src/gromacs/mdlib/tests/settletestrunners.cu

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2018,2019,2020,2021, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief Defines the runner for CUDA version of SETTLE.
  37  *
  38  * \author Artem Zhmurov <zhmurov@gmail.com>
  39  * \ingroup module_mdlib
  40  */
  41 #include "gmxpre.h"
  42
  43 #include "settletestrunners.h"
  44
  45 #include "config.h"
  46
  47 #include <assert.h>
  48
  49 #include <cmath>
  50
  51 #include <algorithm>
  52 #include <vector>
  53
  54 #include "gromacs/gpu_utils/devicebuffer.cuh"
  55 #include "gromacs/gpu_utils/gputraits.h"
  56 #include "gromacs/hardware/device_information.h"
  57 #include "gromacs/mdlib/settle_gpu.cuh"
  58 #include "gromacs/utility/unique_cptr.h"
  59
  60 #include "testutils/test_device.h"
  61
  62 namespace gmx
  63 {
  64 namespace test
  65 {
  66
  67 void SettleDeviceTestRunner::applySettle(SettleTestData* testData,
  68                                          const t_pbc     pbc,
  69                                          const bool      updateVelocities,
  70                                          const bool      calcVirial,
  71                                          const std::string& /* testDescription */)
  72 {
  73     // These should never fail since this function should only be called if CUDA is enabled and
  74     // there is a CUDA-capable device available.
  75     GMX_RELEASE_ASSERT(GMX_GPU_CUDA, "CUDA version of SETTLE was called from non-CUDA build.");
  76
  77     const DeviceContext& deviceContext = testDevice_.deviceContext();
  78     const DeviceStream&  deviceStream  = testDevice_.deviceStream();
  79     setActiveDevice(testDevice_.deviceInfo());
  80
  81     auto settleGpu = std::make_unique<SettleGpu>(testData->mtop_, deviceContext, deviceStream);
  82
  83     settleGpu->set(*testData->idef_);
  84     PbcAiuc pbcAiuc;
  85     setPbcAiuc(pbc.ndim_ePBC, pbc.box, &pbcAiuc);
  86
  87     int numAtoms = testData->numAtoms_;
  88
  89     DeviceBuffer<Float3> d_x, d_xp, d_v;
  90
  91     Float3* h_x  = gmx::asGenericFloat3Pointer(testData->x_);
  92     Float3* h_xp = gmx::asGenericFloat3Pointer(testData->xPrime_);
  93     Float3* h_v  = gmx::asGenericFloat3Pointer(testData->v_);
  94
  95     allocateDeviceBuffer(&d_x, numAtoms, deviceContext);
  96     allocateDeviceBuffer(&d_xp, numAtoms, deviceContext);
  97     allocateDeviceBuffer(&d_v, numAtoms, deviceContext);
  98
  99     copyToDeviceBuffer(&d_x, h_x, 0, numAtoms, deviceStream, GpuApiCallBehavior::Sync, nullptr);
 100     copyToDeviceBuffer(&d_xp, h_xp, 0, numAtoms, deviceStream, GpuApiCallBehavior::Sync, nullptr);
 101     if (updateVelocities)
 102     {
 103         copyToDeviceBuffer(&d_v, h_v, 0, numAtoms, deviceStream, GpuApiCallBehavior::Sync, nullptr);
 104     }
 105     settleGpu->apply(
 106             d_x, d_xp, updateVelocities, d_v, testData->reciprocalTimeStep_, calcVirial, testData->virial_, pbcAiuc);
 107
 108     copyFromDeviceBuffer(h_xp, &d_xp, 0, numAtoms, deviceStream, GpuApiCallBehavior::Sync, nullptr);
 109     if (updateVelocities)
 110     {
 111         copyFromDeviceBuffer(h_v, &d_v, 0, numAtoms, deviceStream, GpuApiCallBehavior::Sync, nullptr);
 112     }
 113
 114     freeDeviceBuffer(&d_x);
 115     freeDeviceBuffer(&d_xp);
 116     freeDeviceBuffer(&d_v);
 117 }
 118
 119 } // namespace test
 120 } // namespace gmx