src/gromacs/pbcutil/ishift.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2010,2014, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37 #ifndef GMX_PBCUTIL_ISHIFT_H
  38 #define GMX_PBCUTIL_ISHIFT_H
  39
  40 #define D_BOX_Z 1
  41 #define D_BOX_Y 1
  42 #define D_BOX_X 2
  43 #define N_BOX_Z (2*D_BOX_Z+1)
  44 #define N_BOX_Y (2*D_BOX_Y+1)
  45 #define N_BOX_X (2*D_BOX_X+1)
  46 #define N_IVEC  (N_BOX_Z*N_BOX_Y*N_BOX_X)
  47 #define CENTRAL (N_IVEC/2)
  48 #define SHIFTS  N_IVEC
  49
  50 #define XYZ2IS(x, y, z) (N_BOX_X*(N_BOX_Y*((z)+D_BOX_Z)+(y)+D_BOX_Y)+(x)+D_BOX_X)
  51 #define IVEC2IS(iv)   (XYZ2IS((iv)[XX], (iv)[YY], (iv)[ZZ]))
  52 #define IS2X(iv)      (((iv) % N_BOX_X) - D_BOX_X)
  53 #define IS2Y(iv)      ((((iv) / N_BOX_X) % N_BOX_Y) - D_BOX_Y)
  54 #define IS2Z(iv)      ((iv) / (N_BOX_X*N_BOX_Y) - D_BOX_Z)
  55
  56 #endif