecs(stdout, indent, "box", box, DIM);
 298         pr_rvecs(stdout, indent, "x", x, natoms);
 299         nframe++;
 300     }
 301     while (read_next_xtc(xd, natoms, &step, &time, box, x, &prec, &bOK));
 302     if (!bOK)
 303     {
 304         fprintf(stderr, "\nWARNING: Incomplete frame at time %g\n", time);
 305     }
 306     sfree(x);
 307     close_xtc(xd);
 308 }
 309
 310 /*! \brief Callback used by list_tng_for_gmx_dump. */
 311 static void list_tng_inner(const char *fn,
 312                            gmx_bool    bFirstFrame,
 313                            real       *values,
 314                            gmx_int64_t step,
 315                            double      frame_time,
 316                            gmx_int64_t n_values_per_frame,
 317                            gmx_int64_t n_atoms,
 318                            real        prec,
 319                            gmx_int64_t nframe,
 320                            char       *block_name)
 321 {
 322     char                 buf[256];
 323     int                  indent = 0;
 324
 325     if (bFirstFrame)
 326     {
 327         sprintf(buf, "%s frame %" GMX_PRId64, fn, nframe);
 328         indent = 0;
 329         indent = pr_title(stdout, indent, buf);
 330         pr_indent(stdout, indent);
 331         fprintf(stdout, "natoms=%10" GMX_PRId64 "  step=%10" GMX_PRId64 "  time=%12.7e",
 332                 n_atoms, step, frame_time);
 333         if (prec > 0)
 334         {
 335             fprintf(stdout, "  prec=%10g", prec);
 336         }
 337         fprintf(stdout, "\n");
 338     }
 339     pr_reals_of_dim(stdout, indent, block_name, values, n_atoms, n_values_per_frame);
 340 }
 341
 342 static void list_tng(const char gmx_unused *fn)
 343 {
 344 #ifdef GMX_USE_TNG
 345     tng_trajectory_t     tng;
 346     gmx_int64_t          nframe = 0;
 347     gmx_int64_t          i, *block_ids = NULL, step, ndatablocks;
 348     gmx_bool             bOK;
 349     real                *values = NULL;
 350
 351     gmx_tng_open(fn, 'r', &tng);
 352     gmx_print_tng_molecule_system(tng, stdout);
 353
 354     bOK    = gmx_get_tng_data_block_types_of_next_frame(tng, -1,
 355                                                         0,
 356                                                         NULL,
 357                                                         &step, &ndatablocks,
 358                                                         &block_ids);
 359     do
 360     {
 361         for (i = 0; i < ndatablocks; i++)
 362         {
 363             double               frame_time;
 364             real                 prec;
 365             gmx_int64_t          n_values_per_frame, n_atoms;
 366             char                 block_name[STRLEN];
 367
 368             gmx_get_tng_data_next_frame_of_block_type(tng, block_ids[i], &values,
 369                                                       &step, &frame_time,
 370                                                       &n_values_per_frame, &n_atoms,
 371                                                       &prec,
 372                                                       block_name, STRLEN, &bOK);
 373             if (!bOK)
 374             {
 375                 /* Can't write any output because we don't know what
 376                    arrays are valid. */
 377                 fprintf(stderr, "\nWARNING: Incomplete frame at time %g, will not write output\n", frame_time);
 378             }
 379             else
 380             {
 381                 list_tng_inner(fn, (0 == i), values, step, frame_time,
 382                                n_values_per_frame, n_atoms, prec, nframe, block_name);
 383             }
 384         }
 385         nframe++;
 386     }
 387     while (gmx_get_tng_data_block_types_of_next_frame(tng, step,
 388                                                       0,
 389                                                       NULL,
 390                                                       &step,
 391                                                       &ndatablocks,
 392                                                       &block_ids));
 393
 394     if (block_ids)
 395     {
 396         sfree(block_ids);
 397     }
 398     sfree(values);
 399     gmx_tng_close(&tng);
 400 #endif
 401 }
 402
 403 void list_trx(const char *fn)
 404 {
 405     switch (fn2ftp(fn))
 406     {
 407         case efXTC:
 408             list_xtc(fn);
 409             break;
 410         case efTRR:
 411             list_trr(fn);
 412             break;
 413         case efTNG:
 414             list_tng(fn);
 415             break;
 416         default:
 417             fprintf(stderr, "File %s is of an unsupported type. Try using the command\n 'less %s'\n",
 418                     fn, fn);
 419     }
 420 }
 421
 422 void list_ene(const char *fn)
 423 {
 424     ener_file_t    in;
 425     gmx_bool       bCont;
 426     gmx_enxnm_t   *enm = NULL;
 427     t_enxframe    *fr;
 428     int            i, j, nre, b;
 429     char           buf[22];
 430
 431     printf("gmx dump: %s\n", fn);
 432     in = open_enx(fn, "r");
 433     do_enxnms(in, &nre, &enm);
 434     assert(enm);
 435
 436     printf("energy components:\n");
 437     for (i = 0; (i < nre); i++)
 438     {
 439         printf("%5d  %-24s (%s)\n", i, enm[i].name, enm[i].unit);
 440     }
 441
 442     snew(fr, 1);
 443     do
 444     {
 445         bCont = do_enx(in, fr);
 446
 447         if (bCont)
 448         {
 449             printf("\n%24s  %12.5e  %12s  %12s\n", "time:",
 450                    fr->t, "step:", gmx_step_str(fr->step, buf));
 451             printf("%24s  %12s  %12s  %12s\n",
 452                    "", "", "nsteps:", gmx_step_str(fr->nsteps, buf));
 453             printf("%24s  %12.5e  %12s  %12s\n",
 454                    "delta_t:", fr->dt, "sum steps:", gmx_step_str(fr->nsum, buf));
 455             if (fr->nre == nre)
 456             {
 457                 printf("%24s  %12s  %12s  %12s\n",
 458                        "Component", "Energy", "Av. Energy", "Sum Energy");
 459                 if (fr->nsum > 0)
 460                 {
 461                     for (i = 0; (i < nre); i++)
 462                     {
 463                         printf("%24s  %12.5e  %12.5e  %12.5e\n",
 464                                enm[i].name, fr->ener[i].e, fr->ener[i].eav,
 465                                fr->ener[i].esum);
 466                     }
 467                 }
 468                 else
 469                 {
 470                     for (i = 0; (i < nre); i++)
 471                     {
 472                         printf("%24s  %12.5e\n",
 473                                enm[i].name, fr->ener[i].e);
 474                     }
 475                 }
 476             }
 477             for (b = 0; b < fr->nblock; b++)
 478             {
 479                 const char *typestr = "";
 480
 481                 t_enxblock *eb = &(fr->block[b]);
 482                 printf("Block data %2d (%3d subblocks, id=%d)\n",
 483                        b, eb->nsub, eb->id);
 484
 485                 if (eb->id < enxNR)
 486                 {
 487                     typestr = enx_block_id_name[eb->id];
 488                 }
 489                 printf("  id='%s'\n", typestr);
 490                 for (i = 0; i < eb->nsub; i++)
 491                 {
 492                     t_enxsubblock *sb = &(eb->sub[i]);
 493                     printf("  Sub block %3d (%5d elems, type=%s) values:\n",
 494                            i, sb->nr, xdr_datatype_names[sb->type]);
 495
 496                     switch (sb->type)
 497                     {
 498                         case xdr_datatype_float:
 499                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 500                             {
 501                                 printf("%14d   %8.4f\n", j, sb->fval[j]);
 502                             }
 503                             break;
 504                         case xdr_datatype_double:
 505                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 506                             {
 507                                 printf("%14d   %10.6f\n", j, sb->dval[j]);
 508                             }
 509                             break;
 510                         case xdr_datatype_int:
 511                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 512                             {
 513                                 printf("%14d %10d\n", j, sb->ival[j]);
 514                             }
 515                             break;
 516                         case xdr_datatype_int64:
 517                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 518                             {
 519                                 printf("%14d %s\n",
 520                                        j, gmx_step_str(sb->lval[j], buf));
 521                             }
 522                             break;
 523                         case xdr_datatype_char:
 524                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 525                             {
 526                                 printf("%14d %1c\n", j, sb->cval[j]);
 527                             }
 528                             break;
 529                         case xdr_datatype_string:
 530                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 531                             {
 532                                 printf("%14d %80s\n", j, sb->sval[j]);
 533                             }
 534                             break;
 535                         default:
 536                             gmx_incons("Unknown subblock type");
 537                     }
 538                 }
 539             }
 540         }
 541     }
 542     while (bCont);
 543
 544     close_enx(in);
 545
 546     free_enxframe(fr);
 547     sfree(fr);
 548     sfree(enm);
 549 }
 550
 551 static void list_mtx(const char *fn)
 552 {
 553     int                  nrow, ncol, i, j, k;
 554     real                *full   = NULL, value;
 555     gmx_sparsematrix_t * sparse = NULL;
 556
 557     gmx_mtxio_read(fn, &nrow, &ncol, &full, &sparse);
 558
 559     if (full == NULL)
 560     {
 561         snew(full, nrow*ncol);
 562         for (i = 0; i < nrow*ncol; i++)
 563         {
 564             full[i] = 0;
 565         }
 566
 567         for (i = 0; i < sparse->nrow; i++)
 568         {
 569             for (j = 0; j < sparse->ndata[i]; j++)
 570             {
 571                 k              = sparse->data[i][j].col;
 572                 value          = sparse->data[i][j].value;
 573                 full[i*ncol+k] = value;
 574                 full[k*ncol+i] = value;
 575             }
 576         }
 577         gmx_sparsematrix_destroy(sparse);
 578     }
 579
 580     printf("%d %d\n", nrow, ncol);
 581     for (i = 0; i < nrow; i++)
 582     {
 583         for (j = 0; j < ncol; j++)
 584         {
 585             printf(" %g", full[i*ncol+j]);
 586         }
 587         printf("\n");
 588     }
 589
 590     sfree(full);
 591 }
 592
 593 int gmx_dump(int argc, char *argv[])
 594 {
 595     const char *desc[] = {
 596         "[THISMODULE] reads a run input file ([REF].tpr[ref]),",
 597         "a trajectory ([REF].trr[ref]/[REF].xtc[ref]/[TT]/tng[tt]), an energy",
 598         "file ([REF].edr[ref]) or a checkpoint file ([REF].cpt[ref])",
 599         "and prints that to standard output in a readable format.",
 600         "This program is essential for checking your run input file in case of",
 601         "problems.[PAR]",
 602         "The program can also preprocess a topology to help finding problems.",
 603         "Note that currently setting [TT]GMXLIB[tt] is the only way to customize",
 604         "directories used for searching include files.",
 605     };
 606     const char *bugs[] = {
 607         "Position restraint output from -sys -s is broken"
 608     };
 609     t_filenm    fnm[] = {
 610         { efTPR, "-s", NULL, ffOPTRD },
 611         { efTRX, "-f", NULL, ffOPTRD },
 612         { efEDR, "-e", NULL, ffOPTRD },
 613         { efCPT, NULL, NULL, ffOPTRD },
 614         { efTOP, "-p", NULL, ffOPTRD },
 615         { efMTX, "-mtx", "hessian", ffOPTRD },
 616         { efMDP, "-om", NULL, ffOPTWR }
 617     };
 618 #define NFILE asize(fnm)
 619
 620     gmx_output_env_t *oenv;
 621     /* Command line options */
 622     static gmx_bool   bShowNumbers = TRUE;
 623     static gmx_bool   bSysTop      = FALSE;
 624     t_pargs           pa[]         = {
 625         { "-nr", FALSE, etBOOL, {&bShowNumbers}, "Show index numbers in output (leaving them out makes comparison easier, but creates a useless topology)" },
 626         { "-sys", FALSE, etBOOL, {&bSysTop}, "List the atoms and bonded interactions for the whole system instead of for each molecule type" }
 627     };
 628
 629     if (!parse_common_args(&argc, argv, 0, NFILE, fnm, asize(pa), pa,
 630                            asize(desc), desc, asize(bugs), bugs, &oenv))
 631     {
 632         return 0;
 633     }
 634
 635
 636     if (ftp2bSet(efTPR, NFILE, fnm))
 637     {
 638         list_tpx(ftp2fn(efTPR, NFILE, fnm), bShowNumbers,
 639                  ftp2fn_null(efMDP, NFILE, fnm), bSysTop);
 640     }
 641     else if (ftp2bSet(efTRX, NFILE, fnm))
 642     {
 643         list_trx(ftp2fn(efTRX, NFILE, fnm));
 644     }
 645     else if (ftp2bSet(efEDR, NFILE, fnm))
 646     {
 647         list_ene(ftp2fn(efEDR, NFILE, fnm));
 648     }
 649     else if (ftp2bSet(efCPT, NFILE, fnm))
 650     {
 651         list_checkpoint(ftp2fn(efCPT, NFILE, fnm), stdout);
 652     }
 653     else if (ftp2bSet(efTOP, NFILE, fnm))
 654     {
 655         list_top(ftp2fn(efTOP, NFILE, fnm));
 656     }
 657     else if (ftp2bSet(efMTX, NFILE, fnm))
 658     {
 659         list_mtx(ftp2fn(efMTX, NFILE, fnm));
 660     }
 661
 662     return 0;
 663 }