src/gromacs/mdrun/simulationinpututility.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2020, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35
  36 #include "gmxpre.h"
  37
  38 #include "simulationinpututility.h"
  39
  40 #include "gromacs/fileio/checkpoint.h"
  41 #include "gromacs/fileio/tpxio.h"
  42 #include "gromacs/mdtypes/inputrec.h"
  43 #include "gromacs/mdtypes/observableshistory.h"
  44 #include "gromacs/mdtypes/state.h"
  45
  46 #include "simulationinput_impl.h"
  47
  48 namespace gmx
  49 {
  50
  51 void applyGlobalSimulationState(const SimulationInput&      simulationInput,
  52                                 PartialDeserializedTprFile* partialDeserializedTpr,
  53                                 t_state*                    globalState,
  54                                 t_inputrec*                 inputRecord,
  55                                 gmx_mtop_t*                 molecularTopology)
  56 {
  57     *partialDeserializedTpr = read_tpx_state(simulationInput.tprFilename_.c_str(), inputRecord,
  58                                              globalState, molecularTopology);
  59 }
  60
  61 void applyLocalState(const SimulationInput&         simulationInput,
  62                      t_fileio*                      logfio,
  63                      const t_commrec*               cr,
  64                      int*                           dd_nc,
  65                      t_inputrec*                    inputRecord,
  66                      t_state*                       state,
  67                      ObservablesHistory*            observablesHistory,
  68                      bool                           reproducibilityRequested,
  69                      const MdModulesNotifier&       mdModulesNotifier,
  70                      gmx::ReadCheckpointDataHolder* modularSimulatorCheckpointData,
  71                      const bool                     useModularSimulator)
  72 {
  73     load_checkpoint(simulationInput.cpiFilename_.c_str(), logfio, cr, dd_nc, inputRecord, state,
  74                     observablesHistory, reproducibilityRequested, mdModulesNotifier,
  75                     modularSimulatorCheckpointData, useModularSimulator);
  76 }
  77
  78 } // end namespace gmx