src/gromacs/nbnxm/nbnxm_geometry.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2012,2013,2014,2015,2016,2017,2018,2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35
  36 #include "gmxpre.h"
  37
  38 #include "nbnxm_geometry.h"
  39
  40 #include "gromacs/nbnxm/nbnxm.h"
  41 #include "gromacs/nbnxm/pairlist.h"
  42 #include "gromacs/simd/simd.h"
  43 #include "gromacs/utility/fatalerror.h"
  44
  45 int nbnxn_kernel_to_cluster_i_size(int nb_kernel_type)
  46 {
  47     switch (nb_kernel_type)
  48     {
  49         case nbnxnk4x4_PlainC:
  50         case nbnxnk4xN_SIMD_4xN:
  51         case nbnxnk4xN_SIMD_2xNN:
  52             return c_nbnxnCpuIClusterSize;
  53         case nbnxnk8x8x8_GPU:
  54         case nbnxnk8x8x8_PlainC:
  55             /* The cluster size for super/sub lists is only set here.
  56              * Any value should work for the pair-search and atomdata code.
  57              * The kernels, of course, might require a particular value.
  58              */
  59             return c_nbnxnGpuClusterSize;
  60         default:
  61             gmx_incons("unknown kernel type");
  62     }
  63
  64     return 0;
  65 }
  66
  67 int nbnxn_kernel_to_cluster_j_size(int nb_kernel_type)
  68 {
  69     int nbnxn_simd_width = 0;
  70     int cj_size          = 0;
  71
  72 #if GMX_SIMD
  73     nbnxn_simd_width = GMX_SIMD_REAL_WIDTH;
  74 #endif
  75
  76     switch (nb_kernel_type)
  77     {
  78         case nbnxnk4x4_PlainC:
  79             cj_size = c_nbnxnCpuIClusterSize;
  80             break;
  81         case nbnxnk4xN_SIMD_4xN:
  82             cj_size = nbnxn_simd_width;
  83             break;
  84         case nbnxnk4xN_SIMD_2xNN:
  85             cj_size = nbnxn_simd_width/2;
  86             break;
  87         case nbnxnk8x8x8_GPU:
  88         case nbnxnk8x8x8_PlainC:
  89             cj_size = nbnxn_kernel_to_cluster_i_size(nb_kernel_type);
  90             break;
  91         default:
  92             gmx_incons("unknown kernel type");
  93     }
  94
  95     return cj_size;
  96 }