src/gromacs/tools/dump.c

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2013, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  38 #include <config.h>
  39 #endif
  40
  41 #include <stdio.h>
  42 #include <string.h>
  43 #include <math.h>
  44 #include <assert.h>
  45 #include "main.h"
  46 #include "macros.h"
  47 #include "gromacs/commandline/pargs.h"
  48 #include "sysstuff.h"
  49 #include "txtdump.h"
  50 #include "gmx_fatal.h"
  51 #include "gromacs/utility/smalloc.h"
  52 #include "names.h"
  53 #include "txtdump.h"
  54 #include "gromacs/gmxpreprocess/gmxcpp.h"
  55 #include "checkpoint.h"
  56 #include "mtop_util.h"
  57 #include "gromacs/fileio/xtcio.h"
  58 #include "gromacs/fileio/enxio.h"
  59 #include "gromacs/fileio/gmxfio.h"
  60 #include "gromacs/fileio/tpxio.h"
  61 #include "gromacs/fileio/trnio.h"
  62 #include "gromacs/fileio/futil.h"
  63 #include "gromacs/fileio/tngio.h"
  64 #include "gromacs/fileio/tngio_for_tools.h"
  65
  66 #ifdef HAVE_UNISTD_H
  67 #include <unistd.h>
  68 #endif
  69
  70 #include "gromacs/linearalgebra/mtxio.h"
  71 #include "gromacs/linearalgebra/sparsematrix.h"
  72
  73
  74 static void list_tpx(const char *fn, gmx_bool bShowNumbers, const char *mdpfn,
  75                      gmx_bool bSysTop)
  76 {
  77     FILE         *gp;
  78     int           fp, indent, i, j, **gcount, atot;
  79     t_state       state;
  80     rvec         *f = NULL;
  81     t_inputrec    ir;
  82     t_tpxheader   tpx;
  83     gmx_mtop_t    mtop;
  84     gmx_groups_t *groups;
  85     t_topology    top;
  86
  87     read_tpxheader(fn, &tpx, TRUE, NULL, NULL);
  88
  89     read_tpx_state(fn,
  90                    tpx.bIr  ? &ir : NULL,
  91                    &state, tpx.bF ? f : NULL,
  92                    tpx.bTop ? &mtop : NULL);
  93
  94     if (mdpfn && tpx.bIr)
  95     {
  96         gp = gmx_fio_fopen(mdpfn, "w");
  97         pr_inputrec(gp, 0, NULL, &(ir), TRUE);
  98         gmx_fio_fclose(gp);
  99     }
 100
 101     if (!mdpfn)
 102     {
 103         if (bSysTop)
 104         {
 105             top = gmx_mtop_t_to_t_topology(&mtop);
 106         }
 107
 108         if (available(stdout, &tpx, 0, fn))
 109         {
 110             indent = 0;
 111             indent = pr_title(stdout, indent, fn);
 112             pr_inputrec(stdout, 0, "inputrec", tpx.bIr ? &(ir) : NULL, FALSE);
 113
 114             indent = 0;
 115             pr_header(stdout, indent, "header", &(tpx));
 116
 117             if (!bSysTop)
 118             {
 119                 pr_mtop(stdout, indent, "topology", &(mtop), bShowNumbers);
 120             }
 121             else
 122             {
 123                 pr_top(stdout, indent, "topology", &(top), bShowNumbers);
 124             }
 125
 126             pr_rvecs(stdout, indent, "box", tpx.bBox ? state.box : NULL, DIM);
 127             pr_rvecs(stdout, indent, "box_rel", tpx.bBox ? state.box_rel : NULL, DIM);
 128             pr_rvecs(stdout, indent, "boxv", tpx.bBox ? state.boxv : NULL, DIM);
 129             pr_rvecs(stdout, indent, "pres_prev", tpx.bBox ? state.pres_prev : NULL, DIM);
 130             pr_rvecs(stdout, indent, "svir_prev", tpx.bBox ? state.svir_prev : NULL, DIM);
 131             pr_rvecs(stdout, indent, "fvir_prev", tpx.bBox ? state.fvir_prev : NULL, DIM);
 132             /* leave nosehoover_xi in for now to match the tpr version */
 133             pr_doubles(stdout, indent, "nosehoover_xi", state.nosehoover_xi, state.ngtc);
 134             /*pr_doubles(stdout,indent,"nosehoover_vxi",state.nosehoover_vxi,state.ngtc);*/
 135             /*pr_doubles(stdout,indent,"therm_integral",state.therm_integral,state.ngtc);*/
 136             pr_rvecs(stdout, indent, "x", tpx.bX ? state.x : NULL, state.natoms);
 137             pr_rvecs(stdout, indent, "v", tpx.bV ? state.v : NULL, state.natoms);
 138             if (tpx.bF)
 139             {
 140                 pr_rvecs(stdout, indent, "f", f, state.natoms);
 141             }
 142         }
 143
 144         groups = &mtop.groups;
 145
 146         snew(gcount, egcNR);
 147         for (i = 0; (i < egcNR); i++)
 148         {
 149             snew(gcount[i], groups->grps[i].nr);
 150         }
 151
 152         for (i = 0; (i < mtop.natoms); i++)
 153         {
 154             for (j = 0; (j < egcNR); j++)
 155             {
 156                 gcount[j][ggrpnr(groups, j, i)]++;
 157             }
 158         }
 159         printf("Group statistics\n");
 160         for (i = 0; (i < egcNR); i++)
 161         {
 162             atot = 0;
 163             printf("%-12s: ", gtypes[i]);
 164             for (j = 0; (j < groups->grps[i].nr); j++)
 165             {
 166                 printf("  %5d", gcount[i][j]);
 167                 atot += gcount[i][j];
 168             }
 169             printf("  (total %d atoms)\n", atot);
 170             sfree(gcount[i]);
 171         }
 172         sfree(gcount);
 173     }
 174     done_state(&state);
 175     sfree(f);
 176 }
 177
 178 static void list_top(const char *fn)
 179 {
 180     int       status, done;
 181 #define BUFLEN 256
 182     char      buf[BUFLEN];
 183     gmx_cpp_t handle;
 184     char     *cppopts[] = { NULL };
 185
 186     status = cpp_open_file(fn, &handle, cppopts);
 187     if (status != 0)
 188     {
 189         gmx_fatal(FARGS, cpp_error(&handle, status));
 190     }
 191     do
 192     {
 193         status = cpp_read_line(&handle, BUFLEN, buf);
 194         done   = (status == eCPP_EOF);
 195         if (!done)
 196         {
 197             if (status != eCPP_OK)
 198             {
 199                 gmx_fatal(FARGS, cpp_error(&handle, status));
 200             }
 201             else
 202             {
 203                 printf("%s\n", buf);
 204             }
 205         }
 206     }
 207     while (!done);
 208     status = cpp_close_file(&handle);
 209     if (status != eCPP_OK)
 210     {
 211         gmx_fatal(FARGS, cpp_error(&handle, status));
 212     }
 213 }
 214
 215 static void list_trn(const char *fn)
 216 {
 217     t_fileio       *fpread, *fpwrite;
 218     int             nframe, indent;
 219     char            buf[256];
 220     rvec           *x, *v, *f;
 221     matrix          box;
 222     t_trnheader     trn;
 223     gmx_bool        bOK;
 224
 225     fpread  = open_trn(fn, "r");
 226     fpwrite = open_tpx(NULL, "w");
 227     gmx_fio_setdebug(fpwrite, TRUE);
 228
 229     nframe = 0;
 230     while (fread_trnheader(fpread, &trn, &bOK))
 231     {
 232         snew(x, trn.natoms);
 233         snew(v, trn.natoms);
 234         snew(f, trn.natoms);
 235         if (fread_htrn(fpread, &trn,
 236                        trn.box_size ? box : NULL,
 237                        trn.x_size   ? x : NULL,
 238                        trn.v_size   ? v : NULL,
 239                        trn.f_size   ? f : NULL))
 240         {
 241             sprintf(buf, "%s frame %d", fn, nframe);
 242             indent = 0;
 243             indent = pr_title(stdout, indent, buf);
 244             pr_indent(stdout, indent);
 245             fprintf(stdout, "natoms=%10d  step=%10d  time=%12.7e  lambda=%10g\n",
 246                     trn.natoms, trn.step, trn.t, trn.lambda);
 247             if (trn.box_size)
 248             {
 249                 pr_rvecs(stdout, indent, "box", box, DIM);
 250             }
 251             if (trn.x_size)
 252             {
 253                 pr_rvecs(stdout, indent, "x", x, trn.natoms);
 254             }
 255             if (trn.v_size)
 256             {
 257                 pr_rvecs(stdout, indent, "v", v, trn.natoms);
 258             }
 259             if (trn.f_size)
 260             {
 261                 pr_rvecs(stdout, indent, "f", f, trn.natoms);
 262             }
 263         }
 264         else
 265         {
 266             fprintf(stderr, "\nWARNING: Incomplete frame: nr %d, t=%g\n",
 267                     nframe, trn.t);
 268         }
 269
 270         sfree(x);
 271         sfree(v);
 272         sfree(f);
 273         nframe++;
 274     }
 275     if (!bOK)
 276     {
 277         fprintf(stderr, "\nWARNING: Incomplete frame header: nr %d, t=%g\n",
 278                 nframe, trn.t);
 279     }
 280     close_tpx(fpwrite);
 281     close_trn(fpread);
 282 }
 283
 284 void list_xtc(const char *fn)
 285 {
 286     t_fileio  *xd;
 287     int        indent;
 288     char       buf[256];
 289     rvec      *x;
 290     matrix     box;
 291     int        nframe, natoms, step;
 292     real       prec, time;
 293     gmx_bool   bOK;
 294
 295     xd = open_xtc(fn, "r");
 296     read_first_xtc(xd, &natoms, &step, &time, box, &x, &prec, &bOK);
 297
 298     nframe = 0;
 299     do
 300     {
 301         sprintf(buf, "%s frame %d", fn, nframe);
 302         indent = 0;
 303         indent = pr_title(stdout, indent, buf);
 304         pr_indent(stdout, indent);
 305         fprintf(stdout, "natoms=%10d  step=%10d  time=%12.7e  prec=%10g\n",
 306                 natoms, step, time, prec);
 307         pr_rvecs(stdout, indent, "box", box, DIM);
 308         pr_rvecs(stdout, indent, "x", x, natoms);
 309         nframe++;
 310     }
 311     while (read_next_xtc(xd, natoms, &step, &time, box, x, &prec, &bOK));
 312     if (!bOK)
 313     {
 314         fprintf(stderr, "\nWARNING: Incomplete frame at time %g\n", time);
 315     }
 316     sfree(x);
 317     close_xtc(xd);
 318 }
 319
 320 /*! \brief Callback used by list_tng_for_gmx_dump. */
 321 static void list_tng_inner(const char *fn,
 322                            gmx_bool    bFirstFrame,
 323                            real       *values,
 324                            gmx_int64_t step,
 325                            double      frame_time,
 326                            gmx_int64_t n_values_per_frame,
 327                            gmx_int64_t n_atoms,
 328                            real        prec,
 329                            gmx_int64_t nframe,
 330                            char       *block_name)
 331 {
 332     char                 buf[256];
 333     int                  indent = 0;
 334
 335     if (bFirstFrame)
 336     {
 337         sprintf(buf, "%s frame %" GMX_PRId64, fn, nframe);
 338         indent = 0;
 339         indent = pr_title(stdout, indent, buf);
 340         pr_indent(stdout, indent);
 341         fprintf(stdout, "natoms=%10" GMX_PRId64 "  step=%10" GMX_PRId64 "  time=%12.7e",
 342                 n_atoms, step, frame_time);
 343         if (prec > 0)
 344         {
 345             fprintf(stdout, "  prec=%10g", prec);
 346         }
 347         fprintf(stdout, "\n");
 348     }
 349     pr_reals_of_dim(stdout, indent, block_name, values, n_atoms, n_values_per_frame);
 350 }
 351
 352 static void list_tng(const char gmx_unused *fn)
 353 {
 354 #ifdef GMX_USE_TNG
 355     tng_trajectory_t     tng;
 356     gmx_int64_t          nframe = 0;
 357     gmx_int64_t          i, *block_ids = NULL, step, ndatablocks;
 358     gmx_bool             bOK;
 359
 360     gmx_tng_open(fn, 'r', &tng);
 361     gmx_print_tng_molecule_system(tng, stdout);
 362
 363     bOK    = gmx_get_tng_data_block_types_of_next_frame(tng, -1,
 364                                                         0,
 365                                                         NULL,
 366                                                         &step, &ndatablocks,
 367                                                         &block_ids);
 368     do
 369     {
 370         for (i = 0; i < ndatablocks; i++)
 371         {
 372             double               frame_time;
 373             real                 prec, *values = NULL;
 374             gmx_int64_t          n_values_per_frame, n_atoms;
 375             char                 block_name[STRLEN];
 376
 377             gmx_get_tng_data_next_frame_of_block_type(tng, block_ids[i], &values,
 378                                                       &step, &frame_time,
 379                                                       &n_values_per_frame, &n_atoms,
 380                                                       &prec,
 381                                                       block_name, STRLEN, &bOK);
 382             if (!bOK)
 383             {
 384                 /* Can't write any output because we don't know what
 385                    arrays are valid. */
 386                 fprintf(stderr, "\nWARNING: Incomplete frame at time %g, will not write output\n", frame_time);
 387             }
 388             else
 389             {
 390                 list_tng_inner(fn, (0 == i), values, step, frame_time,
 391                                n_values_per_frame, n_atoms, prec, nframe, block_name);
 392             }
 393         }
 394         nframe++;
 395     }
 396     while (gmx_get_tng_data_block_types_of_next_frame(tng, step,
 397                                                       0,
 398                                                       NULL,
 399                                                       &step,
 400                                                       &ndatablocks,
 401                                                       &block_ids));
 402
 403     if (block_ids)
 404     {
 405         sfree(block_ids);
 406     }
 407
 408     gmx_tng_close(&tng);
 409 #endif
 410 }
 411
 412 void list_trx(const char *fn)
 413 {
 414     int ftp;
 415
 416     ftp = fn2ftp(fn);
 417     if (ftp == efXTC)
 418     {
 419         list_xtc(fn);
 420     }
 421     else if ((ftp == efTRR) || (ftp == efTRJ))
 422     {
 423         list_trn(fn);
 424     }
 425     else if (ftp == efTNG)
 426     {
 427         list_tng(fn);
 428     }
 429     else
 430     {
 431         fprintf(stderr, "File %s is of an unsupported type. Try using the command\n 'less %s'\n",
 432                 fn, fn);
 433     }
 434 }
 435
 436 void list_ene(const char *fn)
 437 {
 438     int            ndr;
 439     ener_file_t    in;
 440     gmx_bool       bCont;
 441     gmx_enxnm_t   *enm = NULL;
 442     t_enxframe    *fr;
 443     int            i, j, nre, b;
 444     real           rav, minthird;
 445     char           buf[22];
 446
 447     printf("gmx dump: %s\n", fn);
 448     in = open_enx(fn, "r");
 449     do_enxnms(in, &nre, &enm);
 450     assert(enm);
 451
 452     printf("energy components:\n");
 453     for (i = 0; (i < nre); i++)
 454     {
 455         printf("%5d  %-24s (%s)\n", i, enm[i].name, enm[i].unit);
 456     }
 457
 458     minthird = -1.0/3.0;
 459     snew(fr, 1);
 460     do
 461     {
 462         bCont = do_enx(in, fr);
 463
 464         if (bCont)
 465         {
 466             printf("\n%24s  %12.5e  %12s  %12s\n", "time:",
 467                    fr->t, "step:", gmx_step_str(fr->step, buf));
 468             printf("%24s  %12s  %12s  %12s\n",
 469                    "", "", "nsteps:", gmx_step_str(fr->nsteps, buf));
 470             printf("%24s  %12.5e  %12s  %12s\n",
 471                    "delta_t:", fr->dt, "sum steps:", gmx_step_str(fr->nsum, buf));
 472             if (fr->nre == nre)
 473             {
 474                 printf("%24s  %12s  %12s  %12s\n",
 475                        "Component", "Energy", "Av. Energy", "Sum Energy");
 476                 if (fr->nsum > 0)
 477                 {
 478                     for (i = 0; (i < nre); i++)
 479                     {
 480                         printf("%24s  %12.5e  %12.5e  %12.5e\n",
 481                                enm[i].name, fr->ener[i].e, fr->ener[i].eav,
 482                                fr->ener[i].esum);
 483                     }
 484                 }
 485                 else
 486                 {
 487                     for (i = 0; (i < nre); i++)
 488                     {
 489                         printf("%24s  %12.5e\n",
 490                                enm[i].name, fr->ener[i].e);
 491                     }
 492                 }
 493             }
 494             for (b = 0; b < fr->nblock; b++)
 495             {
 496                 const char *typestr = "";
 497
 498                 t_enxblock *eb = &(fr->block[b]);
 499                 printf("Block data %2d (%3d subblocks, id=%d)\n",
 500                        b, eb->nsub, eb->id);
 501
 502                 if (eb->id < enxNR)
 503                 {
 504                     typestr = enx_block_id_name[eb->id];
 505                 }
 506                 printf("  id='%s'\n", typestr);
 507                 for (i = 0; i < eb->nsub; i++)
 508                 {
 509                     t_enxsubblock *sb = &(eb->sub[i]);
 510                     printf("  Sub block %3d (%5d elems, type=%s) values:\n",
 511                            i, sb->nr, xdr_datatype_names[sb->type]);
 512
 513                     switch (sb->type)
 514                     {
 515                         case xdr_datatype_float:
 516                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 517                             {
 518                                 printf("%14d   %8.4f\n", j, sb->fval[j]);
 519                             }
 520                             break;
 521                         case xdr_datatype_double:
 522                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 523                             {
 524                                 printf("%14d   %10.6f\n", j, sb->dval[j]);
 525                             }
 526                             break;
 527                         case xdr_datatype_int:
 528                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 529                             {
 530                                 printf("%14d %10d\n", j, sb->ival[j]);
 531                             }
 532                             break;
 533                         case xdr_datatype_int64:
 534                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 535                             {
 536                                 printf("%14d %s\n",
 537                                        j, gmx_step_str(sb->lval[j], buf));
 538                             }
 539                             break;
 540                         case xdr_datatype_char:
 541                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 542                             {
 543                                 printf("%14d %1c\n", j, sb->cval[j]);
 544                             }
 545                             break;
 546                         case xdr_datatype_string:
 547                             for (j = 0; j < sb->nr; j++)
 548                             {
 549                                 printf("%14d %80s\n", j, sb->sval[j]);
 550                             }
 551                             break;
 552                         default:
 553                             gmx_incons("Unknown subblock type");
 554                     }
 555                 }
 556             }
 557         }
 558     }
 559     while (bCont);
 560
 561     close_enx(in);
 562
 563     free_enxframe(fr);
 564     sfree(fr);
 565     sfree(enm);
 566 }
 567
 568 static void list_mtx(const char *fn)
 569 {
 570     int                  nrow, ncol, i, j, k;
 571     real                *full   = NULL, value;
 572     gmx_sparsematrix_t * sparse = NULL;
 573
 574     gmx_mtxio_read(fn, &nrow, &ncol, &full, &sparse);
 575
 576     if (full == NULL)
 577     {
 578         snew(full, nrow*ncol);
 579         for (i = 0; i < nrow*ncol; i++)
 580         {
 581             full[i] = 0;
 582         }
 583
 584         for (i = 0; i < sparse->nrow; i++)
 585         {
 586             for (j = 0; j < sparse->ndata[i]; j++)
 587             {
 588                 k              = sparse->data[i][j].col;
 589                 value          = sparse->data[i][j].value;
 590                 full[i*ncol+k] = value;
 591                 full[k*ncol+i] = value;
 592             }
 593         }
 594         gmx_sparsematrix_destroy(sparse);
 595     }
 596
 597     printf("%d %d\n", nrow, ncol);
 598     for (i = 0; i < nrow; i++)
 599     {
 600         for (j = 0; j < ncol; j++)
 601         {
 602             printf(" %g", full[i*ncol+j]);
 603         }
 604         printf("\n");
 605     }
 606
 607     sfree(full);
 608 }
 609
 610 int gmx_dump(int argc, char *argv[])
 611 {
 612     const char *desc[] = {
 613         "[THISMODULE] reads a run input file ([TT].tpa[tt]/[TT].tpr[tt]/[TT].tpb[tt]),",
 614         "a trajectory ([TT].trj[tt]/[TT].trr[tt]/[TT].xtc[tt]), an energy",
 615         "file ([TT].ene[tt]/[TT].edr[tt]), or a checkpoint file ([TT].cpt[tt])",
 616         "and prints that to standard output in a readable format.",
 617         "This program is essential for checking your run input file in case of",
 618         "problems.[PAR]",
 619         "The program can also preprocess a topology to help finding problems.",
 620         "Note that currently setting [TT]GMXLIB[tt] is the only way to customize",
 621         "directories used for searching include files.",
 622     };
 623     const char *bugs[] = {
 624         "Position restraint output from -sys -s is broken"
 625     };
 626     t_filenm    fnm[] = {
 627         { efTPX, "-s", NULL, ffOPTRD },
 628         { efTRX, "-f", NULL, ffOPTRD },
 629         { efEDR, "-e", NULL, ffOPTRD },
 630         { efCPT, NULL, NULL, ffOPTRD },
 631         { efTOP, "-p", NULL, ffOPTRD },
 632         { efMTX, "-mtx", "hessian", ffOPTRD },
 633         { efMDP, "-om", NULL, ffOPTWR }
 634     };
 635 #define NFILE asize(fnm)
 636
 637     output_env_t    oenv;
 638     /* Command line options */
 639     static gmx_bool bShowNumbers = TRUE;
 640     static gmx_bool bSysTop      = FALSE;
 641     t_pargs         pa[]         = {
 642         { "-nr", FALSE, etBOOL, {&bShowNumbers}, "Show index numbers in output (leaving them out makes comparison easier, but creates a useless topology)" },
 643         { "-sys", FALSE, etBOOL, {&bSysTop}, "List the atoms and bonded interactions for the whole system instead of for each molecule type" }
 644     };
 645
 646     if (!parse_common_args(&argc, argv, 0, NFILE, fnm, asize(pa), pa,
 647                            asize(desc), desc, asize(bugs), bugs, &oenv))
 648     {
 649         return 0;
 650     }
 651
 652
 653     if (ftp2bSet(efTPX, NFILE, fnm))
 654     {
 655         list_tpx(ftp2fn(efTPX, NFILE, fnm), bShowNumbers,
 656                  ftp2fn_null(efMDP, NFILE, fnm), bSysTop);
 657     }
 658     else if (ftp2bSet(efTRX, NFILE, fnm))
 659     {
 660         list_trx(ftp2fn(efTRX, NFILE, fnm));
 661     }
 662     else if (ftp2bSet(efEDR, NFILE, fnm))
 663     {
 664         list_ene(ftp2fn(efEDR, NFILE, fnm));
 665     }
 666     else if (ftp2bSet(efCPT, NFILE, fnm))
 667     {
 668         list_checkpoint(ftp2fn(efCPT, NFILE, fnm), stdout);
 669     }
 670     else if (ftp2bSet(efTOP, NFILE, fnm))
 671     {
 672         list_top(ftp2fn(efTOP, NFILE, fnm));
 673     }
 674     else if (ftp2bSet(efMTX, NFILE, fnm))
 675     {
 676         list_mtx(ftp2fn(efMTX, NFILE, fnm));
 677     }
 678
 679     return 0;
 680 }