src/gromacs/mdtypes/commrec.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2017,2018 by the GROMACS development team.
   7  * Copyright (c) 2019,2020, by the GROMACS development team, led by
   8  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   9  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
  10  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38 #ifndef GMX_MDTYPES_COMMREC_H
  39 #define GMX_MDTYPES_COMMREC_H
  40
  41 #include <stddef.h>
  42
  43 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  44 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
  45 #include "gromacs/utility/gmxmpi.h"
  46
  47 struct mpi_in_place_buf_t;
  48 struct gmx_domdec_t;
  49
  50 #define DUTY_PP (1U << 0U)
  51 #define DUTY_PME (1U << 1U)
  52
  53 typedef struct
  54 {
  55     int      bUse;
  56     MPI_Comm comm_intra;
  57     int      rank_intra;
  58     MPI_Comm comm_inter;
  59
  60 } gmx_nodecomm_t;
  61
  62 struct t_commrec
  63 {
  64     /* The nodeids in one sim are numbered sequentially from 0.
  65      * All communication within some simulation should happen
  66      * in mpi_comm_mysim, or its subset mpi_comm_mygroup.
  67      */
  68     int sim_nodeid, nnodes, npmenodes;
  69
  70     /* thread numbers: */
  71     /* Not used yet: int threadid, nthreads; */
  72     /* The nodeid in the PP/PME, PP or PME group */
  73     int nodeid;
  74
  75     /* MPI communicators within a single simulation
  76      * Note: other parts of the code may further subset these communicators.
  77      */
  78     MPI_Comm mpi_comm_mysim;   /* communicator including all ranks of
  79                                   a single simulation */
  80     MPI_Comm mpi_comm_mygroup; /* subset of mpi_comm_mysim including only
  81                                   the ranks in the same group (PP or PME) */
  82
  83     gmx_nodecomm_t nc;
  84
  85     /* For domain decomposition */
  86     gmx_domdec_t* dd;
  87
  88     /* The duties of this node, see the DUTY_ defines above.
  89      * This should be read through thisRankHasDuty() or getThisRankDuties().
  90      */
  91     int duty;
  92
  93     /* these buffers are used as destination buffers if MPI_IN_PLACE isn't
  94        supported.*/
  95     mpi_in_place_buf_t* mpb;
  96 };
  97
  98 /*! \brief
  99  * Returns the rank's duty, and asserts that it has been initialized.
 100  */
 101 inline int getThisRankDuties(const t_commrec* cr)
 102 {
 103     GMX_ASSERT(cr, "Invalid commrec pointer");
 104     GMX_ASSERT(cr->duty != 0, "Commrec duty was not initialized!");
 105     return cr->duty;
 106 }
 107
 108 /*! \brief
 109  * A convenience getter for the commrec duty assignment;
 110  * asserts that duty is actually valid (have been initialized).
 111  *
 112  * \param[in] cr    Communication structure pointer
 113  * \param[in] duty  A single duty's corresponding DUTY_ flag. Combinations are not supported.
 114  *
 115  * \returns Whether this duty is assigned to this rank.
 116  */
 117 inline bool thisRankHasDuty(const t_commrec* cr, int duty)
 118 {
 119     GMX_ASSERT((duty == DUTY_PME) || (duty == DUTY_PP), "Invalid duty type");
 120     return (getThisRankDuties(cr) & duty) != 0;
 121 }
 122
 123 /*! \brief True if this is a simulation with more than 1 rank
 124  *
 125  * In particular, this is true for multi-rank runs with TPI and NM, because
 126  * they use a decomposition that is not the domain decomposition used by
 127  * other simulation types. */
 128 #define PAR(cr) ((cr)->nnodes > 1)
 129
 130 //! True of this is the master node
 131 #define MASTER(cr) (((cr)->nodeid == 0) || !PAR(cr))
 132
 133 //! True if this is the particle-particle master
 134 #define SIMMASTER(cr) ((MASTER(cr) && thisRankHasDuty((cr), DUTY_PP)) || !PAR(cr))
 135
 136 //! The node id for this rank
 137 #define RANK(cr, nodeid) (nodeid)
 138
 139 //! The node id for the master
 140 #define MASTERRANK(cr) (0)
 141
 142 /*! \brief Do we decompose the work of this simulation?
 143  *
 144  * True if this simulation uses more than one PP rank, or if this simulation
 145  * uses at least one PME-only rank.
 146  *
 147  * PAR(cr) is true if this is true, but the converse does not apply (see docs
 148  * of PAR(cr)).
 149  *
 150  * This is true if havePPDomainDecomposition is true, but the converse does not
 151  * apply (see docs of havePpDomainDecomposition()).
 152  *
 153  * \todo As part of Redmine #2395, replace calls to this with
 154  * havePPDomainDecomposition or a call of some other/new function, as
 155  * appropriate to each case. Then eliminate this macro. */
 156 #define DOMAINDECOMP(cr) (((cr)->dd != nullptr) && PAR(cr))
 157
 158 /*! \brief Returns whether we have actual domain decomposition for the particle-particle interactions
 159  *
 160  * Will return false when we use 1 rank for PP and 1 for PME
 161  */
 162 static bool inline havePPDomainDecomposition(const t_commrec* cr)
 163 {
 164     /* NOTE: It would be better to use cr->dd->nnodes, but we do not want
 165      *       to pull in a dependency on domdec.h into this file.
 166      */
 167     GMX_ASSERT(cr != nullptr, "Invalid call of havePPDomainDecomposition before commrec is made");
 168     GMX_ASSERT(cr->npmenodes >= 0,
 169                "Invalid call of havePPDomainDecomposition before MPMD automated decomposition was "
 170                "chosen.");
 171     return (cr->dd != nullptr && cr->nnodes - cr->npmenodes > 1);
 172 }
 173
 174 #endif