src/gromacs/tools/dump.c

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2013, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37 #include "config.h"
  38
  39 #include <assert.h>
  40 #include <math.h>
  41 #include <stdio.h>
  42 #include <string.h>
  43
  44 #include "macros.h"
  45 #include "txtdump.h"
  46 #include "names.h"
  47 #include "txtdump.h"
  48 #include "checkpoint.h"
  49 #include "gromacs/topology/mtop_util.h"
  50 #include "gromacs/fileio/xtcio.h"
  51 #include "gromacs/fileio/enxio.h"
  52 #include "gromacs/fileio/gmxfio.h"
  53 #include "gromacs/fileio/tpxio.h"
  54 #include "gromacs/fileio/trnio.h"
  55 #include "gromacs/utility/futil.h"
  56 #include "gromacs/fileio/tngio.h"
  57 #include "gromacs/fileio/tngio_for_tools.h"
  58
  59 #ifdef HAVE_UNISTD_H
  60 #include <unistd.h>
  61 #endif
  62
  63 #include "gromacs/commandline/pargs.h"
  64 #include "gromacs/fileio/mtxio.h"
  65 #include "gromacs/gmxpreprocess/gmxcpp.h"
  66 #include "gromacs/linearalgebra/sparsematrix.h"
  67 #include "gromacs/utility/fatalerror.h"
  68 #include "gromacs/utility/smalloc.h"
  69
  70 static void list_tpx(const char *fn, gmx_bool bShowNumbers, const char *mdpfn,
  71                      gmx_bool bSysTop)
  72 {
  73     FILE         *gp;
  74     int           fp, indent, i, j, **gcount, atot;
  75     t_state       state;
  76     rvec         *f = NULL;
  77     t_inputrec    ir;
  78     t_tpxheader   tpx;
  79     gmx_mtop_t    mtop;
  80     gmx_groups_t *groups;
  81     t_topology    top;
  82
  83     read_tpxheader(fn, &tpx, TRUE, NULL, NULL);
  84
  85     read_tpx_state(fn,
  86                    tpx.bIr  ? &ir : NULL,
  87                    &state, tpx.bF ? f : NULL,
  88                    tpx.bTop ? &mtop : NULL);
  89
  90     if (mdpfn && tpx.bIr)
  91     {
  92         gp = gmx_fio_fopen(mdpfn, "w");
  93         pr_inputrec(gp, 0, NULL, &(ir), TRUE);
  94         gmx_fio_fclose(gp);
  95     }
  96
  97     if (!mdpfn)
  98     {
  99         if (bSysTop)
 100         {
 101             top = gmx_mtop_t_to_t_topology(&mtop);
 102         }
 103
 104         if (available(stdout, &tpx, 0, fn))
 105         {
 106             indent = 0;
 107             indent = pr_title(stdout, indent, fn);
 108             pr_inputrec(stdout, 0, "inputrec", tpx.bIr ? &(ir) : NULL, FALSE);
 109
 110             indent = 0;
 111             pr_header(stdout, indent, "header", &(tpx));
 112
 113             if (!bSysTop)
 114             {
 115                 pr_mtop(stdout, indent, "topology", &(mtop), bShowNumbers);
 116             }
 117             else
 118             {
 119                 pr_top(stdout, indent, "topology", &(top), bShowNumbers);
 120             }
 121
 122             pr_rvecs(stdout, indent, "box", tpx.bBox ? state.box : NULL, DIM);
 123             pr_rvecs(stdout, indent, "box_rel", tpx.bBox ? state.box_rel : NULL, DIM);
 124             pr_rvecs(stdout, indent, "boxv", tpx.bBox ? state.boxv : NULL, DIM);
 125             pr_rvecs(stdout, indent, "pres_prev", tpx.bBox ? state.pres_prev : NULL, DIM);
 126             pr_rvecs(stdout, indent, "svir_prev", tpx.bBox ? state.svir_prev : NULL, DIM);
 127             pr_rvecs(stdout, indent, "fvir_prev", tpx.bBox ? state.fvir_prev : NULL, DIM);
 128             /* leave nosehoover_xi in for now to match the tpr version */
 129             pr_doubles(stdout, indent, "nosehoover_xi", state.nosehoover_xi, state.ngtc);
 130             /*pr_doubles(stdout,indent,"nosehoover_vxi",state.nosehoover_vxi,state.ngtc);*/
 131             /*pr_doubles(stdout,indent,"therm_integral",state.therm_integral,state.ngtc);*/
 132             pr_rvecs(stdout, indent, "x", tpx.bX ? state.x : NULL, state.natoms);
 133             pr_rvecs(stdout, indent, "v", tpx.bV ? state.v : NULL, state.natoms);
 134             if (tpx.bF)
 135             {
 136                 pr_rvecs(stdout, indent, "f", f, state.natoms);
 137             }
 138         }
 139
 140         groups = &mtop.groups;
 141
 142         snew(gcount, egcNR);
 143         for (i = 0; (i < egcNR); i++)
 144         {
 145             snew(gcount[i], groups->grps[i].nr);
 146         }
 147
 148         for (i = 0; (i < mtop.natoms); i++)
 149         {
 150             for (j = 0; (j < egcNR); j++)
 151             {
 152                 gcount[j][ggrpnr(groups, j, i)]++;
 153             }
 154         }
 155         printf("Group statistics\n");
 156         for (i = 0; (i < egcNR); i++)
 157         {
 158             atot = 0;
 159             printf("%-12s: ", gtypes[i]);
 160             for (j = 0; (j < groups->grps[i].nr); j++)
 161             {
 162                 printf("  %5d", gcount[i][j]);
 163                 atot += gcount[i][j];
 164             }
 165             printf("  (total %d atoms)\n", atot);
 166             sfree(gcount[i]);
 167         }
 168         sfree(gcount);
 169     }
 170     done_state(&state);
 171     sfree(f);
 172 }
 173
 174 static void list_top(const char *fn)
 175 {
 176     int       status, done;
 177 #define BUFLEN 256
 178     char      buf[BUFLEN];
 179     gmx_cpp_t handle;
 180     char     *cppopts[] = { NULL };
 181
 182     status = cpp_open_file(fn, &handle, cppopts);
 183     if (status != 0)
 184     {
 185         gmx_fatal(FARGS, cpp_error(&handle, status));
 186     }
 187     do
 188     {
 189         status = cpp_read_line(&handle, BUFLEN, buf);
 190         done   = (status == eCPP_EOF);
 191         if (!done)
 192         {
 193             if (status != eCPP_OK)
 194             {
 195                 gmx_fatal(FARGS, cpp_error(&handle, status));
 196             }
 197             else
 198             {
 199                 printf("%s\n", buf);
 200             }
 201         }
 202     }
 203     while (!done);
 204     status = cpp_close_file(&handle);
 205     if (status != eCPP_OK)
 206     {
 207         gmx_fatal(FARGS, cpp_error(&handle, status));
 208     }
 209 }
 210
 211 static void list_trn(const char *fn)
 212 {
 213     t_fileio       *fpread, *fpwrite;
 214     int             nframe, indent;
 215     char            buf[256];
 216     rvec           *x, *v, *f;
 217     matrix          box;
 218     t_trnheader     trn;
 219     gmx_bool        bOK;
 220
 221     fpread  = open_trn(fn, "r");
 222     fpwrite = open_tpx(NULL, "w");
 223     gmx_fio_setdebug(fpwrite, TRUE);
 224
 225     nframe = 0;
 226     while (fread_trnheader(fpread, &trn, &bOK))
 227     {
 228         snew(x, trn.natoms);
 229         snew(v, trn.natoms);
 230         snew(f, trn.natoms);
 231         if (fread_htrn(fpread, &trn,
 232                        trn.box_size ? box : NULL,
 233                        trn.x_size   ? x : NULL,
 234                        trn.v_size   ? v : NULL,
 235                        trn.f_size   ? f : NULL))
 236         {
 237             sprintf(buf, "%s frame %d", fn, nframe);
 238             indent = 0;
 239             indent = pr_title(stdout, indent, buf);
 240             pr_indent(stdout, indent);
 241             fprintf(stdout, "natoms=%10d  step=%10d  time=%12.7e  lambda=%10g\n",
 242                     trn.natoms, trn.step, trn.t, trn.lambda);
 243             if (trn.box_size)
 244             {
 245                 pr_rvecs(stdout, indent, "box", box, DIM);
 246             }
 247             if (trn.x_size)
 248             {
 249                 pr_rvecs(stdout, indent, "x", x, trn.natoms);
 250             }
 251             if (trn.v_size)
 252             {
 253                 pr_rvecs(stdout, indent, "v", v, trn.natoms);
 254             }
 255             if (trn.f_size)
 256             {
 257                 pr_rvecs(stdout, indent, "f", f, trn.natoms);
 258             }
 259         }
 260         else
 261         {
 262             fprintf(stderr, "\nWARNING: Incomplete frame: nr %d, t=%g\n",
 263                     nframe, trn.t);
 264         }
 265
 266         sfree(x);
 267         sfree(v);
 268         sfree(f);
 269         nframe++;
 270     }
 271     if (!bOK)
 272     {
 273         fprintf(stderr, "\nWARNING: Incomplete frame header: nr %d, t=%g\n",
 274                 nframe, trn.t);
 275     }
 276     close_tpx(fpwrite);
 277     close_trn(fpread);
 278 }
 279
 280 void list_xtc(const char *fn)
 281 {
 282     t_fileio  *xd;
 283     int        indent;
 284     char       buf[256];
 285     rvec      *x;
 286     matrix     box;
 287     int        nframe, natoms, step;
 288     real       prec, time;
 289     gmx_bool   bOK;
 290
 291     xd = open_xtc(fn, "r");
 292     read_first_xtc(xd, &natoms, &step, &time, box, &x, &prec, &bOK);
 293
 294     nframe = 0;
 295     do
 296     {
 297         sprintf(buf, "%s frame %d", fn, nframe);
 298         indent = 0;
 299         indent = pr_title(stdout, indent, buf);
 300         pr_indent(stdout, indent);
 301         fprintf(stdout, "natoms=%10d  step=%10d  time=%12.7e  prec=%10g\n",
 302                 natoms, step, time, prec);
 303         pr_rvecs(stdout, indent, "box", box, DIM);
 304         pr_rvecs(stdout, indent, "x", x, natoms);
 305         nframe++;
 306     }
 307     while (read_next_xtc(xd, natoms, &step, &time, box, x, &prec, &bOK));
 308     if (!bOK)
 309     {
 310         fprintf(stderr, "\nWARNING: Incomplete frame at time %g\n", time);
 311     }
 312     sfree(x);
 313     close_xtc(xd);
 314 }
 315
 316 /*! \brief Callback used by list_tng_for_gmx_dump. */
 317 static void list_tng_inner(const char *fn,
 318                            gmx_bool    bFirstFrame,
 319                            real       *values,
 320                            gmx_int64_t step,
 321                            double      frame_time,
 322                            gmx_int64_t n_values_per_frame,
 323                            gmx_int64_t n_atoms,
 324                            real        prec,
 325                            gmx_int64_t nframe,
 326                            char       *block_name)
 327 {
 328     char                 buf[256];
 329     int                  indent = 0;
 330
 331     if (bFirstFrame)
 332     {
 333         sprintf(buf, "%s frame %" GMX_PRId64, fn, nframe);
 334         indent = 0;
 335         indent = pr_title(stdout, indent, buf);
 336         pr_indent(stdout, indent);
 337         fprintf(stdout, "natoms=%10" GMX_PRId64 "  step=%10" GMX_PRId64 "  time=%12.7e",
 338                 n_atoms, step, frame_time);
 339         if (prec > 0)
 340         {
 341             fprintf(stdout, "  prec=%10g", prec);
 342         }
 343         fprintf(stdout, "\n");
 344     }
 345     pr_reals_of_dim(stdout, indent, block_name, values, n_atoms, n_values_per_frame);
 346 }
 347
 348 static void list_tng(const char gmx_unused *fn)
 349 {
 350 #ifdef GMX_USE_TNG
 351     tng_trajectory_t     tng;
 352     gmx_int64_t          nframe = 0;
 353     gmx_int64_t          i, *block_ids = NULL, step, ndatablocks;
 354     gmx_bool             bOK;
 355
 356     gmx_tng_open(fn, 'r', &tng);
 357     gmx_print_tng_molecule_system(tng, stdout);
 358
 359     bOK    = gmx_get_tng_data_block_types_of_next_frame(tng, -1,
 360                                                         0,
 361                                                         NULL,
 362                                                         &step, &ndatablocks,
 363                                                         &block_ids);
 364     do
 365     {
 366         for (i = 0; i < ndatablocks; i++)
 367         {
 368             double               frame_time;
 369             real                 prec, *values = NULL;
 370             gmx_int64_t          n_values_per_frame, n_atoms;
 371             char                 block_name[STRLEN];
 372
 373             gmx_get_tng_data_next_frame_of_block_type(tng, block_ids[i], &values,
 374                                                       &step, &frame_time,
 375                                                       &n_values_per_frame, &n_atoms,
 376                                                       &prec,
 377                                                       block_name, STRLEN, &bOK);
 378             if (!bOK)
 379             {
 380                 /* Can't write any output because we don't know what
 381                    arrays are valid. */
 382                 fprintf(stderr, "\nWARNING: Incomplete frame at time %g, will not write output\n", frame_time);
 383             }
 384             else
 385             {
 386                 list_tng_inner(fn, (0 == i), values, step, frame_time,
 387                                n_values_per_frame, n_atoms, prec, nframe, block_name);
 388             }
 389         }
 390         nframe++;
 391     }
 392     while (gmx_get_tng_data_block_types_of_next_frame(tng, step,
 393                                                       0,
 394                                                       NULL,
 395                                                       &step,
 396                                                       &ndatablocks,
 397                                                       &block_ids));
 398
 399     if (block_ids)
 400     {
 401         sfree(block_ids);
 402     }
 403
 404     gmx_tng_close(&tng);
 405 #endif
 406 }
 407
 408 void list_trx(const char *fn)
 409 {
 410     int ftp;
 411
 412     ftp = fn2ftp(fn);
 413     if (ftp == efXTC)
 414     {
 415         list_xtc(fn);
 416     }
 417     else if ((ftp == efTRR) || (ftp == efTRJ))
 418     {
 419         list_trn(fn);
 420     }
 421     else if (ftp == efTNG)
 422     {
 423         list_tng(fn);
 424     }
 425     else
 426     {
 427         fprintf(stderr, "File %s is of an unsupported type. Try using the command\n 'less %s'\n",
 428                 fn, fn);
 429     }
 430 }
 431
 432 void list_ene(const char *fn)
 433 {
 434     int            ndr;
 435     ener_file_t    in;
 436     gmx_bool       bCont;
 437     gmx_enxnm_t   *enm = NULL;
 438     t_enxframe    *fr;
 439     int            i, j, nre, b;
 440     real           rav, minthird;
 441     char           buf[22];
 442
 443     printf("gmx dump: %s\n", fn);
 444     in = open_enx(fn, "r");
 445     do_enxnms(in, &nre, &enm);
 446     assert(enm);
 447
 448     printf("energy components:\n");
 449     for (i = 0; (i < nre); i++)
 450     {
 451         printf("%5d  %-24s (%s)\n", i, enm[i].name, enm[i].unit);
 452     }
 453
 454     minthird = -1.0/3.0;
 455     snew(fr, 1);
 456     do
 457     {
 458         bCont = do_enx(in, fr);
 459
 460         if (bCont)
 461         {
 462             printf("\n%24s  %12.5e  %12s  %12s\n", "time:",
 463                    fr->t, "step:", gmx_step_str(fr->step, buf));
 464             printf("%24s  %12s  %12s  %12s\n",
 465                    "", "", "nsteps:", gmx_step_str(fr->nsteps, buf));
 466             printf("%24s  %12.5e  %12s  %12s\n",
 467                    "delta_t:", fr->dt, "sum steps:", gmx_step_str(fr->nsum, buf));
 468             if (fr->nre == nre)
 469             {
 470                 printf("%24s  %12s  %12s  %12s\n",
 471                        "Component", "Energy", "Av. Energy", "Sum Energy");
 472                 if (fr->nsum > 0)
 473                 {
 474                     for (i = 0; (i < nre); i++)
 475                     {
 476                         printf("%24s  %12.5e  %12.5e  %12.5e\n",
 477                                enm[i].name, fr->ener[i].e, fr->ener[i].eav,
 478                                fr->ener[i].esum);
 479                     }
 480                 }
 481                 else
 482                 {
 483                     for (i = 0; (i < nre); i++)
 484                     {
 485                         printf("%24s  %12.5e\n",
 486                                enm[i].name, fr->ener[i].e);
 487                     }
 488                 }
 489             }
 490             for (b = 0; b < fr->nblock; b++)
 491             {
 492                 const char *typestr = "";
 493
 494                 t_enxblock *eb = &(fr->block[b]);
 495                 printf("Block data %2d (%3d subblocks, id=%d)\n",
 496                        b, eb->nsub, eb->id);
 497
 498                 if (eb->id < enxNR)
 499                 {
 500                     typestr = enx_block_id_name[eb->id];
 501                 }
 502                 printf("  id='%s'\n", typestr);
 503                 for (i = 0; i < eb->nsub; i++)
 504                 {
 505                     t_enxsubblock *sb = &(eb->sub[i]);
 506                     printf("  Sub block %3d (%5d elems, type=%s) values:\n",
 507                            i, sb->nr, xdr_datatype_names[sb->type]);
 508
 509                     switch (sb->type)
 510                     {
 511                         case xdr_datatype_float:
 512                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 513                             {
 514                                 printf("%14d   %8.4f\n", j, sb->fval[j]);
 515                             }
 516                             break;
 517                         case xdr_datatype_double:
 518                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 519                             {
 520                                 printf("%14d   %10.6f\n", j, sb->dval[j]);
 521                             }
 522                             break;
 523                         case xdr_datatype_int:
 524                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 525                             {
 526                                 printf("%14d %10d\n", j, sb->ival[j]);
 527                             }
 528                             break;
 529                         case xdr_datatype_int64:
 530                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 531                             {
 532                                 printf("%14d %s\n",
 533                                        j, gmx_step_str(sb->lval[j], buf));
 534                             }
 535                             break;
 536                         case xdr_datatype_char:
 537                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 538                             {
 539                                 printf("%14d %1c\n", j, sb->cval[j]);
 540                             }
 541                             break;
 542                         case xdr_datatype_string:
 543                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 544                             {
 545                                 printf("%14d %80s\n", j, sb->sval[j]);
 546                             }
 547                             break;
 548                         default:
 549                             gmx_incons("Unknown subblock type");
 550                     }
 551                 }
 552             }
 553         }
 554     }
 555     while (bCont);
 556
 557     close_enx(in);
 558
 559     free_enxframe(fr);
 560     sfree(fr);
 561     sfree(enm);
 562 }
 563
 564 static void list_mtx(const char *fn)
 565 {
 566     int                  nrow, ncol, i, j, k;
 567     real                *full   = NULL, value;
 568     gmx_sparsematrix_t * sparse = NULL;
 569
 570     gmx_mtxio_read(fn, &nrow, &ncol, &full, &sparse);
 571
 572     if (full == NULL)
 573     {
 574         snew(full, nrow*ncol);
 575         for (i = 0; i < nrow*ncol; i++)
 576         {
 577             full[i] = 0;
 578         }
 579
 580         for (i = 0; i < sparse->nrow; i++)
 581         {
 582             for (j = 0; j < sparse->ndata[i]; j++)
 583             {
 584                 k              = sparse->data[i][j].col;
 585                 value          = sparse->data[i][j].value;
 586                 full[i*ncol+k] = value;
 587                 full[k*ncol+i] = value;
 588             }
 589         }
 590         gmx_sparsematrix_destroy(sparse);
 591     }
 592
 593     printf("%d %d\n", nrow, ncol);
 594     for (i = 0; i < nrow; i++)
 595     {
 596         for (j = 0; j < ncol; j++)
 597         {
 598             printf(" %g", full[i*ncol+j]);
 599         }
 600         printf("\n");
 601     }
 602
 603     sfree(full);
 604 }
 605
 606 int gmx_dump(int argc, char *argv[])
 607 {
 608     const char *desc[] = {
 609         "[THISMODULE] reads a run input file ([TT].tpa[tt]/[TT].tpr[tt]/[TT].tpb[tt]),",
 610         "a trajectory ([TT].trj[tt]/[TT].trr[tt]/[TT].xtc[tt]), an energy",
 611         "file ([TT].ene[tt]/[TT].edr[tt]), or a checkpoint file ([TT].cpt[tt])",
 612         "and prints that to standard output in a readable format.",
 613         "This program is essential for checking your run input file in case of",
 614         "problems.[PAR]",
 615         "The program can also preprocess a topology to help finding problems.",
 616         "Note that currently setting [TT]GMXLIB[tt] is the only way to customize",
 617         "directories used for searching include files.",
 618     };
 619     const char *bugs[] = {
 620         "Position restraint output from -sys -s is broken"
 621     };
 622     t_filenm    fnm[] = {
 623         { efTPX, "-s", NULL, ffOPTRD },
 624         { efTRX, "-f", NULL, ffOPTRD },
 625         { efEDR, "-e", NULL, ffOPTRD },
 626         { efCPT, NULL, NULL, ffOPTRD },
 627         { efTOP, "-p", NULL, ffOPTRD },
 628         { efMTX, "-mtx", "hessian", ffOPTRD },
 629         { efMDP, "-om", NULL, ffOPTWR }
 630     };
 631 #define NFILE asize(fnm)
 632
 633     output_env_t    oenv;
 634     /* Command line options */
 635     static gmx_bool bShowNumbers = TRUE;
 636     static gmx_bool bSysTop      = FALSE;
 637     t_pargs         pa[]         = {
 638         { "-nr", FALSE, etBOOL, {&bShowNumbers}, "Show index numbers in output (leaving them out makes comparison easier, but creates a useless topology)" },
 639         { "-sys", FALSE, etBOOL, {&bSysTop}, "List the atoms and bonded interactions for the whole system instead of for each molecule type" }
 640     };
 641
 642     if (!parse_common_args(&argc, argv, 0, NFILE, fnm, asize(pa), pa,
 643                            asize(desc), desc, asize(bugs), bugs, &oenv))
 644     {
 645         return 0;
 646     }
 647
 648
 649     if (ftp2bSet(efTPX, NFILE, fnm))
 650     {
 651         list_tpx(ftp2fn(efTPX, NFILE, fnm), bShowNumbers,
 652                  ftp2fn_null(efMDP, NFILE, fnm), bSysTop);
 653     }
 654     else if (ftp2bSet(efTRX, NFILE, fnm))
 655     {
 656         list_trx(ftp2fn(efTRX, NFILE, fnm));
 657     }
 658     else if (ftp2bSet(efEDR, NFILE, fnm))
 659     {
 660         list_ene(ftp2fn(efEDR, NFILE, fnm));
 661     }
 662     else if (ftp2bSet(efCPT, NFILE, fnm))
 663     {
 664         list_checkpoint(ftp2fn(efCPT, NFILE, fnm), stdout);
 665     }
 666     else if (ftp2bSet(efTOP, NFILE, fnm))
 667     {
 668         list_top(ftp2fn(efTOP, NFILE, fnm));
 669     }
 670     else if (ftp2bSet(efMTX, NFILE, fnm))
 671     {
 672         list_mtx(ftp2fn(efMTX, NFILE, fnm));
 673     }
 674
 675     return 0;
 676 }