src/gromacs/modularsimulator/pmeloadbalancehelper.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief Declares the PME load balancing helper for the modular simulator
  37  *
  38  * \author Pascal Merz <pascal.merz@me.com>
  39  * \ingroup module_modularsimulator
  40  */
  41
  42 #include "gmxpre.h"
  43
  44 #include "pmeloadbalancehelper.h"
  45
  46 #include "gromacs/ewald/pme_load_balancing.h"
  47 #include "gromacs/mdtypes/commrec.h"
  48 #include "gromacs/mdtypes/forcerec.h"
  49 #include "gromacs/mdtypes/inputrec.h"
  50 #include "gromacs/mdtypes/mdrunoptions.h"
  51 #include "gromacs/mdtypes/state.h"
  52 #include "gromacs/nbnxm/nbnxm.h"
  53
  54 #include "statepropagatordata.h"
  55
  56 namespace gmx
  57 {
  58 bool PmeLoadBalanceHelper::doPmeLoadBalancing(const MdrunOptions& mdrunOptions,
  59                                               const t_inputrec*   inputrec,
  60                                               const t_forcerec*   fr)
  61 {
  62     return (mdrunOptions.tunePme && EEL_PME(fr->ic->eeltype) && !mdrunOptions.reproducible
  63             && inputrec->cutoff_scheme != ecutsGROUP);
  64 }
  65
  66 PmeLoadBalanceHelper::PmeLoadBalanceHelper(bool                 isVerbose,
  67                                            StatePropagatorData* statePropagatorData,
  68                                            FILE*                fplog,
  69                                            t_commrec*           cr,
  70                                            const MDLogger&      mdlog,
  71                                            const t_inputrec*    inputrec,
  72                                            gmx_wallcycle*       wcycle,
  73                                            t_forcerec*          fr) :
  74     pme_loadbal_(nullptr),
  75     nextNSStep_(-1),
  76     isVerbose_(isVerbose),
  77     bPMETunePrinting_(false),
  78     statePropagatorData_(statePropagatorData),
  79     fplog_(fplog),
  80     cr_(cr),
  81     mdlog_(mdlog),
  82     inputrec_(inputrec),
  83     wcycle_(wcycle),
  84     fr_(fr)
  85 {
  86 }
  87
  88 void PmeLoadBalanceHelper::setup()
  89 {
  90     auto box = statePropagatorData_->constBox();
  91     GMX_RELEASE_ASSERT(box[0][0] != 0 && box[1][1] != 0 && box[2][2] != 0,
  92                        "PmeLoadBalanceHelper cannot be initialized with zero box.");
  93     pme_loadbal_init(&pme_loadbal_, cr_, mdlog_, *inputrec_, box, *fr_->ic, *fr_->nbv, fr_->pmedata,
  94                      fr_->nbv->useGpu(), &bPMETunePrinting_);
  95 }
  96
  97 void PmeLoadBalanceHelper::run(gmx::Step step, gmx::Time gmx_unused time)
  98 {
  99     if (step != nextNSStep_ || step == inputrec_->init_step)
 100     {
 101         return;
 102     }
 103
 104     // PME grid + cut-off optimization with GPUs or PME nodes
 105     pme_loadbal_do(pme_loadbal_, cr_, (isVerbose_ && MASTER(cr_)) ? stderr : nullptr, fplog_,
 106                    mdlog_, *inputrec_, fr_, statePropagatorData_->constBox(),
 107                    statePropagatorData_->constPositionsView().paddedArrayRef(), wcycle_, step,
 108                    step - inputrec_->init_step, &bPMETunePrinting_);
 109 }
 110
 111 void PmeLoadBalanceHelper::teardown()
 112 {
 113     pme_loadbal_done(pme_loadbal_, fplog_, mdlog_, fr_->nbv->useGpu());
 114 }
 115
 116 bool PmeLoadBalanceHelper::pmePrinting()
 117 {
 118     return bPMETunePrinting_;
 119 }
 120
 121 const pme_load_balancing_t* PmeLoadBalanceHelper::loadBalancingObject()
 122 {
 123     return pme_loadbal_;
 124 }
 125
 126 SignallerCallbackPtr PmeLoadBalanceHelper::registerNSCallback()
 127 {
 128     return std::make_unique<SignallerCallback>(
 129             [this](Step step, Time gmx_unused time) { nextNSStep_ = step; });
 130 }
 131
 132 } // namespace gmx