Apply clang-format to source tree
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / options / treesupport.h
1 /*
2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3  *
4  * Copyright (c) 2016,2017,2019, by the GROMACS development team, led by
5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
8  *
9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
12  * of the License, or (at your option) any later version.
13  *
14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
17  * Lesser General Public License for more details.
18  *
19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
20  * License along with GROMACS; if not, see
21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
23  *
24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
25  * consider that scientific software is very special. Version
26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
30  * official version at http://www.gromacs.org.
31  *
32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
34  */
35 /*! \libinternal \file
36  * \brief
37  * Declares functions for using keyvaluetree.h with Options.
38  *
39  * \author Teemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
40  * \inlibraryapi
41  * \ingroup module_options
42  */
43 #ifndef GMX_OPTIONS_TREESUPPORT_H
44 #define GMX_OPTIONS_TREESUPPORT_H
45
46 namespace gmx
47 {
48
49 class IKeyValueTreeErrorHandler;
50 class KeyValueTreeObject;
51 class Options;
52
53 //! \cond libapi
54
55 /*! \libinternal \brief
56  * Assigns option values from a given KeyValueTreeObject.
57  *
58  * Each property with a simple value (or an array of simple values) is assigned
59  * to an option with the same name.  Objects and arrays of objects are assigned
60  * to sections with the same name.
61  *
62  * \ingroup module_options
63  */
64 void assignOptionsFromKeyValueTree(Options*                   options,
65                                    const KeyValueTreeObject&  tree,
66                                    IKeyValueTreeErrorHandler* errorHandler);
67 /*! \libinternal \brief
68  * Checks that a given KeyValueTreeObject can be assigned to given Options.
69  *
70  * Throws an exception if `tree` contains any values that are not recognized by
71  * `options`.  Does not verify the type of the values, only that an option with
72  * the correct names exists.
73  *
74  * \ingroup module_options
75  */
76 void checkForUnknownOptionsInKeyValueTree(const KeyValueTreeObject& tree, const Options& options);
77 /*! \libinternal \brief
78  * Adjusts a KeyValueTreeObject to the structure of given Options.
79  *
80  * Assumes that all values in the input KeyValueTreeObject are valid values for
81  * the options.  The output has all the values in the input, but in the order
82  * they are in the options.  Values are also converted to the native type for
83  * the underlying option (e.g., strings are parsed to integers if the option
84  * accepts those).  For any option that does not have a corresponding value in
85  * the input, the output has it with a default value (if one exists for the
86  * option).
87  *
88  * Any values in `tree` that do not have matching options are not present in
89  * the output.  If this is not desirable, call
90  * checkForUnknownOptionsInKeyValueTree() before calling this function to
91  * ensure that no such values are present.
92  *
93  * Does not currently work for option sections in an array.
94  *
95  * \ingroup module_options
96  */
97 KeyValueTreeObject adjustKeyValueTreeFromOptions(const KeyValueTreeObject& tree, const Options& options);
98
99 //! \endcond
100
101 } // namespace gmx
102
103 #endif