src/gromacs/taskassignment/decidegpuusage.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2017,2018,2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \libinternal \file
  36  * \brief Declares functionality for deciding whether tasks will run on GPUs.
  37  *
  38  * \author Mark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
  39  * \ingroup module_taskassignment
  40  * \inlibraryapi
  41  */
  42
  43 #ifndef GMX_TASKASSIGNMENT_DECIDEGPUUSAGE_H
  44 #define GMX_TASKASSIGNMENT_DECIDEGPUUSAGE_H
  45
  46 #include <vector>
  47
  48 struct gmx_hw_info_t;
  49 struct gmx_mtop_t;
  50 struct t_inputrec;
  51
  52 namespace gmx
  53 {
  54
  55 //! Record where a compute task is targetted.
  56 enum class TaskTarget : int
  57 {
  58     Auto,
  59     Cpu,
  60     Gpu
  61 };
  62
  63 //! Help pass GPU-emulation parameters with type safety.
  64 enum class EmulateGpuNonbonded : bool
  65 {
  66     //! Do not emulate GPUs.
  67     No,
  68     //! Do emulate GPUs.
  69     Yes
  70 };
  71
  72 class MDAtoms;
  73
  74 /*! \brief Decide whether this thread-MPI simulation will run
  75  * nonbonded tasks on GPUs.
  76  *
  77  * The number of GPU tasks and devices influences both the choice of
  78  * the number of ranks, and checks upon any such choice made by the
  79  * user. So we need to consider this before any automated choice of
  80  * the number of thread-MPI ranks.
  81  *
  82  * \param[in]  nonbondedTarget             The user's choice for mdrun -nb for where to assign short-ranged nonbonded interaction tasks.
  83  * \param[in]  gpuIdsToUse                 The compatible GPUs that the user permitted us to use.
  84  * \param[in]  userGpuTaskAssignment       The user-specified assignment of GPU tasks to device IDs.
  85  * \param[in]  emulateGpuNonbonded         Whether we will emulate GPU calculation of nonbonded interactions.
  86  * \param[in]  buildSupportsNonbondedOnGpu Whether GROMACS was built with GPU support.
  87  * \param[in]  nonbondedOnGpuIsUseful      Whether computing nonbonded interactions on a GPU is useful for this calculation.
  88  * \param[in]  numRanksPerSimulation       The number of ranks in each simulation.
  89  *
  90  * \returns    Whether the simulation will run nonbonded tasks on GPUs.
  91  *
  92  * \throws     std::bad_alloc          If out of memory
  93  *             InconsistentInputError  If the user requirements are inconsistent. */
  94 bool decideWhetherToUseGpusForNonbondedWithThreadMpi(TaskTarget              nonbondedTarget,
  95                                                      const std::vector<int>& gpuIdsToUse,
  96                                                      const std::vector<int>& userGpuTaskAssignment,
  97                                                      EmulateGpuNonbonded     emulateGpuNonbonded,
  98                                                      bool buildSupportsNonbondedOnGpu,
  99                                                      bool nonbondedOnGpuIsUseful,
 100                                                      int  numRanksPerSimulation);
 101
 102 /*! \brief Decide whether this thread-MPI simulation will run
 103  * PME tasks on GPUs.
 104  *
 105  * The number of GPU tasks and devices influences both the choice of
 106  * the number of ranks, and checks upon any such choice made by the
 107  * user. So we need to consider this before any automated choice of
 108  * the number of thread-MPI ranks.
 109  *
 110  * \param[in]  useGpuForNonbonded        Whether GPUs will be used for nonbonded interactions.
 111  * \param[in]  pmeTarget                 The user's choice for mdrun -pme for where to assign
 112  *                                       long-ranged PME nonbonded interaction tasks.
 113  * \param[in]  gpuIdsToUse               The compatible GPUs that the user permitted us to use.
 114  * \param[in]  userGpuTaskAssignment     The user-specified assignment of GPU tasks to device IDs.
 115  * \param[in]  hardwareInfo              Hardware information
 116  * \param[in]  inputrec                  The user input
 117  * \param[in]  mtop                      Global system topology
 118  * \param[in]  numRanksPerSimulation     The number of ranks in each simulation.
 119  * \param[in]  numPmeRanksPerSimulation  The number of PME ranks in each simulation.
 120  *
 121  * \returns    Whether the simulation will run PME tasks on GPUs.
 122  *
 123  * \throws     std::bad_alloc          If out of memory
 124  *             InconsistentInputError  If the user requirements are inconsistent. */
 125 bool decideWhetherToUseGpusForPmeWithThreadMpi(bool                    useGpuForNonbonded,
 126                                                TaskTarget              pmeTarget,
 127                                                const std::vector<int>& gpuIdsToUse,
 128                                                const std::vector<int>& userGpuTaskAssignment,
 129                                                const gmx_hw_info_t&    hardwareInfo,
 130                                                const t_inputrec&       inputrec,
 131                                                const gmx_mtop_t&       mtop,
 132                                                int                     numRanksPerSimulation,
 133                                                int                     numPmeRanksPerSimulation);
 134
 135 /*! \brief Decide whether the simulation will try to run nonbonded
 136  * tasks on GPUs.
 137  *
 138  * The final decision cannot be made until after the duty of the rank
 139  * is known. But we need to know if nonbonded will run on GPUs for
 140  * setting up DD (particularly rlist) and determining duty. If the
 141  * user requires GPUs for the tasks of that duty, then it will be an
 142  * error when none are found.
 143  *
 144  * With thread-MPI, calls have been made to
 145  * decideWhetherToUseGpusForNonbondedWithThreadMpi() and
 146  * decideWhetherToUseGpusForPmeWithThreadMpi() to help determine
 147  * the number of ranks and run some checks, but the final
 148  * decision is made in this routine, along with many more
 149  * consistency checks.
 150  *
 151  * \param[in]  nonbondedTarget             The user's choice for mdrun -nb for where to assign short-ranged nonbonded interaction tasks.
 152  * \param[in]  userGpuTaskAssignment       The user-specified assignment of GPU tasks to device IDs.
 153  * \param[in]  emulateGpuNonbonded         Whether we will emulate GPU calculation of nonbonded interactions.
 154  * \param[in]  buildSupportsNonbondedOnGpu Whether GROMACS was build with GPU support.
 155  * \param[in]  nonbondedOnGpuIsUseful      Whether computing nonbonded interactions on a GPU is useful for this calculation.
 156  * \param[in]  gpusWereDetected            Whether compatible GPUs were detected on any node.
 157  *
 158  * \returns    Whether the simulation will run nonbonded and PME tasks, respectively, on GPUs.
 159  *
 160  * \throws     std::bad_alloc          If out of memory
 161  *             InconsistentInputError  If the user requirements are inconsistent. */
 162 bool decideWhetherToUseGpusForNonbonded(TaskTarget              nonbondedTarget,
 163                                         const std::vector<int>& userGpuTaskAssignment,
 164                                         EmulateGpuNonbonded     emulateGpuNonbonded,
 165                                         bool                    buildSupportsNonbondedOnGpu,
 166                                         bool                    nonbondedOnGpuIsUseful,
 167                                         bool                    gpusWereDetected);
 168
 169 /*! \brief Decide whether the simulation will try to run tasks of
 170  * different types on GPUs.
 171  *
 172  * The final decision cannot be made until after the duty of the rank
 173  * is known. But we need to know if nonbonded will run on GPUs for
 174  * setting up DD (particularly rlist) and determining duty. If the
 175  * user requires GPUs for the tasks of that duty, then it will be an
 176  * error when none are found.
 177  *
 178  * With thread-MPI, calls have been made to
 179  * decideWhetherToUseGpusForNonbondedWithThreadMpi() and
 180  * decideWhetherToUseGpusForPmeWithThreadMpi() to help determine
 181  * the number of ranks and run some checks, but the final
 182  * decision is made in this routine, along with many more
 183  * consistency checks.
 184  *
 185  * \param[in]  useGpuForNonbonded        Whether GPUs will be used for nonbonded interactions.
 186  * \param[in]  pmeTarget                 The user's choice for mdrun -pme for where to assign long-ranged PME nonbonded interaction tasks.
 187  * \param[in]  userGpuTaskAssignment     The user-specified assignment of GPU tasks to device IDs.
 188  * \param[in]  hardwareInfo              Hardware information
 189  * \param[in]  inputrec                  The user input
 190  * \param[in]  mtop                      Global system topology
 191  * \param[in]  numRanksPerSimulation     The number of ranks in each simulation.
 192  * \param[in]  numPmeRanksPerSimulation  The number of PME ranks in each simulation.
 193  * \param[in]  gpusWereDetected          Whether compatible GPUs were detected on any node.
 194  *
 195  * \returns    Whether the simulation will run nonbonded and PME tasks, respectively, on GPUs.
 196  *
 197  * \throws     std::bad_alloc          If out of memory
 198  *             InconsistentInputError  If the user requirements are inconsistent. */
 199 bool decideWhetherToUseGpusForPme(bool                    useGpuForNonbonded,
 200                                   TaskTarget              pmeTarget,
 201                                   const std::vector<int>& userGpuTaskAssignment,
 202                                   const gmx_hw_info_t&    hardwareInfo,
 203                                   const t_inputrec&       inputrec,
 204                                   const gmx_mtop_t&       mtop,
 205                                   int                     numRanksPerSimulation,
 206                                   int                     numPmeRanksPerSimulation,
 207                                   bool                    gpusWereDetected);
 208
 209 /*! \brief Decide whether the simulation will try to run bonded tasks on GPUs.
 210  *
 211  * \param[in]  useGpuForNonbonded        Whether GPUs will be used for nonbonded interactions.
 212  * \param[in]  useGpuForPme              Whether GPUs will be used for PME interactions.
 213  * \param[in]  bondedTarget              The user's choice for mdrun -bonded for where to assign tasks.
 214  * \param[in]  canUseGpuForBonded        Whether the bonded interactions can run on a GPU
 215  * \param[in]  usingLJPme                Whether Vdw interactions use LJ-PME.
 216  * \param[in]  usingElecPmeOrEwald       Whether a PME or Ewald type method is used for electrostatics.
 217  * \param[in]  numPmeRanksPerSimulation  The number of PME ranks in each simulation, can be -1 for auto.
 218  * \param[in]  gpusWereDetected          Whether compatible GPUs were detected on any node.
 219  *
 220  * \returns    Whether the simulation will run bondeded tasks on GPUs.
 221  *
 222  * \throws     std::bad_alloc          If out of memory
 223  *             InconsistentInputError  If the user requirements are inconsistent. */
 224 bool decideWhetherToUseGpusForBonded(bool       useGpuForNonbonded,
 225                                      bool       useGpuForPme,
 226                                      TaskTarget bondedTarget,
 227                                      bool       canUseGpuForBonded,
 228                                      bool       usingLJPme,
 229                                      bool       usingElecPmeOrEwald,
 230                                      int        numPmeRanksPerSimulation,
 231                                      bool       gpusWereDetected);
 232
 233 /*! \brief Decide whether to use GPU for update.
 234  *
 235  * \param[in]  forceGpuUpdateDefault        If update should run on GPU by default.
 236  * \param[in]  isDomainDecomposition        Whether there more than one domain.
 237  * \param[in]  useUpdateGroups              If the constraints can be split across domains.
 238  * \param[in]  useGpuForPme                 Whether GPUs will be used for PME interactions.
 239  * \param[in]  useGpuForNonbonded           Whether GPUs will be used for nonbonded interactions.
 240  * \param[in]  updateTarget                 User choice for running simulation on GPU.
 241  * \param[in]  gpusWereDetected             Whether compatible GPUs were detected on any node.
 242  * \param[in]  inputrec                     The user input.
 243  * \param[in]  mtop                         The global topology.
 244  * \param[in]  useEssentialDynamics         If essential dynamics is active.
 245  * \param[in]  doOrientationRestraints      If orientation restraints are enabled.
 246  * \param[in]  useReplicaExchange           If this is a REMD simulation.
 247  * \param[in]  doRerun                      It this is a rerun.
 248  *
 249  * \returns    Whether complete simulation can be run on GPU.
 250  * \throws     std::bad_alloc            If out of memory
 251  *             InconsistentInputError    If the user requirements are inconsistent.
 252  */
 253 bool decideWhetherToUseGpuForUpdate(bool              forceGpuUpdateDefault,
 254                                     bool              isDomainDecomposition,
 255                                     bool              useUpdateGroups,
 256                                     bool              useGpuForPme,
 257                                     bool              useGpuForNonbonded,
 258                                     TaskTarget        updateTarget,
 259                                     bool              gpusWereDetected,
 260                                     const t_inputrec& inputrec,
 261                                     const gmx_mtop_t& mtop,
 262                                     bool              useEssentialDynamics,
 263                                     bool              doOrientationRestraints,
 264                                     bool              useReplicaExchange,
 265                                     bool              doRerun);
 266
 267
 268 } // namespace gmx
 269
 270 #endif