src/gromacs/selection/keywords.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2009,2010,2012,2014, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief Definitions of generic keyword evaluation structures.
  37  *
  38  * This is an implementation header: there should be no need to use it outside
  39  * this directory.
  40  *
  41  * \author Teemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
  42  * \ingroup module_selection
  43  */
  44 #ifndef GMX_SELECTION_KEYWORDS_H
  45 #define GMX_SELECTION_KEYWORDS_H
  46
  47 #include "parsetree.h"
  48 #include "selelem.h"
  49
  50 struct gmx_ana_selmethod_t;
  51
  52 /** Selection method data for comparison expression evaluation. */
  53 extern struct gmx_ana_selmethod_t sm_compare;
  54
  55 /** Selection method data for integer keyword evaluation. */
  56 extern struct gmx_ana_selmethod_t sm_keyword_int;
  57 /** Selection method data for real keyword evaluation. */
  58 extern struct gmx_ana_selmethod_t sm_keyword_real;
  59 /** Selection method data for string keyword evaluation. */
  60 extern struct gmx_ana_selmethod_t sm_keyword_str;
  61 /** Selection method data for position keyword evaluation. */
  62 extern struct gmx_ana_selmethod_t sm_keyword_pos;
  63
  64 /** Prints information about a comparison expression. */
  65 void
  66 _gmx_selelem_print_compare_info(FILE *fp, void *data);
  67
  68 /** Sets the position type for position keyword evaluation. */
  69 void
  70 _gmx_selelem_set_kwpos_type(gmx::SelectionTreeElement *sel, const char *type);
  71 /** Sets the flags for position keyword evaluation. */
  72 void
  73 _gmx_selelem_set_kwpos_flags(gmx::SelectionTreeElement *sel, int flags);
  74
  75 /** Sets the string match type for string keyword evaluation. */
  76 void
  77 _gmx_selelem_set_kwstr_match_type(const gmx::SelectionTreeElementPointer &sel,
  78                                   gmx::SelectionStringMatchType           matchType);
  79
  80 /** Does custom processing for parameters of the \c same selection method. */
  81 void
  82 _gmx_selelem_custom_init_same(struct gmx_ana_selmethod_t                    **method,
  83                               const gmx::SelectionParserParameterListPointer &params,
  84                               void                                           *scanner);
  85
  86 /*! \brief
  87  * Initializes a selection element for evaluating a keyword in a given group.
  88  *
  89  * \param[in]   method  Keyword selection method to evaluate.
  90  * \param[in]   child   The group/positions to evaluate \p method in.
  91  * \param[in]   scanner Scanner data structure.
  92  * \returns     Pointer to the created selection element.
  93  *
  94  * Creates a \ref SEL_EXPRESSION selection element that evaluates the keyword
  95  * method given by \p method in the group/positions given by \p child.
  96  *
  97  * \p child should be a selection tree that evaluates to \ref GROUP_VALUE or
  98  * \ref POS_VALUE.
  99  */
 100 gmx::SelectionTreeElementPointer
 101 _gmx_sel_init_keyword_evaluator(struct gmx_ana_selmethod_t              *method,
 102                                 const gmx::SelectionTreeElementPointer  &child,
 103                                 void                                    *scanner);
 104
 105 #endif