Merge branch 'release-4-5-patches'
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / selection / mempool.h
1 /*
2  *
3  *                This source code is part of
4  *
5  *                 G   R   O   M   A   C   S
6  *
7  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
8  *
9  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
10  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
11  * Copyright (c) 2001-2009, The GROMACS development team,
12  * check out http://www.gromacs.org for more information.
13
14  * This program is free software; you can redistribute it and/or
15  * modify it under the terms of the GNU General Public License
16  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
17  * of the License, or (at your option) any later version.
18  *
19  * If you want to redistribute modifications, please consider that
20  * scientific software is very special. Version control is crucial -
21  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
22  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
23  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
24  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
25  *
26  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
27  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
28  *
29  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
30  */
31 /*! \internal \file
32  * \brief Declarations for memory pooling functions.
33  *
34  * \todo
35  * Document these functions.
36  *
37  * This is an implementation header: there should be no need to use it outside
38  * this directory.
39  *
40  * \author Teemu Murtola <teemu.murtola@cbr.su.se>
41  * \ingroup module_selection
42  */
43 #ifndef GMX_SELECTION_MEMPOOL_H
44 #define GMX_SELECTION_MEMPOOL_H
45
46 struct gmx_ana_index_t;
47
48 /** Opaque struct for memory pooling. */
49 typedef struct gmx_sel_mempool_t gmx_sel_mempool_t;
50
51 /** Create an empty memory pool. */
52 int
53 _gmx_sel_mempool_create(gmx_sel_mempool_t **mpp);
54 /** Destroy a memory pool. */
55 void
56 _gmx_sel_mempool_destroy(gmx_sel_mempool_t *mp);
57
58 /** Allocate memory from a memory pool. */
59 int
60 _gmx_sel_mempool_alloc(gmx_sel_mempool_t *mp, void **ptrp, size_t size);
61 /** Release memory allocated from a memory pool. */
62 void
63 _gmx_sel_mempool_free(gmx_sel_mempool_t *mp, void *ptr);
64 /** Set the size of a memory pool. */
65 int
66 _gmx_sel_mempool_reserve(gmx_sel_mempool_t *mp, size_t size);
67
68 /** Convenience function for allocating an index group from a memory pool. */
69 int
70 _gmx_sel_mempool_alloc_group(gmx_sel_mempool_t *mp, struct gmx_ana_index_t *g,
71                              int isize);
72 /** Convenience function for freeing an index group from a memory pool. */
73 void
74 _gmx_sel_mempool_free_group(gmx_sel_mempool_t *mp, struct gmx_ana_index_t *g);
75
76 #endif