src/gromacs/restraint/restraintmdmodule.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2018,2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35
  36 #ifndef GROMACS_RESTRAINTMDMODULE_H
  37 #define GROMACS_RESTRAINTMDMODULE_H
  38
  39 /*! \libinternal \file
  40  * \brief Library interface for RestraintMDModule
  41  *
  42  * \author M. Eric Irrgang <ericirrgang@gmail.com>
  43  *
  44  * \inlibraryapi
  45  * \ingroup module_restraint
  46  */
  47
  48 #include "gromacs/mdtypes/imdmodule.h"
  49 #include "gromacs/restraint/restraintpotential.h"
  50
  51 namespace gmx
  52 {
  53
  54 // Forward declaration to allow opaque pointer to library internal class.
  55 class RestraintMDModuleImpl;
  56
  57 /*! \libinternal \ingroup module_restraint
  58  * \brief MDModule wrapper for Restraint implementations.
  59  *
  60  * Shares ownership of an object implementing the IRestraintPotential interface.
  61  * Provides the IMDModule interfaces.
  62  */
  63 class RestraintMDModule final : public gmx::IMDModule
  64 {
  65 public:
  66     RestraintMDModule() = delete;
  67
  68     /*!
  69      * \brief Constructor used by static create() method.
  70      */
  71     explicit RestraintMDModule(std::unique_ptr<RestraintMDModuleImpl> restraint);
  72
  73     ~RestraintMDModule() override;
  74
  75     /*!
  76      * \brief Wrap a restraint potential as an MDModule
  77      *
  78      * \param restraint shared ownership of an object for calculating restraint forces.
  79      * \return new wrapper object sharing ownership of restraint.
  80      *
  81      * Consumers of the interfaces provided by an IMDModule do not extend the lifetime
  82      * of the interface objects returned by mdpOptionProvider(), outputProvider(), or
  83      * registered via initForceProviders(). Calling code must keep this object alive
  84      * as long as those interfaces are needed (probably the duration of an MD run).
  85      *
  86      * \param restraint handle to object to wrap
  87      * \param sites list of sites for the framework to pass to the restraint
  88      */
  89     static std::unique_ptr<RestraintMDModule> create(std::shared_ptr<gmx::IRestraintPotential> restraint,
  90                                                      const std::vector<int>& sites);
  91
  92     /*!
  93      * \brief Implement IMDModule interface
  94      *
  95      * Unused.
  96      *
  97      * \return nullptr.
  98      */
  99     IMdpOptionProvider* mdpOptionProvider() override;
 100
 101     /*!
 102      * \brief Implement IMDModule interface
 103      *
 104      * Unused.
 105      *
 106      * \return nullptr.
 107      */
 108     IMDOutputProvider* outputProvider() override;
 109
 110     /*!
 111      * \brief Implement IMDModule interface.
 112      *
 113      * See gmx::IMDModule::initForceProviders()
 114      * \param forceProviders manager in the force record.
 115      */
 116     void initForceProviders(ForceProviders* forceProviders) override;
 117
 118 private:
 119     /*!
 120      * \brief Private implementation opaque pointer.
 121      */
 122     std::unique_ptr<RestraintMDModuleImpl> impl_;
 123 };
 124
 125 } // end namespace gmx
 126
 127 #endif // GROMACS_RESTRAINTMDMODULE_H