src/gromacs/nbnxm/constants.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2012,2013,2014,2015,2016 by the GROMACS development team.
   5  * Copyright (c) 2018,2019,2020, by the GROMACS development team, led by
   6  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   7  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   8  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   9  *
  10  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  11  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  12  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  13  * of the License, or (at your option) any later version.
  14  *
  15  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  16  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  17  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  18  * Lesser General Public License for more details.
  19  *
  20  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  21  * License along with GROMACS; if not, see
  22  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  23  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  24  *
  25  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  26  * consider that scientific software is very special. Version
  27  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  28  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  29  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  30  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  31  * official version at http://www.gromacs.org.
  32  *
  33  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  34  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  35  */
  36
  37 /*! \internal \file
  38  *
  39  * \brief
  40  * Declares constants for the module
  41  *
  42  * \author Berk Hess <hess@kth.se>
  43  * \ingroup module_nbnxm
  44  */
  45
  46 #ifndef GMX_NBNXN_CONSTANTS_H
  47 #define GMX_NBNXN_CONSTANTS_H
  48
  49 /*! \brief Lower limit for square interaction distances in nonbonded kernels.
  50  *
  51  * For smaller values we will overflow when calculating r^-1 or r^-12, but
  52  * to keep it simple we always apply the limit from the tougher r^-12 condition.
  53  */
  54 #if GMX_DOUBLE
  55 // Some double precision SIMD architectures use single precision in the first
  56 // step, so although the double precision criterion would allow smaller rsq,
  57 // we need to stay in single precision with some margin for the N-R iterations.
  58 #    define NBNXN_MIN_RSQ 1.0e-36
  59 #else
  60 // The worst intermediate value we might evaluate is r^-12, which
  61 // means we should ensure r^2 stays above pow(GMX_FLOAT_MAX,-1.0/6.0)*1.01 (some margin)
  62 #    define NBNXN_MIN_RSQ 3.82e-07f // r > 6.2e-4
  63 #endif
  64
  65
  66 //! The number of clusters in a super-cluster, used for GPU
  67 #define c_nbnxnGpuNumClusterPerSupercluster 8
  68
  69 /*! \brief With GPU kernels we group cluster pairs in 4 to optimize memory usage
  70  * of integers containing 32 bits.
  71  */
  72 #define c_nbnxnGpuJgroupSize (32 / c_nbnxnGpuNumClusterPerSupercluster)
  73
  74 #endif