src/gromacs/options/valuestore.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2016,2017,2018,2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \file
  36  * \brief
  37  * Declares implementations for IOptionValueStore.
  38  *
  39  * \author Teemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
  40  * \ingroup module_options
  41  */
  42 #ifndef GMX_OPTIONS_VALUESTORE_H
  43 #define GMX_OPTIONS_VALUESTORE_H
  44
  45 #include <vector>
  46
  47 #include "gromacs/utility/arrayref.h"
  48
  49 #include "ivaluestore.h"
  50
  51 namespace gmx
  52 {
  53
  54 template<typename T>
  55 class OptionValueStorePlain : public IOptionValueStore<T>
  56 {
  57 public:
  58     OptionValueStorePlain(T* store, int* storeCount, int initialCount) :
  59         count_(initialCount),
  60         store_(store),
  61         storeCount_(storeCount)
  62     {
  63     }
  64
  65     int         valueCount() override { return count_; }
  66     ArrayRef<T> values() override { return arrayRefFromArray(store_, count_); }
  67     void        clear() override
  68     {
  69         count_ = 0;
  70         if (storeCount_ != nullptr)
  71         {
  72             *storeCount_ = count_;
  73         }
  74     }
  75     void reserve(size_t /*count*/) override {}
  76     void append(const T& value) override
  77     {
  78         store_[count_] = value;
  79         ++count_;
  80         if (storeCount_ != nullptr)
  81         {
  82             *storeCount_ = count_;
  83         }
  84     }
  85
  86 private:
  87     int  count_;
  88     T*   store_;
  89     int* storeCount_;
  90 };
  91
  92 template<typename T>
  93 class OptionValueStoreVector : public IOptionValueStore<T>
  94 {
  95 public:
  96     explicit OptionValueStoreVector(std::vector<T>* store) : store_(store) {}
  97
  98     int         valueCount() override { return static_cast<int>(store_->size()); }
  99     ArrayRef<T> values() override { return *store_; }
 100     void        clear() override { store_->clear(); }
 101     void        reserve(size_t count) override { store_->reserve(store_->size() + count); }
 102     void        append(const T& value) override { store_->push_back(value); }
 103
 104 private:
 105     std::vector<T>* store_;
 106 };
 107
 108 // Specialization that works around std::vector<bool> specialities.
 109 template<>
 110 class OptionValueStoreVector<bool> : public IOptionValueStore<bool>
 111 {
 112 public:
 113     explicit OptionValueStoreVector(std::vector<bool>* store) : store_(store) {}
 114
 115     int            valueCount() override { return static_cast<int>(store_->size()); }
 116     ArrayRef<bool> values() override
 117     {
 118         return arrayRefFromArray(reinterpret_cast<bool*>(boolStore_.data()), boolStore_.size());
 119     }
 120     void clear() override
 121     {
 122         boolStore_.clear();
 123         store_->clear();
 124     }
 125     void reserve(size_t count) override
 126     {
 127         boolStore_.reserve(boolStore_.size() + count);
 128         store_->reserve(store_->size() + count);
 129     }
 130     void append(const bool& value) override
 131     {
 132         boolStore_.push_back({ value });
 133         store_->push_back(value);
 134     }
 135
 136 private:
 137     struct Bool
 138     {
 139         bool value;
 140     };
 141
 142     std::vector<Bool>  boolStore_;
 143     std::vector<bool>* store_;
 144 };
 145
 146 /*! \internal
 147  * \brief
 148  * Value storage that does not store anywhere.
 149  *
 150  * This is needed because even though the values are not stored anywhere, the
 151  * code still expects to access them later through valueCount() and values().
 152  *
 153  * \ingroup module_options
 154  */
 155 template<typename T>
 156 class OptionValueStoreNull : public IOptionValueStore<T>
 157 {
 158 public:
 159     OptionValueStoreNull() : store_(&vector_) {}
 160
 161     int         valueCount() override { return store_.valueCount(); }
 162     ArrayRef<T> values() override { return store_.values(); }
 163     void        clear() override { store_.clear(); }
 164     void        reserve(size_t count) override { store_.reserve(count); }
 165     void        append(const T& value) override { store_.append(value); }
 166
 167 private:
 168     std::vector<T>            vector_;
 169     OptionValueStoreVector<T> store_;
 170 };
 171
 172 } // namespace gmx
 173
 174 #endif