Add input file options that accept missing files
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / options / filenameoption.h
1 /*
2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3  *
4  * Copyright (c) 2012,2013,2014,2015, by the GROMACS development team, led by
5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
8  *
9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
12  * of the License, or (at your option) any later version.
13  *
14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
17  * Lesser General Public License for more details.
18  *
19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
20  * License along with GROMACS; if not, see
21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
23  *
24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
25  * consider that scientific software is very special. Version
26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
30  * official version at http://www.gromacs.org.
31  *
32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
34  */
35 /*! \file
36  * \brief
37  * Declares gmx::FileNameOption and gmx::FileNameOptionInfo.
38  *
39  * \author Teemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
40  * \inpublicapi
41  * \ingroup module_options
42  */
43 #ifndef GMX_OPTIONS_FILENAMEOPTION_H
44 #define GMX_OPTIONS_FILENAMEOPTION_H
45
46 #include <string>
47 #include <vector>
48
49 #include "gromacs/options/abstractoption.h"
50 #include "gromacs/options/optionfiletype.h"
51
52 namespace gmx
53 {
54
55 template <typename T> class ConstArrayRef;
56 class FileNameOptionInfo;
57 class FileNameOptionManager;
58 class FileNameOptionStorage;
59
60 /*! \brief
61  * Specifies an option that provides file names.
62  *
63  * Public methods in this class do not throw.
64  *
65  * \inpublicapi
66  * \ingroup module_options
67  */
68 class FileNameOption : public OptionTemplate<std::string, FileNameOption>
69 {
70     public:
71         //! OptionInfo subclass corresponding to this option type.
72         typedef FileNameOptionInfo InfoType;
73
74         //! Initializes an option with the given name.
75         explicit FileNameOption(const char *name)
76             : MyBase(name), optionType_(eftUnknown), legacyType_(-1),
77               defaultBasename_(NULL), defaultType_(-1),
78               bLegacyOptionalBehavior_(false),
79               bRead_(false), bWrite_(false), bLibrary_(false),
80               bAllowMissing_(false)
81         {
82         }
83
84         /*! \brief
85          * Sets the type of the file this option accepts.
86          *
87          * Either this attribute or legacyType() must be provided.
88          */
89         MyClass &filetype(OptionFileType type)
90         { optionType_ = type; return me(); }
91         /*! \brief
92          * Sets the type of the file from an enum in filenm.h.
93          *
94          * New code should prefer filetype(), extending the enumeration if
95          * necessary.
96          */
97         MyClass &legacyType(int type)
98         { legacyType_ = type; return me(); }
99         /*! \brief
100          * Changes the behavior of optional options to match old t_filenm.
101          *
102          * If this is not set, optional options return an empty string if not
103          * set.  If this is set, a non-empty value is always returned.
104          * In the latter case, whether the option is set only affects the
105          * return value of OptionInfo::isSet() and Options::isSet().
106          */
107         MyClass &legacyOptionalBehavior()
108         { bLegacyOptionalBehavior_ = true; return me(); }
109         //! Tells that the file provided by this option is used for input only.
110         MyClass &inputFile()
111         { bRead_ = true; bWrite_ = false; return me(); }
112         //! Tells that the file provided by this option is used for output only.
113         MyClass &outputFile()
114         { bRead_ = false; bWrite_ = true; return me(); }
115         /*! \brief
116          * Tells that the file provided by this option is used for input and
117          * output both.
118          */
119         MyClass &inputOutputFile()
120         { bRead_ = bWrite_ = true; return me(); }
121         /*! \brief
122          * Sets the read/write usage for this file from boolean flags.
123          */
124         MyClass &readWriteFlags(bool bRead, bool bWrite)
125         { bRead_ = bRead; bWrite_ = bWrite; return me(); }
126         /*! \brief
127          * Tells that the file will be looked up in library directories in
128          * addition to working directory.
129          *
130          * \todo
131          * Currently, this flag only affects the help output.  Callers must
132          * take care themselves to actually search the file in the library
133          * directories.  It would be nicer to do this searching within the
134          * file name option implementation.
135          */
136         MyClass &libraryFile(bool bLibrary = true)
137         { bLibrary_ = bLibrary; return me(); }
138         /*! \brief
139          * Tells that missing file names explicitly provided by the user are
140          * valid for this input option.
141          *
142          * If this method is not called, an error will be raised if the user
143          * explicitly provides a file name that does not name an existing file,
144          * or if the default value does not resolve to a valid file name for a
145          * required option that the user has not set.
146          *
147          * This method only has effect with input files, and only if a
148          * FileNameOptionManager is being used.
149          */
150         MyClass &allowMissing(bool bAllow = true)
151         { bAllowMissing_ = bAllow; return me(); }
152         /*! \brief
153          * Sets a default basename for the file option.
154          *
155          * Use this method instead of defaultValue() or defaultValueIfSet() to
156          * set a default value for a file name option.  No extension needs to
157          * be provided; it is automatically added based on filetype() or
158          * defaultType().
159          * The behavior is also adjusted based on required(): if the option is
160          * required, the value given to defaultBasename() is treated as for
161          * both defaultValue() and defaultValueIfSet(), otherwise it is treated
162          * as for defaultValueIfSet().
163          *
164          * For input files that accept multiple extensions, the extension is
165          * completed to the default extension on creation of the option or at
166          * time of parsing an option without a value.
167          *
168          * If FileNameOptionManager is used, the extension may change during
169          * Options::finish(), as this is the time when the default names are
170          * checked against the file system to provide an extension that matches
171          * an existing file if that is possible.
172          *
173          * If FileNameOptionManager is used, and
174          * FileNameOptionManager::addDefaultFileNameOption() is used, and the
175          * user provides a global default file name using that option, then the
176          * global default takes precedence over defaultBasename().
177          */
178         MyClass &defaultBasename(const char *basename)
179         { defaultBasename_ = basename; return me(); }
180         /*! \brief
181          * Sets a default type/extension for the file option.
182          *
183          * For options that accept multiple types of files (e.g.,
184          * eftTrajectory), this method sets the default extension used
185          * for completing defaultBasename(), as well as the default extension
186          * used by FileNameOptionManager to complete various file names.
187          *
188          * The value should be one of the enumerated `ef*` values from
189          * filenm.h, and be a valid type for the type specified with
190          * filetype().
191          */
192         MyClass &defaultType(int filetype)
193         { defaultType_ = filetype; return me(); }
194
195     private:
196         // Use defaultBasename() instead.
197         using MyBase::defaultValue;
198         using MyBase::defaultValueIfSet;
199
200         //! Creates a FileNameOptionStorage object.
201         virtual AbstractOptionStorage *createStorage(
202             const OptionManagerContainer &managers) const;
203
204         OptionFileType          optionType_;
205         int                     legacyType_;
206         const char             *defaultBasename_;
207         int                     defaultType_;
208         bool                    bLegacyOptionalBehavior_;
209         bool                    bRead_;
210         bool                    bWrite_;
211         bool                    bLibrary_;
212         bool                    bAllowMissing_;
213
214         /*! \brief
215          * Needed to initialize FileNameOptionStorage from this class without
216          * otherwise unnecessary accessors.
217          */
218         friend class FileNameOptionStorage;
219 };
220
221 /*! \brief
222  * Wrapper class for accessing file name option information.
223  *
224  * \inpublicapi
225  * \ingroup module_options
226  */
227 class FileNameOptionInfo : public OptionInfo
228 {
229     public:
230         //! Shorthand for a list of extensions.
231         typedef std::vector<const char *> ExtensionList;
232
233         //! Creates an option info object for the given option.
234         explicit FileNameOptionInfo(FileNameOptionStorage *option);
235
236         //! Whether the option specifies an input file.
237         bool isInputFile() const;
238         //! Whether the option specifies an output file.
239         bool isOutputFile() const;
240         //! Whether the option specifies a file used for both input and output.
241         bool isInputOutputFile() const;
242         /*! \brief
243          * Whether the option specifies a library file.
244          *
245          * \see FileNameOption::libraryFile()
246          */
247         bool isLibraryFile() const;
248         //! Whether the (input) option allows missing files to be provided.
249         bool allowMissing() const;
250
251         //! Whether the option specifies directories.
252         bool isDirectoryOption() const;
253         //! Whether the option specifies a generic trajectory file.
254         bool isTrajectoryOption() const;
255         //! Returns the default extension for this option.
256         const char *defaultExtension() const;
257         //! Returns the list of extensions this option accepts.
258         ExtensionList extensions() const;
259         //! Returns whether \p fileType (from filenm.h) is accepted for this option.
260         bool isValidType(int fileType) const;
261         //! Returns the list of file types this option accepts.
262         ConstArrayRef<int> fileTypes() const;
263
264     private:
265         const FileNameOptionStorage &option() const;
266 };
267
268 } // namespace gmx
269
270 #endif