src/gromacs/nbnxm/constants.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2012,2013,2014,2015,2016,2018,2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35
  36 #ifndef GMX_NBNXN_CONSTANTS_H
  37 #define GMX_NBNXN_CONSTANTS_H
  38
  39 // Lower limit for square interaction distances in nonbonded kernels.
  40 // For smaller values we will overflow when calculating r^-1 or r^-12, but
  41 // to keep it simple we always apply the limit from the tougher r^-12 condition.
  42 #if GMX_DOUBLE
  43 // Some double precision SIMD architectures use single precision in the first
  44 // step, so although the double precision criterion would allow smaller rsq,
  45 // we need to stay in single precision with some margin for the N-R iterations.
  46 #    define NBNXN_MIN_RSQ 1.0e-36
  47 #else
  48 // The worst intermediate value we might evaluate is r^-12, which
  49 // means we should ensure r^2 stays above pow(GMX_FLOAT_MAX,-1.0/6.0)*1.01 (some margin)
  50 #    define NBNXN_MIN_RSQ 3.82e-07f // r > 6.2e-4
  51 #endif
  52
  53
  54 /* The number of clusters in a super-cluster, used for GPU */
  55 #define c_nbnxnGpuNumClusterPerSupercluster 8
  56
  57 /* With GPU kernels we group cluster pairs in 4 to optimize memory usage
  58  * of integers containing 32 bits.
  59  */
  60 #define c_nbnxnGpuJgroupSize (32 / c_nbnxnGpuNumClusterPerSupercluster)
  61
  62 #endif